Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,515,070 | G→A | D536D (GAC→GAT) | fecA ← | ferric citrate outer membrane transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,515,070 | 0 | G | A | 98.5% | 219.1 / NA | 65 | D536D (GAC→GAT) | fecA | ferric citrate outer membrane transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (30/34); total (31/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGTCGTCGTAGCGGGTACCGAGTTCCCAGGTTCGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTGTCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGC > NC_000913/4514934‑4515206 | cgtcgtcgtAGCGGGTACCGAGTTCCCAGGTTCGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGGACGGTGCCAAACAAGCGTTCAGTGTATGCATAAAGATTCCAGCTatca > 2:288737/1‑140 (MQ=255) gtcgtcgtAGCGGGTACCGAGTTCCCAGGTTCGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTatcag < 2:238873/140‑1 (MQ=255) gtcgtcgtAGCGGGTACCGAGTTCCCAGGTTCGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTatcag < 2:182675/140‑1 (MQ=255) ctcgtcgtAGCGGGTACCGAGTTCCCAGGTTCGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTatcag < 2:1002639/139‑1 (MQ=255) cgtcgtAGCGGGTACCGAGTTCCCAGGTTCGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTatcagtc < 2:880571/140‑1 (MQ=255) cgtcgtAGCGGGTACCGAGTTCCCAGGTTCGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTatcagtc < 2:518834/140‑1 (MQ=255) tcgtAGCGGGTACCGAGTTCCCAGGTTCGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTAtcagtcag < 1:25232/140‑1 (MQ=255) cgtAGCGGGTACCGAGTTCCCAGGTTCGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAG‑TTCCAGCTATCAGTCAGGt < 2:149046/140‑1 (MQ=255) caggggTACCGAGTTCCCAGGTACGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGa < 1:465730/137‑1 (MQ=255) aGCGGGTACCGAGTTCCCAGGTTCGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCGGGTGa < 2:800120/140‑1 (MQ=255) aGCGGGTACCGAGTTCCCAGGTTCGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGa < 1:130361/140‑1 (MQ=255) tACCGAGTTCCCAGGTTCGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGc > 2:963880/1‑140 (MQ=255) tCCCAGGTTCGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATCAAGCTTCCAGCTATCAATCAGGCGATAGAGCACGTTctg > 2:465730/1‑138 (MQ=255) cgcgCTTTTTCCGGTTGAACATGGCCGCTTGTCACCGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAg < 2:491566/140‑1 (MQ=255) cgcgCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATGAAGATTCCAGCTGTCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAg > 2:313294/1‑140 (MQ=255) cgcgCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAg < 2:970336/140‑1 (MQ=255) cgcgCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAg > 1:226526/1‑140 (MQ=255) cgcgCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAATCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAg > 2:379354/1‑140 (MQ=255) cgcTTTTTCCGGTTCCACATTGTCGCTTTCCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCg < 1:274781/140‑1 (MQ=255) cgcTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAg > 2:146932/1‑138 (MQ=255) cgcTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAg < 1:146932/138‑1 (MQ=255) gcTTTTTCCGGTTCACCATTGCCGCGTTGTACAGCCTAGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCgg < 1:288737/140‑1 (MQ=255) tttttCCGGTTCAACATCGCCGCTTTGCACATCCTCGCCTATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTg < 2:295355/140‑1 (MQ=255) gTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCg < 2:722336/129‑1 (MQ=255) gTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCg > 1:722336/1‑129 (MQ=255) ccGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACttcttc > 2:780021/1‑140 (MQ=255) tttGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTcgtgc < 1:379354/140‑1 (MQ=255) ttGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTcgtgcg > 1:6439/1‑140 (MQ=255) cAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCg < 1:963880/140‑1 (MQ=255) cAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCg < 2:503780/140‑1 (MQ=255) cAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCg < 2:968956/140‑1 (MQ=255) cAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCg < 2:226526/140‑1 (MQ=255) cAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCATCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCg < 1:633879/140‑1 (MQ=255) cAATCTGGCTGTACTGCTCGGTGCCGAACGTCCCTTCAGTGTTTGCATGAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCg < 2:483730/140‑1 (MQ=255) tGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGGTAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCgttgtt < 2:917483/140‑1 (MQ=255) tGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCgttgtt < 2:987300/140‑1 (MQ=255) ggCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTc < 1:905699/140‑1 (MQ=255) gCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCt > 1:232628/1‑140 (MQ=255) gtactgtacGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCTCTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGt < 2:660970/140‑1 (MQ=255) acGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTc > 1:606500/1‑140 (MQ=255) acGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTc > 1:70700/1‑140 (MQ=255) acGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTc > 2:69149/1‑140 (MQ=255) gTGCCGAACGAGCCTCCAGTGTTTGTATATAGATTCCCGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGat < 1:288960/140‑1 (MQ=255) tGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTTTGATGGTGTTGTTATGGTATGACTCGata > 1:452015/1‑140 (MQ=255) tGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGTGTTGTTCTGGTATGACTCGata > 1:306544/1‑140 (MQ=255) tGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGGGTTGTTCTGGTATGACTCGata > 1:336989/1‑140 (MQ=255) tGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGata > 1:74730/1‑140 (MQ=255) tGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGata > 1:537471/1‑140 (MQ=255) tGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGata > 2:940683/1‑140 (MQ=255) tGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGa < 2:189663/138‑1 (MQ=255) tGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGa > 1:189663/1‑138 (MQ=255) gCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGatat < 2:10575/140‑1 (MQ=255) ccGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATg > 1:903707/1‑140 (MQ=255) cGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAG‑ACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGtt > 2:870560/1‑140 (MQ=255) aaCGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTc > 2:55893/1‑140 (MQ=255) aaCGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTc > 2:161081/1‑140 (MQ=255) aaCGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTc > 2:834349/1‑140 (MQ=255) aCGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAG‑ACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGa < 1:870560/140‑1 (MQ=255) cGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGa < 2:777617/140‑1 (MQ=255) gCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACt > 2:1020165/1‑125 (MQ=255) gCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACt < 1:1020165/125‑1 (MQ=255) cAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATa < 2:70700/140‑1 (MQ=255) gtgtTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATAcc < 2:795328/140‑1 (MQ=255) tgtTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCATGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATa > 1:579148/1‑137 (MQ=255) tgtTTGCATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCATGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATa < 2:579148/137‑1 (MQ=255) cATAAAGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTg > 1:776773/1‑140 (MQ=255) tAAAGATTCCAGCTATCGGTCAGGTGATAGAGCACGTTCGACGCCGGAGGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGAt < 2:306544/140‑1 (MQ=255) aaGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATgg > 1:598442/1‑140 (MQ=255) aaGATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGGTGTTCTGGGATGGCTCGATATGTTCAAAACTCATACCCGGCGTGATgg > 2:323206/1‑140 (MQ=255) gATTCCAGCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTc < 2:776773/140‑1 (MQ=255) gCTATCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGc > 2:636670/1‑140 (MQ=255) | CGTCGTCGTAGCGGGTACCGAGTTCCCAGGTTCGCGCTTTTTCCGGTTCAACATTGCCGCTTTGCACAGCCTTGCCAATCTGGCTGTACTGTACGGTGCCGAACGAGCCTTCAGTGTTTGCATAAAGATTCCAGCTGTCAGTCAGGTGATAGAGCACGTTCAACGCCGGAAGCGGTGCGTTATAGCTCACTTCTTCGTGCGTGCCTGTGATGGCGTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGC > NC_000913/4514934‑4515206 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |