| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,207,942 | (G)7→8 | coding (442/630 nt) | ycfK → | e14 prophage; protein StfP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,207,935 | 1 | . | G | 91.1% | 478.4 / 33.9 | 146 | coding (435/630 nt) | ycfK | e14 prophage; protein StfP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (5/8); new base G (78/55); total (83/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
GGAGAAGGAGCAAAACTCAATGCAGCAACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCT‑GG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGT > NC_000913/1207798‑1208065 | GGAGAAGGAGCAAAACTCAATGCAGCAACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATAAGTAATCACTCAGTGGTAGTGGAATGCCGCAGAAGCATCAGCCTCT‑gg < 2:1196826‑M1/140‑1 (MQ=255) AGGAGCAAAACTCAATGCAGCAACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGATTGCTGCCAAAGCAGCTGCCTCT‑gg‑g‑g‑gg‑g < 1:1000583‑M1/140‑1 (MQ=255) GGAGCAAAACTCAATGCAGCAACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCT‑GG‑G‑G‑GG‑Ga > 1:1653916‑M1/1‑140 (MQ=255) tGCAGCAACGGCTACGTTAGGAAGCGCCGGTTTCATATCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGtt < 1:866338/140‑1 (MQ=255) tGCAGCAACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGtt > 1:1714362/1‑140 (MQ=255) caACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTAtt > 2:2448841/1‑140 (MQ=255) ggCTACATTAGGACGCACCGGTCTCATAGCTCTACCGGTCATGATT‑GGGGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCT‑GG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCgg < 2:730727/140‑1 (MQ=255) tACATTAGGACGCACGGGTTTCTTATCTATACCGGTTGTGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGtt < 1:827783/140‑1 (MQ=255) tACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGtt < 2:512035/140‑1 (MQ=255) ttAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGt < 1:2144920/140‑1 (MQ=255) ggACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGTCGCAAAAGCATCTGCCTCT‑GG‑GAG‑GG‑GATGGAAAAACAGTTGTAATCCCGGTTGCGTTta > 1:1017178/1‑140 (MQ=255) ggACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTta > 1:1528028/1‑140 (MQ=255) gACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCAGCCTCT‑GGTG‑G‑GA‑GATAGAAATACATTTGTATTCCCGGTTGCGTTtaa > 2:916587/1‑140 (MQ=255) cACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGc < 1:1740969/130‑1 (MQ=255) aCCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATg > 1:1268550/1‑140 (MQ=255) aCCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATg > 2:1880326/1‑140 (MQ=255) aCCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATg > 1:1419976/1‑140 (MQ=255) ccGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGc < 2:1222893/140‑1 (MQ=255) gCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCg < 1:2448841/140‑1 (MQ=255) cTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCgt < 1:144743/140‑1 (MQ=255) tataCCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCgtt > 2:2402901/1‑140 (MQ=255) tataCCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCgtt > 1:2294714/1‑140 (MQ=255) ataCCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTtaataa < 1:368643/123‑1 (MQ=255) ataCCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTtaataa > 2:368643/1‑123 (MQ=255) ataCCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCgttg > 1:1526401/1‑140 (MQ=255) ataCCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCgttg > 2:376420/1‑140 (MQ=255) ataCCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCgttg > 1:1302661/1‑140 (MQ=255) aCCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCgttgtt > 2:40893/1‑140 (MQ=255) aCCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCgttgtt > 1:203699/1‑140 (MQ=255) ccGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGttgttg < 1:1430172/140‑1 (MQ=255) ccGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGttgttg < 2:2184657/140‑1 (MQ=255) cGGTTATGATTGGGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGttgttg < 1:1957405/140‑1 (MQ=255) gTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCaa > 1:1630069/1‑140 (MQ=255) gTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCaa > 2:209693/1‑140 (MQ=255) gTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCaa > 1:1700463/1‑140 (MQ=255) gTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAAAAAGGCCTGTCTTGCCGTTGTTGCaa > 1:820250/1‑140 (MQ=255) tATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAAt > 2:414857/1‑140 (MQ=255) gATT‑GGCGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTAt > 2:1624321/1‑140 (MQ=255) aTT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATg > 1:504404/1‑140 (MQ=255) gtggtATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAAtt > 1:467174/1‑133 (MQ=255) gtggtATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAAtt < 2:467174/133‑1 (MQ=255) gtggtATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACaa < 1:2370908/140‑1 (MQ=255) tggtATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTGAATAATGGCTGTGTTGTCGTTGTTGCAAATTATGACAAt > 2:697744/1‑140 (MQ=255) aTTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGTTCGAAAGCCCCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCa < 2:814933/140‑1 (MQ=255) aTTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCa < 2:1526401/140‑1 (MQ=255) aTTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGCGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAAtccca > 2:2093663/1‑136 (MQ=255) gAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAgcg < 1:338952/140‑1 (MQ=255) aGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAAtt < 1:433690/124‑1 (MQ=255) aGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAg > 2:34600/1‑137 (MQ=255) aGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAg < 1:34600/137‑1 (MQ=255) gCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCa < 1:1880326/140‑1 (MQ=255) gCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCa < 1:2119909/140‑1 (MQ=255) gCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTAAATAATGCCTGTATTGCCGTTGTTGTAAATTATGACAATATCAGCGCa > 2:944775/1‑140 (MQ=255) gCAATCAGTAATCATTCAGTGGCGGTGGATTGCCGCAGAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCa < 1:772379/140‑1 (MQ=255) gCAATCAGTAATCATTCAGTGGCGGTGGATTGCCGCACAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCa < 1:916587/140‑1 (MQ=255) cAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTGATAATGCCGGTGTTGCCGTTGTTGCGAATTATGACAATGTCAGCGCAc > 2:772379/1‑140 (MQ=255) cAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAgcg > 1:1243181/1‑137 (MQ=255) cAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAgcg < 2:1243181/137‑1 (MQ=255) cAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCa > 2:1643889/1‑139 (MQ=255) cAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCAc > 1:1970967/1‑140 (MQ=255) tCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCa < 2:1924269/136‑1 (MQ=255) tCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTa > 1:176248/1‑140 (MQ=255) tCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTa > 2:1729439/1‑140 (MQ=255) aGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCa > 2:2081801/1‑134 (MQ=255) aGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCa < 1:2081801/134‑1 (MQ=255) aGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATc < 2:176248/140‑1 (MQ=255) tAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCaa < 1:1235955/140‑1 (MQ=255) aaTCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAAt > 2:259474/1‑140 (MQ=255) cATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCa > 2:2336654/1‑140 (MQ=255) tCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGAAAATTATTACAGTGACAGCGCACCTATCAATGCAGTg > 1:641019/1‑140 (MQ=255) cAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTgg > 1:76026/1‑140 (MQ=255) cAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTgg > 1:540337/1‑140 (MQ=255) gTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCa > 2:2024984/1‑140 (MQ=255) gTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCa > 2:2337916/1‑140 (MQ=255) tGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCaa < 2:1302661/140‑1 (MQ=255) gggggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAAc < 1:1624321/140‑1 (MQ=255) gggggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAAc > 2:2388716/1‑140 (MQ=255) ggggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACg < 2:1268550/140‑1 (MQ=255) ggggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACg < 1:259474/140‑1 (MQ=255) gggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTTTTGCAAATAATGTCAATGTCAGCGCACCTAACAATGCAGTGGCAACgg > 2:672128/1‑140 (MQ=255) gggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACgg > 2:1804148/1‑140 (MQ=255) gggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTAAGACAATGGCAGGGCCCCTATCTATGCAGTGGCAACgg > 1:1115770/1‑140 (MQ=255) gTGGAATGCCGCAAAAGGATCTGCCTCT‑GG‑GAG‑GG‑CATGTAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACgggg < 2:1000583/140‑1 (MQ=255) gTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGCCAATGTCTGCGGACCTATCAAAGCAGTGGCAACgggg > 1:980057/1‑140 (MQ=255) gTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCCGCGGACATATCAATGCAGTGGCAACgggg > 1:936603/1‑140 (MQ=255) gTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGc < 2:1655385/133‑1 (MQ=255) gTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACgggg < 2:1970967/140‑1 (MQ=255) gTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACgggg < 1:2024984/140‑1 (MQ=255) tGGAATGCCGCAAAAGCTTCTGACTCT‑GG‑G‑GTGG‑GGTGGGAATACAGTGGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACggggg < 2:883388/140‑1 (MQ=255) tGGAATGCCGCAAAAGCCTCTGCCTCT‑GG‑G‑G‑GGAGCTGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACggggg < 2:1092070/140‑1 (MQ=255) tGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACggggg < 2:1457343/140‑1 (MQ=255) gAATGCCGCAAAAGCATCTGCCGCT‑GG‑G‑GTGG‑GATGGCAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGa < 1:1114010/140‑1 (MQ=255) aTGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACg > 1:18447/1‑132 (MQ=255) aTGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGata < 2:596703/140‑1 (MQ=255) aTGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGata < 1:2388716/140‑1 (MQ=255) cAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACggggg < 2:1298214/130‑1 (MQ=255) cAAAAGCATCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACggggg > 1:1298214/1‑130 (MQ=255) tCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGt < 1:608144/140‑1 (MQ=255) tCTGCCTCTGGG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGt < 1:209693/140‑1 (MQ=255) tCTGCCTCT‑GG‑G‑G‑GGTGATGGACATTCAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGt < 1:697744/140‑1 (MQ=255) | GGAGAAGGAGCAAAACTCAATGCAGCAACGGCTACATTAGGACGCACCGGTTTCATAGCTATACCGGTTATGATT‑GGTGGTATTGAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCT‑GG‑G‑G‑GG‑GATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGT > NC_000913/1207798‑1208065 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |