| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,299,683 | (T)5→4 | coding (578/696 nt) | napG ← | ferredoxin‑type protein NapG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,299,679 | 0 | T | . | 98.9% | 370.4 / ‑2.0 | 90 | coding (582/696 nt) | napG | ferredoxin‑type protein NapG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base . (46/43); total (47/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
CAGCGCCTCGCGCCCGGCGTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATACTTTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGCATTCGCGATAACAA > NC_000913/2299540‑2299814 | cAGCGCCTCGCGCCCGGCGTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTACCACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATACt > 1:351919/1‑140 (MQ=255) cgcCTCGCGCCCGGCGTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATACtttt > 2:1876462/1‑140 (MQ=255) cgcCTCGCGCCCGGCGTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGCAACGCATTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGTATACtttt > 2:1210465/1‑140 (MQ=255) cgcCTCGCGCCCGGCGTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGAGACAGCGGTAACTCTTGTATTGCCGGTTGTCCCAGCACGGATACtttt > 2:1218191/1‑140 (MQ=255) gcCTCGCGCCCGGCGCCACGTTTACGATTAGCCATTGGTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACCCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATACttttc < 1:742863/140‑2 (MQ=255) ccTCGCGCCCGGCGTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATACttttcg > 2:2418855/1‑138 (MQ=255) cgcCCGGCGTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACtt < 2:1539588/140‑1 (MQ=255) ccGGCGTCACGTTTACGATTTGGCATTGTTCCCCTTCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTAcc < 2:934941/140‑1 (MQ=255) ccGGCGTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTAcc < 1:1854409/140‑1 (MQ=255) ggCGTCACGTTTACGCTTTGCCCTTATTCCCCTCCAGGCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGc < 1:1128875/140‑1 (MQ=255) ggCGTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTCCCAGCATGCATAC‑GTTTCGCACTTACCGc > 1:984280/1‑140 (MQ=255) gCGTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGTCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCa < 2:2416320/140‑1 (MQ=255) gCGTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCa < 1:493550/140‑1 (MQ=255) gCGTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCa < 2:469692/140‑1 (MQ=255) gTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAAc < 1:64009/140‑1 (MQ=255) gTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAAc < 1:1962692/140‑1 (MQ=255) gTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAAc < 1:1657320/140‑1 (MQ=255) gTCACGTTTACGATTCGCCATTCTTTCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAAc < 1:792497/140‑1 (MQ=255) tCACGTTTACGATTTACCATTGATCACCTTCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAAcc < 1:1173777/140‑1 (MQ=255) ttGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCTGTATTGGAGACCTAACCCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCg < 2:1024351/140‑1 (MQ=255) cATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCtgt < 2:2160717/140‑1 (MQ=255) cATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCtgt < 2:1352579/140‑1 (MQ=255) ttGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACCTACGGCGACCGGTGCAGGCGTCGCTGTGa > 1:830740/1‑140 (MQ=255) tGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGt < 2:2029212/123‑1 (MQ=255) tGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGt > 1:2029212/1‑123 (MQ=255) tGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGaa > 1:277938/1‑140 (MQ=255) ccccTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGGACTTACCTCAACCGATACAGGTGTCGCTGTGAACCGt > 1:721707/1‑140 (MQ=255) cTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCgg > 1:2005102/1‑140 (MQ=255) cTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCgg < 2:1557360/140‑1 (MQ=255) cagccagcCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAg > 1:1978997/1‑140 (MQ=255) cagccagcCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAg > 1:196726/1‑140 (MQ=255) gccagccGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGaa > 2:1271057/1‑140 (MQ=255) gccagccGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGaa > 1:1481236/1‑140 (MQ=255) ccagccGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGaaa > 2:1277383/1‑140 (MQ=255) ccGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATACTTTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCg > 2:109953/1‑140 (MQ=255) ccGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCgg < 2:277938/140‑1 (MQ=255) aaGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCg > 1:483074/1‑140 (MQ=255) ggTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCt < 2:1978997/140‑1 (MQ=255) aaTGGTGACCTAACTCCTCTTTCGCCAGTGATAGCTGTAGCACCTTGACTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTAc < 2:721707/140‑1 (MQ=255) ggTGACCTAACTCCCTTTTCGCTAGTGACTGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCgg < 1:1210465/140‑1 (MQ=255) agACCTAACTCCCCTTTCGCCAATGACAGCGTTAACACCGTGATTGCCCGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCGCTTGCCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTa < 2:811195/139‑1 (MQ=255) aCCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTAcg > 1:1672632/1‑140 (MQ=255) ccTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTAcgc > 1:378307/1‑140 (MQ=255) cTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTAcgcg > 2:2444883/1‑140 (MQ=255) cTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGACGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGTAATCGGGCGCGCTTACCGGTAcgcg > 1:1032459/1‑140 (MQ=255) cTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGtt > 1:226746/1‑140 (MQ=255) cTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTAACCGGTACGCGGGtt > 1:188922/1‑140 (MQ=255) tCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGACGGCAGAGAGCAGGAGTGCTTACCGGTACGCGTGTTg > 1:1117296/1‑140 (MQ=255) ccccTTTCGCCAGTGACCGCGGCAACACCTTAATTCCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTgc < 2:984280/140‑1 (MQ=255) ccccTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTgc > 1:453151/1‑140 (MQ=255) ccTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTgcgc > 2:589738/1‑140 (MQ=255) cTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGC‑TACCGGTACGCGTGTTGCgctc < 2:196726/140‑1 (MQ=255) cTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGAAGAAAGCTGGCCTGGTTACCGTTACGCGTGTTGCgct > 1:811195/1‑140 (MQ=255) cTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGAGAACCGTCGGCAAAGAGTGGGCGTGGTTACCGGTACGCGGGTTGCgct > 2:1195664/1‑140 (MQ=255) tttCGCCATTGACAGCGTTAACCCCTTGATTGCCGCTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCgctc < 2:1128414/140‑1 (MQ=255) tttCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACTGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCgctc > 1:1226067/1‑140 (MQ=255) tttCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCgctc < 2:453151/140‑1 (MQ=255) tttCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCgctc < 2:1579982/140‑1 (MQ=255) tttCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCgctc < 1:2314752/140‑1 (MQ=255) tttCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCgctc < 1:1778879/140‑1 (MQ=255) cGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGATAGCGGGCTTGCCTACCGGTACGCGTGTTGCgctccag > 1:872180/1‑140 (MQ=255) cGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCgctccag > 1:541075/1‑140 (MQ=255) cGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCgctccag > 1:1726162/1‑140 (MQ=255) cGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCgctccag > 1:233613/1‑140 (MQ=255) gCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCgctccagc > 2:2189184/1‑140 (MQ=255) ccAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCgctccagct < 2:378307/140‑1 (MQ=255) aGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCgctccagctcc < 2:1481236/140‑1 (MQ=255) aGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCgctccagctcc < 2:1496747/140‑1 (MQ=255) gTGACAGCGGTAACAACTTGATTGCCGGTGGTTCCAGTACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCgctccagctcca < 1:1195664/140‑1 (MQ=255) aCAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAggg > 1:424728/1‑140 (MQ=255) gTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATgg < 2:226746/140‑1 (MQ=255) tAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCGGCACGCATAC‑TGTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGc < 1:978163/140‑1 (MQ=255) tAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGc > 1:1289621/1‑140 (MQ=255) aaCACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACTGGTACGCGTGTTGCTCTCCAGCTCCAGGGTGATGGcc > 1:1107815/1‑140 (MQ=255) aaCACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGcc > 1:1545469/1‑140 (MQ=255) acacCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCt > 1:380048/1‑140 (MQ=255) ttGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGc < 1:2462761/133‑1 (MQ=255) ttGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGc > 2:2462761/1‑133 (MQ=255) tGCCGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGCTGCGCTCGAGCACCCGGGTGACGGCCTCATCAAtttt > 1:1030503/1‑140 (MQ=255) ccGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCg > 1:2195250/1‑140 (MQ=255) ccGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTCCGCTCCAGCTCTAGCGTGATGACCTCATCAATTTTCg > 1:1164087/1‑140 (MQ=255) ccGGTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTCCGCTCCAGCTCGAGGGTGATGACCTCATCAATTTTCg > 1:735312/1‑140 (MQ=255) ggTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCggg > 1:2038314/1‑140 (MQ=255) ggTTGTTCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCggg > 1:1963369/1‑140 (MQ=255) ttgttCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGCa < 1:2444883/140‑1 (MQ=255) tgttCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGCAt > 2:2000463/1‑140 (MQ=255) gttCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGCAtt > 2:7442/1‑140 (MQ=255) gttCCAGCACGCATA‑GTTTTCGTACGTACGGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGCAtt < 1:1044043/140‑1 (MQ=255) tCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGCATTcg < 1:2000463/140‑1 (MQ=255) tCCAGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGCATTcg < 2:2195250/140‑1 (MQ=255) aGCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCCCAATCGGTACACGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGCATTCGCGa < 1:1112832/140‑1 (MQ=255) gCACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGAATTCGCGAt > 2:1444419/1‑140 (MQ=255) cACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCGACCCGTACAGGGGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGCATTCGCGATa < 1:812004/140‑1 (MQ=255) cACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGCATTCGCGATa < 2:541075/140‑1 (MQ=255) cACGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGCATTCGCGATa < 2:2079912/140‑1 (MQ=255) cGCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGACTCGTCAATTTTCGGGCATTCGCGATaac > 1:886444/1‑140 (MQ=255) gCATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGCATTCGCGATaaca < 2:536758/140‑1 (MQ=255) cATAC‑TTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGCATTCGCGATaacaa > 1:136433/1‑140 (MQ=255) | CAGCGCCTCGCGCCCGGCGTCACGTTTACGATTTGCCATTGTTCCCCTCCAGCCAGCCGAAGCGGTAATGGTGACCTAACTCCCCTTTCGCCAGTGACAGCGGTAACACCTTGATTGCCGGTTGTTCCAGCACGCATACTTTTTCGCACTTACCGCAACCGGTACAGGCGTCGCTGTGAACCGTCGGCAGAAAGCGGGCGTGCTTACCGGTACGCGTGTTGCGCTCCAGCTCCAGGGTGATGGCCTCATCAATTTTCGGGCATTCGCGATAACAA > NC_000913/2299540‑2299814 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |