Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,602,017 | (C)7→8 | coding (200/2019 nt) | hyfB → | hydrogenase 4 component B |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,602,010 | 1 | . | C | 88.5% | 481.0 / 50.0 | 157 | coding (193/2019 nt) | hyfB | hydrogenase 4 component B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (7/11); new base C (66/73); total (73/84) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.18e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
TCTGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑G‑‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAA > NC_000913/2601871‑2602143 | tCTGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACGTGCTGGGGTAACTATAGTCGCCCG‑TTTT‑g > 1:788175/1‑140 (MQ=255) tCTGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑g > 2:170650/1‑140 (MQ=255) tCTGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑g > 1:1430525/1‑140 (MQ=255) tGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑G‑‑c‑c > 1:1935514/1‑140 (MQ=255) tGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑G‑‑c‑c > 2:2372029/1‑140 (MQ=255) tGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑G‑‑c‑c < 2:1784691/140‑1 (MQ=255) cTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑G‑‑c‑c‑c‑cc < 2:1430525/140‑1 (MQ=255) cTTCGCTGTTTTTACTCCGTCTCGACAGACTGGCTCTTACGCTTTCCGCCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑G‑‑c‑c‑c‑cc < 2:722797/140‑1 (MQ=255) cTTCGCTGGTTTTACTCTGTCTGGACAGACTCGCTCTTAGGCTTTCCGCCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑G‑‑c‑c‑c‑cc < 2:1148797/140‑1 (MQ=255) aCTCGGTCTGGACAGACTGGCTTTTAAGCTTCCCGCCATTACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAAttt < 2:862419/140‑1 (MQ=255) aCTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAAttt < 1:2094230/140‑1 (MQ=255) cTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTg > 2:1420102/1‑140 (MQ=255) tCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGc < 1:121054/140‑1 (MQ=255) tGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGAttt < 2:1385591/140‑1 (MQ=255) aCTGGCTGTTAAGCTTTTCGGCCTCACATCGGTCGTGGGCGGCGTGATCGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTg < 2:1079550/140‑1 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 1:424724/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 2:1987097/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 1:2418908/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 2:556278/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 2:1459529/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 1:1289171/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 1:1659606/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTg > 2:1774653/1‑140 (MQ=255) aCTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑GTTT‑G‑‑C‑C‑C‑TCCC‑TTTATGAATTAGCCGATTTAACCCTg > 1:799516/1‑140 (MQ=255) cTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGc > 1:184089/1‑140 (MQ=255) cTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTGAGTCGCCCG‑TTTG‑G‑‑C‑CAC‑CCCC‑TTT‑CGAATTTGCCGATTTAACCCTGc > 2:795324/1‑140 (MQ=255) tGGCTATTAAGCTTTCCAGCATCACATCGCTCGTGCGCGCCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCg < 2:810917/140‑1 (MQ=255) ggCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGa < 1:64820/140‑1 (MQ=255) gCTATTAATCTTTCCGGTATCACATCGCTGGTGGGGGGCTTGATTGGCCTCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGaa < 2:1197072/140‑1 (MQ=255) gCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTTCG‑‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TTAATTTGCCGATTTAACCCTGCGaa > 2:271395/1‑140 (MQ=255) aaGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCT‑TTTT‑G‑‑C‑C‑CGCCCC‑TTT‑TGAATTTGCAGATTGAACCCTGCGAATGGATa > 2:745386/1‑140 (MQ=255) aGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAg < 1:1819338/140‑1 (MQ=255) tttCCGGCATCACATCGCTGGTGGACGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCct < 1:1435115/140‑1 (MQ=255) tttCCGGCATCACATCGCTGGTAGGCGGCGTGATTAGCACCATCAGCGCAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCct < 2:1101395/140‑1 (MQ=255) ttCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCctc < 1:25424/140‑1 (MQ=255) tCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGAt < 2:614290/133‑1 (MQ=255) tCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCctct > 2:1838830/1‑140 (MQ=255) tCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCctct > 1:2187729/1‑140 (MQ=255) cGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCg > 2:8787/1‑140 (MQ=255) cGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTGAATCCTGCGTATGGATAGCCTCTCg > 1:1150989/1‑140 (MQ=255) cacaTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAttt < 1:2321245/140‑1 (MQ=255) acaTCGCTGGTGGGCGGTGTGATTGGCATCATCAGCGGACTTACGCAAATACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTa < 2:1010777/140‑1 (MQ=255) caTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑GTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTAt > 1:441790/1‑140 (MQ=255) gCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTg < 1:1875340/140‑1 (MQ=255) gCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTg < 1:1691696/140‑1 (MQ=255) gtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTgg > 1:1870970/1‑140 (MQ=255) gtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑GTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTgg < 2:441790/140‑1 (MQ=255) ggcggcGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTa > 1:1914997/1‑140 (MQ=255) ggcggcGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCATGCCAATAGATAGCCTATCGGAATTTATGGTGCTGGTTa > 2:990034/1‑140 (MQ=255) cggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTAtc > 1:586693/1‑140 (MQ=255) aTTGGCATCATCAGCTGAATTACGCCATTTCATGCTGATGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGc < 1:702253/140‑1 (MQ=255) catcatCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtg > 1:2254260/1‑140 (MQ=255) catcatCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtg < 1:149857/140‑1 (MQ=255) atcatcAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTGTCGGCATATATCGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtgg > 1:1080811/1‑140 (MQ=255) atcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtgg < 2:1914997/140‑1 (MQ=255) atcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtgg < 1:488752/140‑1 (MQ=255) tcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTGTGGTGCTGTTTATCTCCTTGCTggtggtggt > 2:934581/1‑140 (MQ=255) cgaaaTTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGt < 1:2372029/137‑1 (MQ=255) cGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGt < 1:556278/140‑1 (MQ=255) cGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGt < 2:1220414/140‑1 (MQ=255) cGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGt < 2:91225/140‑1 (MQ=255) ggAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGtt < 2:424338/140‑1 (MQ=255) ggAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGtt < 2:573815/140‑1 (MQ=255) ggAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGtt < 2:2474959/140‑1 (MQ=255) gAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtc < 1:2146745/140‑1 (MQ=255) gAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtc < 1:1459529/140‑1 (MQ=255) gAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtc < 1:1622815/140‑1 (MQ=255) gAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtc < 2:1289171/140‑1 (MQ=255) aaTTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtct < 2:2187729/140‑1 (MQ=255) aTTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGCTGGTGGTTTGTtctc > 1:895687/1‑140 (MQ=255) aTTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGACTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctc < 1:2206094/140‑1 (MQ=255) tACGCAATTACATGCTGTTGTAACTTTAGTCTCCCG‑TTTG‑G‑‑C‑C‑C‑CCCCGTTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctctc < 2:1170799/140‑1 (MQ=255) tACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctctc < 1:170650/140‑1 (MQ=255) tACGCAATTACATGCAGGTGTAGCTATAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctctc < 1:1137682/140‑1 (MQ=255) cGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GCCC‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTctctct < 2:2116981/140‑1 (MQ=255) gCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTAt < 1:2023278/140‑1 (MQ=255) aTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCa < 2:2254260/140‑1 (MQ=255) aTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑G‑‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAt < 1:1379623/140‑1 (MQ=255) ttACATGCTGGTGTAAGTTTAGTCGCCCG‑TTAT‑G‑‑CTC‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAt < 2:1150989/140‑1 (MQ=255) ttACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGGCCG‑ATTT‑G‑‑C‑C‑CTCCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAt < 1:990034/140‑1 (MQ=255) ttACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCAt < 1:1770060/140‑1 (MQ=255) cATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑G‑‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtc < 1:280189/125‑1 (MQ=255) aTGCTGGTGTAACTTTAGTCGCTCGCTTTT‑C‑‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGAc < 1:861691/140‑1 (MQ=255) tGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGt < 2:2279127/122‑1 (MQ=255) tGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACt > 1:117130/1‑140 (MQ=255) ggTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTtata < 2:1659606/140‑1 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTctctct > 1:2381971/1‑124 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTctctct < 2:2381971/124‑1 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTatat > 2:367149/1‑140 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGGTATCTCCTAGCTGGGGGTGGTTTGTACTCTGCATTCATTTACTTatat > 2:1210181/1‑140 (MQ=255) tgtAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctctc > 1:387035/1‑122 (MQ=255) tgtAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtctctc < 2:387035/122‑1 (MQ=255) aGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATAc > 2:2482050/1‑140 (MQ=255) aGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATAc < 2:1751250/140‑1 (MQ=255) aGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATAc > 1:176491/1‑140 (MQ=255) aGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTATCTCTATTAATTGACTTATATGCGCGAATAc > 2:669780/1‑140 (MQ=255) aGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGATTGTTCTATCTTTTGATTGACATATATGCGCGAATAc > 1:793963/1‑140 (MQ=255) aGTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑ATT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATAc < 1:1980228/140‑1 (MQ=255) gTCGCCCG‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACg > 2:283877/1‑140 (MQ=255) g‑TTTT‑GC‑C‑C‑C‑CCCC‑TAT‑TGAATTTGGCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCaa < 1:1203462/140‑1 (MQ=255) | TCTGGCTTCGCTGTTTTTACTCGGTCTGGACAGACTGGCTATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCG‑TTTT‑G‑‑C‑C‑C‑CCCC‑TTT‑TGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTCTCTCTATTCATTGACTTATATGCGCGAATACGAGGGCAA > NC_000913/2601871‑2602143 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |