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cATCCAGCGCCTTTCAGCAGCTGCATTTATCAGGT‑GAA‑AA‑A‑CCACCGGGATGACGGATGCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTcc < 1:324915/140‑1 (MQ=255) cATCCAGCGCCTTTCAGCAGCTGCATTTATCAGGT‑GAA‑AA‑A‑CCACCGGGATGACGGATGCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCAATCATAATCCTCCACCAgctgtctc > 1:866545/1‑133 (MQ=255) cAGCGCCTTTCAGCAGCTGCATTTATCAGGT‑GAA‑AA‑A‑CCACCGGGATGACGGATGCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTCCCAgg < 1:2056121/140‑1 (MQ=255) cAGCGCCTTTCAGCAGCCGCATGTATCAGGT‑A‑A‑AACA‑CCCCCGGGATGCCGGATGCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTCCCAgg < 2:633959/140‑1 (MQ=255) ccTTTCAGCAGCTGCATTTATCAGGT‑GAA‑AA‑A‑CCACCGGGATGACGGATGCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTCCCAGGCTAcc > 2:157272/1‑140 (MQ=255) cTTTCAGCAGCTGCATTTATCAGGT‑GAA‑AA‑A‑CCACCGGGATGACGGATGCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTCCCAGGCTACCa < 1:2008724/140‑1 (MQ=255) cTTTCAGCAGCTGCATTTATCAGGT‑GAA‑AA‑A‑CCACCGGGATGACGGATGCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTCCCAGGCTACCa < 2:7445/140‑1 (MQ=255) cTTTCAGCAGCTGCATTTATCAGGT‑GAA‑AA‑A‑CCACCGGGATGACGGATGCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTCCCAGGCTACCa < 2:1257830/140‑1 (MQ=255) cTTTCAGCAGCTGCATTTATCAGGT‑GAA‑AA‑A‑CCACCGGGATGACGGATACGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTCCCAGGCTACCa < 2:1048456/140‑1 (MQ=255) cTTTCAGCAGCTGCATTTATCAAGT‑G‑A‑AA‑AGCCGCCGGGCTGACGGATTCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTCCCAGGCTACCa < 2:1154570/140‑1 (MQ=255) cTTTCAGCAGCTGCACTTATCAGGT‑G‑A‑AATA‑CCACCGCGATGACGGATGCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTCCCAGGCTACCa < 1:1180238/140‑1 (MQ=255) tCAGCAGCTGCATTTATCAGGT‑GAA‑AA‑A‑CCACCGGGATGACGGATGCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTcc < 1:176579/127‑1 (MQ=255) tCAGCAGCTGCATTTATCAGGT‑GAA‑AA‑A‑CCACCGGGATGACGGATGCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTcc > 2:176579/1‑127 (MQ=255) cagcagCTGCATTTATCAGGT‑GAA‑AA‑A‑CCACCGGGATGACGGATGCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTCCCAGGCTACCACGct < 2:351209/140‑1 (MQ=255) tttATCAGGT‑GAA‑AA‑A‑CCACCGGGATGACGGATGCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTCCCAGGCTACCACGCTCTGGGGTAGtg < 1:1787305/140‑1 (MQ=255) | ATCGTGGCTGCGTACTGTCGCCATGACCAGCTTACTGTTAAACGCTGAAGAGGGATCTTCTAACAGCCCTTTGCTGGTAATGAAATTAGCCTTACCTGACGGCGTCATCCAGCGCCTTTCAGCAGCTGCATTTATCAGGT‑G‑A‑AA‑A‑CCACCGGGATGACGGATGCGCTGGTTATAGTCGGCGAACTCTGGCAGCACAGCTTCAATGTCATTGCGAATGCGATCATAATCTTCCACCAGATACTCCCAGGCTACCACGCTCTGGGGTAGTG > NC_000913/1584534‑1584802 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |