| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,373,161 | T→C | A90A (GCT→GCC) | arnF → | undecaprenyl‑phosphate‑alpha‑L‑Ara4N flippase ‑ ArnF subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,373,161 | 0 | T | C | 99.3% | 502.4 / ‑5.1 | 142 | A90A (GCT→GCC) | arnF | undecaprenyl‑phosphate‑alpha‑L‑Ara4N flippase ‑ ArnF subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (81/60); total (81/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.30e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
TGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTAC > NC_000913/2373025‑2373297 | tGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCa < 1:2364065/140‑1 (MQ=255)tGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCa < 1:1581812/140‑1 (MQ=255) ggATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCaa > 1:1051569/1‑140 (MQ=255) ggATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCACTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCaa < 2:1709305/140‑1 (MQ=255) ccGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTAc > 1:604601/1‑140 (MQ=255) gacagcTGTTACTCGGGCTGCTAGGTTATCTACTTCCCGCTTTTTGTTCGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACtt < 2:656056/135‑1 (MQ=255) gATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTc > 1:1770124/1‑140 (MQ=255) tACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATTAGTTAAGACCTGGTATCGATTGACTCAATGGTACTTccc > 2:1186747/1‑140 (MQ=255) ttACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTg > 2:1669134/1‑140 (MQ=255) ttACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTACTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTg > 2:1865981/1‑140 (MQ=255) tCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTgg > 2:1612551/1‑137 (MQ=255) gctgctGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGTTATCGATAGCCTCAATAGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGa > 2:1095978/1‑140 (MQ=255) gctgctGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTTTGGATTGGCTCGATAGTACTTGCCGGCTGGGactgtc > 1:656056/1‑135 (MQ=255) gctgctGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTGTGGATTGGCTCGATAGTACTTGCCGGCTGGGAAGGGa > 1:819884/1‑140 (MQ=255) gctgctGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGa > 2:1405289/1‑140 (MQ=255) gctgctGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGa > 1:2317904/1‑140 (MQ=255) gctgctGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGa > 1:2410426/1‑140 (MQ=255) tgctgGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGc < 1:1467593/128‑1 (MQ=255) tgctgGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGc > 2:1467593/1‑128 (MQ=255) tgctgGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACt > 2:2242418/1‑140 (MQ=255) tgctgGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACt > 2:1897992/1‑140 (MQ=255) ctgGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACttt > 1:552282/1‑140 (MQ=255) ctgGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACttt > 2:2000066/1‑140 (MQ=255) tgGGTTATCTGCTTTACGTTTTATGGTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACtttt < 1:799035/140‑1 (MQ=255) tATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCt < 1:1669134/140‑1 (MQ=255) tATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCt < 2:2267223/140‑1 (MQ=255) tATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCt < 1:1579712/140‑1 (MQ=255) tATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTACTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCt < 1:1865981/140‑1 (MQ=255) tCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGa < 2:2385179/140‑1 (MQ=255) tCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGa < 1:2025286/140‑1 (MQ=255) tCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGa < 2:1662301/140‑1 (MQ=255) gCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAg < 2:459976/140‑1 (MQ=255) cTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGc < 2:1336058/140‑1 (MQ=255) tttCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCa < 2:2410426/140‑1 (MQ=255) tttCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCa > 2:2144425/1‑140 (MQ=255) tttCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCa < 1:432071/140‑1 (MQ=255) tttCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCa > 2:2061814/1‑140 (MQ=255) ttCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCac > 1:2066542/1‑140 (MQ=255) tCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGGTGGGAAAGGACTTATTCGCTGAAAGCact > 1:979089/1‑140 (MQ=255) tCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCact > 1:1727864/1‑140 (MQ=255) tCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCact > 1:2015389/1‑140 (MQ=255) tCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCa < 2:2192981/138‑1 (MQ=255) tttttGTTGGTATAAAATGCTTAATAAACTTCCGCCAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTgg < 2:700609/140‑1 (MQ=255) tttGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGa < 1:1697846/140‑1 (MQ=255) ttgGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAg < 1:2181884/140‑1 (MQ=255) ggTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGcc < 2:1380852/140‑1 (MQ=255) ggTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGcc < 1:2061814/140‑1 (MQ=255) ggTATAAAACGCTTCATAAACTGGCGCTAGGCAAAGCTTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGcc < 1:1186747/140‑1 (MQ=255) aaCGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGtatta > 1:1826055/1‑140 (MQ=255) cGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATg < 2:1826055/140‑1 (MQ=255) cTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAg < 1:1405289/140‑1 (MQ=255) cTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAg < 2:1727864/140‑1 (MQ=255) ttCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGtatt < 1:2284687/134‑1 (MQ=255) ttCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGtatt > 2:2284687/1‑134 (MQ=255) ttCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGc > 2:1564413/1‑140 (MQ=255) tCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAAGGACTTTTACGCGGAACGCACTACTGGGAGTAGCCTGTACTATGAGCg > 2:1129019/1‑140 (MQ=255) tAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGt < 2:604601/140‑1 (MQ=255) aCTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGa > 1:156112/1‑140 (MQ=255) tGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCCCTACTGGGAGTCGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGc > 1:1016100/1‑140 (MQ=255) tGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGc > 2:539654/1‑140 (MQ=255) tGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGc > 1:1663383/1‑140 (MQ=255) cgcTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTg > 1:2391506/1‑140 (MQ=255) cgcTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAATAGACTATATTATGAGCGGGTTGATGCTg > 1:945927/1‑140 (MQ=255) gCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGcc < 1:2144425/140‑1 (MQ=255) aTGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCTTGTATTAGGAGCGGGTGGATGCTGATTTTCCTGCCCACg > 2:747894/1‑140 (MQ=255) aTGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACg > 2:1676892/1‑140 (MQ=255) cTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACaa < 1:2238391/140‑1 (MQ=255) tGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACaaaa > 1:1435183/1‑140 (MQ=255) tGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACaaaa > 1:605801/1‑140 (MQ=255) gCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATTAGCGGGTGGATGCTGATTTTCGTGCCCACGACAAaac > 1:792065/1‑140 (MQ=255) gCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAaac > 1:1435736/1‑140 (MQ=255) gCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAaac > 1:1866954/1‑140 (MQ=255) gCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAaac > 1:2344584/1‑140 (MQ=255) gCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAaac > 2:2381514/1‑140 (MQ=255) gCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCATGCCCACGACAAaac > 1:1170019/1‑140 (MQ=255) cTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAaaca > 1:1342172/1‑140 (MQ=255) tATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGtt > 2:269553/1‑140 (MQ=255) tATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTCCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGtt > 2:270154/1‑140 (MQ=255) tGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTAc < 1:1564413/140‑1 (MQ=255) gTTATGTGCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGAAGCTGATTGTCCTGCACACGACAAAACAACGTTACTGa > 1:1018733/1‑140 (MQ=255) gtgCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGtttt > 1:1249875/1‑140 (MQ=255) gtgCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGtttt > 2:1278542/1‑140 (MQ=255) gtgCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGtttt > 2:2185036/1‑140 (MQ=255) gtgCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGtttt > 2:2084352/1‑140 (MQ=255) gtgCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGtttt > 1:460817/1‑140 (MQ=255) gtgCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGtttt > 1:2355058/1‑140 (MQ=255) gtgCTGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGAGTTGATGCAGATGTTCATGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGtttt > 2:859585/1‑140 (MQ=255) tGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACg > 1:1476388/1‑124 (MQ=255) tGGTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACg < 2:1476388/124‑1 (MQ=255) ggTATGGATTGCCTCTATGGTATTTCCCGCCTGGGAAAGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTg < 1:859585/140‑1 (MQ=255) ggTATGGATTGCCTCTATGGTACTTCCCGCCTGGGAACGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTg < 1:759736/140‑1 (MQ=255) ggTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTg < 1:2084352/140‑1 (MQ=255) gTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGc > 1:1849184/1‑140 (MQ=255) gTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGc > 1:2482889/1‑140 (MQ=255) gTATGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGAAGCTGATTTTCCTACCCCCGACAAAAGAACGATACTGAGTTTTCCCTGc > 2:860876/1‑140 (MQ=255) aTGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCa < 1:2242418/140‑1 (MQ=255) tGGATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAAAAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCAc > 1:1106850/1‑140 (MQ=255) gATTGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACtt > 2:2243479/1‑140 (MQ=255) tGCCTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTac > 1:1346135/1‑140 (MQ=255) tGCCTCAATGGTACTTCCCGGCAGGGAAGTGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTac < 1:747894/140‑1 (MQ=255) | TGGATGCCCGGATACTGTTACTCGGGCTGCTGGGTTATCTGCTTTCCGTTTTTTGTTGGTATAAAACGCTTCATAAACTTGCGCTAAGCAAAGCCTATGCCTTGCTCAGTATGAGTTATGTGCTGGTATGGATTGCTTCAATGGTACTTCCCGGCTGGGAAGGGACTTTTTCGCTGAAAGCACTACTGGGAGTAGCCTGTATTATGAGCGGGTTGATGCTGATTTTCCTGCCCACGACAAAACAACGTTACTGAGTTTTCCCTGCCACTTTAC > NC_000913/2373025‑2373297 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |