| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 1,533,857 | +TATC | intergenic (‑6/‑167) | yddH ← / → nhoA | flavin reductase‑like protein YddH/arylamine N‑acetyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1533853 | 1 (0.010) | 137 (0.960) +TATC |
68/260 | 0.3 | 99.3% | intergenic (‑2/‑171) | yddH/nhoA | flavin reductase‑like protein YddH/arylamine N‑acetyltransferase |
| ? | NC_000913 | 1533854 = | 1 (0.010) | intergenic (‑3/‑170) | yddH/nhoA | flavin reductase‑like protein YddH/arylamine N‑acetyltransferase | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
TCCACCGGCATTGACCAGGCTGCAGCCATAATGTTACGCCGCTGGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1533715‑1533853‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGTCTATTCCAGGTTAT > NC_000913/1533854‑1533992 |||| cCCACAGGCATTGACCAGGCTGCAGCCATAATGTTACGCCGCTGGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGGT < 2:1396675/139‑1 CACCGGCATTGACCAGGCTGCAGCCATAATGTTACGCCGCTGGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGGTAT > 2:265291/1‑140 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AGCCATAATGTTACGCCGCTGGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGT > 2:2110104/1‑140 TAATGTTACGCCGCTGGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGA < 2:1562214/131‑1 TAATGTTACGCCGCTGGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGGTATCTATCGCCTC < 2:1736554/124‑1 TAATGTTACGCCGCTGGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGGTATCTATCGCCTC > 1:1736554/1‑124 ATGTTACGCCGCTGGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTA > 1:1951277/1‑140 TACGCCGCTGGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCG < 2:96085/140‑1 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CTGGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTA > 1:296900/1‑135 CTGGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGGTATCAATCGCCTGGCGGAGGAGGTTTGTTTAAGCGTAGTCCG > 1:659784/1‑140 TGGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGT > 2:143639/1‑140 GGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTA < 1:261802/140‑1 GGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTA < 1:1676530/140‑1 TGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCA < 2:1263433/140‑1 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TGAATCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCGATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCG < 2:255519/140‑1 TGAATCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCG < 1:319090/140‑1 TGAATCGGCTCATGGGATCTATCGCATCGGGAAGAAGCTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCG < 1:1216679/140‑1 GAATCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGG > 2:1292305/1‑140 TCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGT < 2:2011675/140‑1 TCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGT < 1:1643406/140‑1 TCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGT < 1:2411438/140‑1 TCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGT < 2:2045638/140‑1 TCGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTCGCGAACGTTATGAATGTCCGCGATCCCACAAAATAGCCGGTGCGGCGT > 2:1083889/1‑140 TCGGCTCATGGTATCTATCGCCCCGCGAAGAAGGTGTTTGTAAGCGTAATCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGT < 2:848319/140‑1 TCGGCTCATGGTACCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGT < 2:2463779/140‑1 CGGCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGTC < 2:1926885/140‑1 GCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCTTGTCCGCGATCACACAAAATATCCGGTGCGGCGTCTA > 1:1028808/1‑140 GCTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGCGCGGCGTCTt > 1:2269896/1‑139 CTCATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGTCTAT > 2:2334579/1‑140 acagGGTATCTATCGCCTCGCGCAGTAGGCTTTTTTACGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGTCTATT < 1:669995/136‑1 CATGGTATCTATCGCTTCGCGATGACGGTCTTTTTAAACGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGTCTATTC < 1:699029/140‑1 CATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGTCTATTC < 1:2074589/140‑1 ATGGTATCTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGTCTATTCC < 2:1549478/140‑1 CTATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTCTAACCGTAGTCAGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGTCTATTCCAGGTTAT < 1:1083889/140‑1 |||| TCCACCGGCATTGACCAGGCTGCAGCCATAATGTTACGCCGCTGGGATTGCTCATCGAAACTGGTGATCAAGACCGTTGGGCCATGATTTAACAGACGGCTGGCATGGTGTAATTCTATGGGGATGAATCGGCTCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1533715‑1533853‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATCGCCTCGCGAAGAAGGTTTTTTTAAGCGTAGTCCGTAACGCAATAAGTAACGAAATTAACGGGATTGGCGATTTGCGAACGTGATGCATGTCCGCGATCGCACAAAATAGCCGGTGCGGCGTCTATTCCAGGTTAT > NC_000913/1533854‑1533992 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |