| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,330,680 | A→G | D60G (GAC→GGC) | proP → | osmolyte:H(+) symporter ProP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,330,680 | 0 | A | G | 98.9% | 306.8 / NA | 88 | D60G (GAC→GGC) | proP | osmolyte:H(+) symporter ProP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (47/40); minor base T (0/1); total (47/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTCACCATTATTGATGACGGTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGA > NC_000913/4330544‑4330814 | gTCACCATTATTGATGACGGTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGccc > 1:686099/1‑140 (MQ=255) aCCATTATTGATGACGGTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAg < 2:183035/140‑1 (MQ=255) aCCATTATTGATGACGGTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAg > 2:179093/1‑140 (MQ=255) aCCATTATTGATGACGGTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCCGGGGCTGGCCCCAg < 2:73294/140‑1 (MQ=255) ttattGATGACGGTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTg < 2:132624/140‑1 (MQ=255) ttGATGACGGTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAg > 1:11218/1‑140 (MQ=255) tgatgaCGGTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCTTGCAGa > 1:30872/1‑140 (MQ=255) tgatgaCGGTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGa > 2:631904/1‑140 (MQ=255) gatgaCGGTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGAt > 2:43439/1‑140 (MQ=255) atgaCGGTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATg > 2:989462/1‑140 (MQ=255) atgaCGGTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGAAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGAGCAGATg > 1:657937/1‑140 (MQ=255) tgaCGGTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATgg > 1:787647/1‑140 (MQ=255) ggTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTtgc > 2:865993/1‑140 (MQ=255) ggTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTtgc > 1:760897/1‑140 (MQ=255) ggTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATGAGGTAAAGATTTTTTCGGGGGGGCTGGCCCGGGCGTGCAGATGGTtgc > 2:495965/1‑140 (MQ=255) aCTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCAc < 2:11218/140‑1 (MQ=255) tGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACtt < 1:631904/140‑1 (MQ=255) cGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGc > 2:657602/1‑140 (MQ=255) cGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGc < 2:118261/140‑1 (MQ=255) cGTAAAGCCATTACAGCAGCATCACTGGGTTATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGc > 2:626569/1‑140 (MQ=255) aaaGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCAc > 2:146563/1‑140 (MQ=255) aaaGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCAAGCGTGGAGATGGTTGCTGCACTTGCCAc > 1:271410/1‑140 (MQ=255) aaaGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGCCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGGTGCTGCACTTGCCAc > 1:447666/1‑140 (MQ=255) aaGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACt < 1:504729/140‑1 (MQ=255) aGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACtt < 2:128479/140‑1 (MQ=255) aGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACtt > 2:254282/1‑140 (MQ=255) aGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACtt > 1:109849/1‑140 (MQ=255) ttACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTcc > 1:819101/1‑140 (MQ=255) ttACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCAGGGGCTGGCCCCCGCGGGCAGATGGGTGCTGCACTTGCCACTTTCTcc > 2:281350/1‑140 (MQ=255) cGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTc < 2:686099/140‑1 (MQ=255) gcagcaTCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTcc < 2:704121/140‑1 (MQ=255) gcaTCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCtt < 2:759655/140‑1 (MQ=255) gcaTCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCtt > 2:888007/1‑140 (MQ=255) cTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGAt > 1:900719/1‑140 (MQ=255) tGCAATGGAATGGTTCGGTTTTCGTGTTTATGGTTTTGTGGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGc < 2:353042/140‑1 (MQ=255) tGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTTTCGGTTCCCATTCTGATTCGACCGc > 1:353042/1‑140 (MQ=255) tGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGc > 1:616464/1‑140 (MQ=255) ggCAATGGAATGGTTAGATTTTTGTATTTTTGGTTTTATTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGc < 1:346370/139‑1 (MQ=255) tggaatggTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGc > 2:516740/1‑140 (MQ=255) tggaatggTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGc > 1:96566/1‑140 (MQ=255) tggaatggTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGc > 1:127052/1‑140 (MQ=255) ggaatggTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCg > 1:999368/1‑140 (MQ=255) gaatggTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGGTGCACTTGTCACCTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCgg > 2:267564/1‑140 (MQ=255) gaatggTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGGTGCACTTGGCACGTTCGCCGTTCCCGTTCTTATTCGACCGCTTGGCgg > 2:284189/1‑140 (MQ=255) gaatggTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCgg > 1:734737/1‑140 (MQ=255) gaatggTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCgg < 2:900719/140‑1 (MQ=255) aatggTTCGATTTTGGTGTTTAGGGCTTTGTTGCTTATGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGa < 1:396178/140‑1 (MQ=255) tggTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGTACTTGCCACTTTGTCCGCTCCCTTTGTGATGAGACCGCTAGGCGGAct > 2:469162/1‑140 (MQ=255) tggTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGAct < 1:179093/140‑1 (MQ=255) tggTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGAct < 2:366823/140‑1 (MQ=255) tggTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGAct < 1:146563/140‑1 (MQ=255) ggTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGActc < 1:989462/140‑1 (MQ=255) ggTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACCTTCTCAGTACCCTTTCTGATTCGACCGCTTTGCGGActc > 2:486948/1‑140 (MQ=255) gTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCATTTGCCACTTTCTGCGTTCCCTTTCTTATTCGACCGCTTGGCGGActcc > 2:346370/1‑139 (MQ=255) ttCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACtctt < 2:508352/140‑1 (MQ=255) ttCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACtctt < 1:254282/140‑1 (MQ=255) ttCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACtctt < 2:127052/140‑1 (MQ=255) ttCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGTGGGActctg < 2:657937/140‑2 (MQ=255) cGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACtcttct < 2:734737/140‑1 (MQ=255) aTTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCttt > 2:153723/1‑140 (MQ=255) ttttGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTg > 2:854095/1‑140 (MQ=255) ggTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTAt > 1:939799/1‑140 (MQ=255) gtgtTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACTGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATg > 1:412520/1‑140 (MQ=255) gtgtTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATg > 2:93649/1‑140 (MQ=255) tATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTggg > 2:663642/1‑140 (MQ=255) aTGGTTTTGTTGCTTTCGCATTTGGCAAATTTTTTTTGCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGc < 1:359338/140‑1 (MQ=255) tgttgCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTGTGATTCGAGCGCATGGGGGACTCTTGTTTGGTATGTTGGGCGATAAat > 2:283952/1‑140 (MQ=255) tgttgCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTATTGTTTGGTGTGTTGGGCGATAAat > 1:259941/1‑140 (MQ=255) gttgCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAata < 2:819101/140‑1 (MQ=255) tACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCg > 2:70578/1‑140 (MQ=255) cATTAGGTAAAGTTTATTTCCCAGGTGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCag < 1:469162/140‑1 (MQ=255) aTTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCaga > 2:149165/1‑140 (MQ=255) ttAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCagaa < 1:70578/140‑1 (MQ=255) aGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCagaaga > 2:49093/1‑140 (MQ=255) aGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCagaaga > 2:379436/1‑140 (MQ=255) gTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATc < 2:760897/140‑1 (MQ=255) aaaGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCt < 1:149165/140‑1 (MQ=255) aaaGTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCt < 1:43439/140‑1 (MQ=255) gTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGc < 2:616464/140‑1 (MQ=255) gTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGc < 1:657602/140‑1 (MQ=255) gTTTTTTTCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGc < 1:132483/140‑1 (MQ=255) ttttttCCCGGGGGCTTTCCCCGGCGTGCAGTTGGGTGCGGCACTTGCTACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTa < 2:447666/140‑1 (MQ=255) tttttCCCGGGGGCTTGCCCCATCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTAt < 1:495965/140‑1 (MQ=255) tttttCCCGGGGGCTGGCCCCAGCTTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTAt < 2:30872/140‑1 (MQ=255) tttttCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTAt < 2:887664/140‑1 (MQ=255) tttttCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTAt < 1:663642/140‑1 (MQ=255) tttttCCCGGGGGCTGGCCCCACCGTGCACATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTAt < 1:284189/140‑1 (MQ=255) ttttCCCGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGCTAAATATGGTCGCTAGAAGATCCTCGCTATc > 2:314582/1‑140 (MQ=255) ccGGGGGCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTAt < 1:888007/140‑1 (MQ=255) ggCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGa < 1:626569/140‑1 (MQ=255) ggCTGGCCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGa < 2:96566/140‑1 (MQ=255) | GTCACCATTATTGATGACGGTAAACTGCGTAAAGCCATTACCGCAGCATCACTGGGTAATGCAATGGAATGGTTCGATTTTGGTGTTTATGGTTTTGTTGCTTACGCATTAGGTAAAGTTTTTTTCCCGGGGGCTGACCCCAGCGTGCAGATGGTTGCTGCACTTGCCACTTTCTCCGTTCCCTTTCTGATTCGACCGCTTGGCGGACTCTTCTTTGGTATGTTGGGCGATAAATATGGTCGCCAGAAGATCCTCGCTATCACTATTGTGA > NC_000913/4330544‑4330814 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |