| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,400,895 | T→C | T221A (ACC→GCC) | nuoF ← | NADH:quinone oxidoreductase subunit F |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 2,400,895 | 0 | T | C | 99.0% | 358.5 / NA | 104 | T221A (ACC→GCC) | nuoF | NADH:quinone oxidoreductase subunit F |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (52/51); minor base A (1/0); total (53/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CGGCAGTTCCCACAGTCCCGGATTTTTCACCCGACCGGAGAAGCCCATCAGCTTGGTGCCAGCATCTTTACTTTTCGAGATGTTCTGATACCACTCCACGCCGTTAGCGAGGATCGCCGGAACGTTACACAGGGTTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCTGTTTCTTCCCCGCAGATGTAGCGCC > NC_000913/2400761‑2401029 | cGGCAGTTCCCACAGTCCCGGATTTTTCACCCGACCGGAGAAGCCCATCAGCTTGGTGCCAGCATCTTTACTTTTCGAGATGTTCTGATACCACTCCACGCCGTTAGCGAGGATCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGa > 1:604672/1‑140 (MQ=255) ggCAGTTCCCACAGTCCCGGATTTTTCACCCGACCGGAGAAGCCCATCAGCTTGGTGCCAGCATCTTTACTTTTCGAGATGTTCTGATACCACTCCACGCCGTTAGCGAGGATCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGAc < 1:1222509/140‑1 (MQ=255) ggCAGTTCCCACAGTCCCGGATTTTTCACCCGACCGGAGAAGCCCATCAGCTTGGTGCCAGCATCTTTACTTTTCGAGATGTTCTGATACCACTCCACGCCGTTAGCGAGGATCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGAc < 2:194683/140‑1 (MQ=255) cAGTTCCCACAGTCCCGGATTTTTCACCCGACCGGAGAAGCCCATCAGCTTGGTGCCAGCATCTTTACTTTTCGAGATGTTCTGATACCACTCCACGCCGTTAGCGAGGATCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGACgt > 2:121102/1‑140 (MQ=255) cAGTTCCCACAGTCCCGGATTTTTCACCCGACCGGAGAAGCCCATCAGCTTGGTGCCAGCATCTTTACTTTTCGAGATGTTCTGATACCACTCCACGCCGTTAGCGAGGATCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGACgt > 2:1307039/1‑140 (MQ=255) acaGTCCCGGATTTTTCACCCGACCGGAGAAGCCCATCAGCTTGGTGCCAGCATCTTTACTTTTCGAGATGTTCTGATACCACTCCACGCCGTTAGCGAGGATCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGACGTTGTTGaca < 1:81688/140‑1 (MQ=255) aGTCCCGGATTTTTCACCCGACCGGAGAAGCCCATCGGCTTGGTGCCAGCATCTTTACTTTTCGAGATGTTCTGATACCACTCCACGCCGTTAGCGAGGATCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGACGTTGTTGAcaca > 2:1432849/1‑140 (MQ=255) aGTCCCGGATTTTTCACCCGACCGGAGAAGCCCATCAGCTTGGTGCCAGCATCTTTACTTTTCGAGATGTTCTGATACCACTCCACGCCGTTAGCGAGGATCGCCGGAACTTTAGACAGGGCTTGGACGTTGTTGAcaca > 1:760153/1‑140 (MQ=255) tCCCGGATTTTTCCCCCGACCGGAGAAGCCCATCAGCTTGGTGCCAGCATCTTTACTTTTCGAGATGTTCTGATACCACTCCACGCCGTTAGCGAGGATCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGACGTTGTTGACACAgg < 2:1334649/140‑1 (MQ=255) tCCCGGATTTTTCACCCGACCGGAGAAGCCCATCAGCTTGGTGCCAGCATCTTTACTTTTCGAGATGTTCTGATACCACTCCACGCCGTTAGCGAGGATCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGACGTTGTTGACACAgg > 1:1237596/1‑140 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(MQ=255) tAGCGAGGATCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCt > 1:1847089/1‑140 (MQ=255) gAGGATCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCTGttt < 2:2205661/140‑1 (MQ=255) gATCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGGGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCTGTttctt > 2:1658585/1‑140 (MQ=255) gATCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGAtt > 2:118299/1‑127 (MQ=255) gATCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGAtt < 1:118299/127‑1 (MQ=255) aTCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCTGTttcttc < 2:1904975/140‑1 (MQ=255) aTCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCTGTttcttc < 2:1404968/140‑1 (MQ=255) tCGCCGGAACGTTACACAGGGCTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCTGTTTCTTcc > 1:1521230/1‑140 (MQ=255) ccGGAACGTTACACAGGGCTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCTGTTTCTTCCCCg > 1:1674164/1‑140 (MQ=255) ccGGAACGTTACACACGGCTTCGACATTGGTGACACACGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCTGTTTCTTCCCCg < 1:778414/140‑1 (MQ=255) cGGAACGTTACACAGGGCTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCTGTTTCTTCCCCGc < 1:1962884/140‑1 (MQ=255) caGGGCTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCTGTTTCTTCCCCGCAGATGTAGCGcc < 1:1548260/140‑1 (MQ=255) caGGGCTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCTGTTTCTTCCCCGCAGATGTAGCGcc < 2:1818082/140‑1 (MQ=255) caGGGCTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCTGTTTCTTCCCCGCAGATGTAGCGcc > 2:2060304/1‑140 (MQ=255) caGGGCTTCGACGTTGTAGACACAGGTCGGTTTCCCCCACGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCTGTTTCTTCCCCGCAGATGTAGCGcc < 2:1208970/140‑1 (MQ=255) | CGGCAGTTCCCACAGTCCCGGATTTTTCACCCGACCGGAGAAGCCCATCAGCTTGGTGCCAGCATCTTTACTTTTCGAGATGTTCTGATACCACTCCACGCCGTTAGCGAGGATCGCCGGAACGTTACACAGGGTTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCGGAGGTTGCCGGGAAGGGTGGCTTCGAGCGTGGGTTAGCACGACGTCCTTCCAGGGAGTTGATTAACGCTGTTTCTTCCCCGCAGATGTAGCGCC > NC_000913/2400761‑2401029 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |