| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,362,127 | A→G | T6A (ACA→GCA) | yhcA → | putative fimbrial chaperone YhcA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,362,127 | 0 | A | G | 98.3% | 411.8 / ‑4.6 | 119 | T6A (ACA→GCA) | yhcA | putative fimbrial chaperone YhcA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base G (59/57); total (59/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CTCGGACAGATTATGCCCTATGACATGGTCTGTCTTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATC > NC_000913/3361990‑3362256 | cTCGGACAGATTATGCCCTATGACATGGTCTGTCTTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACacattgca > 1:543662/1‑140 (MQ=255) tCGGACAGATTATGCCCTATGACATGGTCTGTCTTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACacattgcat < 1:244614/140‑1 (MQ=255) cGGACAGATTATGCCCTATGACTTGGTCTGTCTTACTCATTCTCATCGTAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACacattgcatt < 2:321491/140‑1 (MQ=255) cGGACAGATTATGCCCTATGACATGGTCTGTCTTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACacattgcatt < 1:830486/140‑1 (MQ=255) cGGACAGATTATGCCCTATGACATGGTCTGTCTTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACacattgcatt < 2:699575/140‑1 (MQ=255) cGGACAGATTATGCCCTATGACATGATCTATCTTAATGAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACacattgcatt < 1:435460/140‑1 (MQ=255) gACAGATTATGCCCTATGACATGGTCTGTCTTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCa < 1:933625/140‑1 (MQ=255) cAGATTATGCCCTATGAGATGGACTGTCTTAATCACTCTAATCGCAAAAAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACt < 2:338338/140‑1 (MQ=255) aTTATGCCCTATGACATGGTCTGTCTTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATGATTACAGGGGTTGTAAGTTAAATGCACAGAGACATTGCATTCACTGTa > 2:283951/1‑140 (MQ=255) ccTATGACATGGTCTGTCTTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATaa < 2:191511/140‑1 (MQ=255) cTATGACATGGTCTGTCTTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATaac < 2:549972/140‑1 (MQ=255) aTGACATGGTCTGTCTTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATaacaa > 1:1964/1‑140 (MQ=255) gACATGGTCTGTCTTAATCAATTTCATCGCAAACATTGCATAACATATTTTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAacaaca < 2:388046/140‑1 (MQ=255) gACATGGTCTGTCTTAAGCAATTTCATCGCAGACAGTGCCTAACATATGTTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAacaaca < 2:319564/140‑1 (MQ=255) aTGGTCTGTCTTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCa < 1:934664/140‑1 (MQ=255) tctgtctTAATCAATCTTATCGAAAACAGTGTATAACATATATTAACACTATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGa < 2:257688/140‑1 (MQ=255) tctgtctTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGa > 1:880423/1‑140 (MQ=255) tctgtctTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTAAAATGCTCAGACGCATTGCATTCACCGTATTTATAACAACATCAATGa > 2:376430/1‑140 (MQ=255) tgtctTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACAt > 1:91063/1‑132 (MQ=255) tgtctTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAAt > 2:941197/1‑140 (MQ=255) tgtctTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAAt > 2:771069/1‑140 (MQ=255) tctTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATGGCAGTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATAc > 2:444812/1‑140 (MQ=255) atcaatcTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAg > 1:995124/1‑140 (MQ=255) aatcTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCca < 1:555101/140‑1 (MQ=255) tctcATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCcaca > 2:512024/1‑140 (MQ=255) tctcATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCcaca > 2:762278/1‑140 (MQ=255) tctcATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCcaca > 2:925370/1‑140 (MQ=255) tctcATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCcaca > 1:1004898/1‑140 (MQ=255) tctcATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCcaca > 1:198407/1‑140 (MQ=255) tcATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTTTATTTATTACAGCATCAATGAATACCTTAGCCACAgg > 1:338226/1‑140 (MQ=255) aTCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGa > 2:956125/1‑140 (MQ=255) aTCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGa < 1:956125/140‑1 (MQ=255) aTCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGa > 1:959306/1‑140 (MQ=255) aTCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGa > 1:998278/1‑140 (MQ=255) aTCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGa > 1:807511/1‑140 (MQ=255) aTCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGa > 2:590621/1‑140 (MQ=255) aaCAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAAGAACATCAATGAATACCTAAGCCACAGGGATGGTTc > 2:463588/1‑140 (MQ=255) gTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGa < 2:543662/140‑1 (MQ=255) gTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGCATTTATAATAACATCAGTGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGa > 2:404816/1‑140 (MQ=255) tGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGaa > 1:735202/1‑140 (MQ=255) gacagcATATATTAAGAATATGTTTATGCGTTATTTAACATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAAc < 1:426575/135‑1 (MQ=255) atatTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAAAACCTTAGGCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTAt > 1:499596/1‑140 (MQ=255) tAACAATATGTTTCTTCGTTATCTATCATAATTACAGTAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCt < 1:283951/140‑1 (MQ=255) aaCAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCCATGAATACGTTAACCAGAGGGATGGGTCCTGAAACATCAGTATTGCTg > 2:300453/1‑140 (MQ=255) gcAATATGTTTCTGCGTTATTTGTCATTATTTCAGAAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTgg < 2:442603/139‑1 (MQ=255) aCAATATGTTTCTGCGTTATTTCTCATTATTACAGGAATTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTgg < 1:339587/140‑1 (MQ=255) cAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGt > 2:531817/1‑140 (MQ=255) cAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGt < 2:6760/140‑1 (MQ=255) cAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAAAGAATACCTGAGCAAAAGGGATGGTTACTGAGACATCAGTCTTGCTGGt > 2:493475/1‑140 (MQ=255) aaTATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTGGCCACAGGGATGGTTCGTGAATCATCAGTATTGcctgtc > 2:426575/1‑135 (MQ=255) aaTATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGtt > 1:671687/1‑140 (MQ=255) tatGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCCCAGGGATCGTTGCTAAAACATAAGTATTGCTGGTtga > 1:493900/1‑140 (MQ=255) tatGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTtga > 1:629520/1‑140 (MQ=255) atGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTtgat > 1:401125/1‑140 (MQ=255) tGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTgg < 2:775866/134‑1 (MQ=255) tttCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACTTTAGCCACAGGGGTGGCTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGaa > 2:377184/1‑140 (MQ=255) ttCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGaaa > 2:868050/1‑140 (MQ=255) tCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGaaaa > 1:1011088/1‑140 (MQ=255) tGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACTTCCGTATTGCTGGTTGATGAAAAGc > 1:442603/1‑140 (MQ=255) tGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGc > 2:239621/1‑140 (MQ=255) tGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGc < 2:401125/140‑1 (MQ=255) ttatttatCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAg > 1:1003063/1‑135 (MQ=255) tatttatCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCgtggt < 2:880423/140‑1 (MQ=255) tatttatCATTATTAAAGGAGTCTTTATTGAAATGCTGAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCgtggt < 1:323662/140‑1 (MQ=255) atttatCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGGAACATCAGTATTCCTGGCTGATGAAAAGCgtggtg > 2:461062/1‑140 (MQ=255) tatCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAg < 2:1964/140‑1 (MQ=255) tatCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAg < 1:788978/140‑1 (MQ=255) tattaCAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGta > 2:793334/1‑140 (MQ=255) ttaCAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtatt > 1:586426/1‑140 (MQ=255) ttaCAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtatt > 2:746526/1‑140 (MQ=255) taCAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtatta < 1:931510/140‑1 (MQ=255) ggAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaatat > 1:751340/1‑140 (MQ=255) gAGTTTTAATTTAAATGCTCAGCCACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaatatt < 1:444414/140‑1 (MQ=255) gAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaatatt < 1:590621/140‑1 (MQ=255) gAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaatatt < 1:868050/140‑1 (MQ=255) gAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACAAATTTCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaatatt < 1:395527/140‑1 (MQ=255) aGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGTCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaatatta < 2:90086/140‑1 (MQ=255) gTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCt < 2:696374/126‑1 (MQ=255) gTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaatattaa < 2:925694/140‑1 (MQ=255) gTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaatatt < 1:31604/138‑1 (MQ=255) gTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtattaatatt > 2:31604/1‑138 (MQ=255) tttaatttaaATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGa < 1:531817/140‑1 (MQ=255) ttaatttaaATGCTCCGACACAATGCATTCACTGTATATATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGaa < 1:448456/140‑1 (MQ=255) ttaatttaaATGCTCAGACACATTGGATTCACTGTATGTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGaa < 1:493475/140‑1 (MQ=255) ttaatttaaATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGaa < 1:771069/140‑1 (MQ=255) ttaatttaaATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGaa > 1:795580/1‑140 (MQ=255) ttaatttaaATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGaa > 1:169472/1‑140 (MQ=255) taatttaaATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtatta < 1:743478/129‑1 (MQ=255) taatttaaATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGtatta > 2:743478/1‑129 (MQ=255) aatttaaATGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATa < 2:1011088/140‑1 (MQ=255) aaaTGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAgat < 1:512024/140‑1 (MQ=255) aaaTGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAgat < 1:793334/140‑1 (MQ=255) aaTGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAgatg > 1:192221/1‑140 (MQ=255) aaTGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAgatg > 1:926039/1‑140 (MQ=255) aTGCTCAGACACATTGCATTCAGTGTATTTAGAACTACACCAATGAATGCCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAgatga < 2:327765/140‑1 (MQ=255) aTGCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAgatga < 2:892997/140‑1 (MQ=255) gCTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGatc < 2:1004898/140‑1 (MQ=255) cTCAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGatca < 2:586426/140‑1 (MQ=255) cTCAGACACATTGCACTCACTGCATTTATAACAACATTAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGatca < 1:300453/140‑1 (MQ=255) cAGACACATTGCATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGatcatc < 2:629520/140‑1 (MQ=255) | CTCGGACAGATTATGCCCTATGACATGGTCTGTCTTAATCAATCTCATCGCAAACAGTGCATAACATATATTAACAATATGTTTCTGCGTTATTTATCATTATTACAGGAGTTTTAATTTAAATGCTCAGACACATTACATTCACTGTATTTATAACAACATCAATGAATACCTTAGCCACAGGGATGGTTCCTGAAACATCAGTATTGCTGGTTGATGAAAAGCGTGGTGAAGCTAGTATTAATATTAAGAATACAGATGATCATC > NC_000913/3361990‑3362256 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |