Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 300,630 | C→T | G102D (GGC→GAC) | paoC ← | aldehyde dehydrogenase: molybdenum cofactor‑binding subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 300,630 | 0 | C | T | 98.2% | 351.6 / NA | 110 | G102D (GGC→GAC) | paoC | aldehyde dehydrogenase: molybdenum cofactor‑binding subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (60/47); total (62/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TTCGTCCGCCAGGGAGTAAGCTCCTTTATTACGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGCCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTCCGTATCAAGGGCGGTGAGGCGTCCTTTGGCAATGG > NC_000913/300497‑300765 | ttCGTCCGCCAGGGAGTAAGCTCCTTTATTACGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTa < 2:1883406/140‑1 (MQ=255) tCGTCCGCCAGGGAGTAAGCTCCTTTATTACGGCGATAGTGTGCCTGCAGCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTaa < 1:2281310/140‑1 (MQ=255) tCGTCCGCCAGGGAGAAAGCTCGTTGATTACGGCGATTGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTaa < 1:991300/140‑1 (MQ=255) gTCCGCCAGGGAGTAAGCTCCTTTATTACGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACa > 2:2163154/1‑140 (MQ=255) gCCAGGGAGTAAGCTCCTTTATTACGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCt < 2:13771/140‑1 (MQ=255) gCCAGGGAGTAAGCTCCTTTATTACGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCt > 1:2436732/1‑140 (MQ=255) gCCAGGGAGTAAGCTCCTTTATTACGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCt > 1:2288694/1‑140 (MQ=255) gCCAGGGAGTAAGCTCCTTTATTACAGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCt > 2:1678754/1‑140 (MQ=255) aGCTCCTTTATTACGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCCGATGATAGCGCTCAATTGTGGGGTCTCCTAACAGCCTGGCGGTGtttt > 2:1135674/1‑140 (MQ=255) ccTTTATTACGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTc > 2:1397349/1‑140 (MQ=255) ccTTTATTACGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATAATAGTGCTAAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTc > 2:956479/1‑140 (MQ=255) cTTTATTACGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCg > 2:2278289/1‑140 (MQ=255) tttATTACGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGc > 2:2353081/1‑140 (MQ=255) tttATTACGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGc > 1:450430/1‑140 (MQ=255) tattaCGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCt > 2:1394578/1‑140 (MQ=255) tattaCGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCt < 2:1959440/140‑1 (MQ=255) tattaCGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCt > 2:1957954/1‑140 (MQ=255) tattaCGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCt < 1:330721/140‑1 (MQ=255) taCGGCGATAGTGTGTCTGCACTAGTGAGTCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTg < 1:1135674/140‑1 (MQ=255) taCGGCGATAGTGTGGCTGCACCAGCGAGTCCGCCGCCCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTg < 1:1099781/140‑1 (MQ=255) aCGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGc > 1:2391395/1‑140 (MQ=255) cGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGcc > 1:2115937/1‑140 (MQ=255) gCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCTCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGCCGCATAAAAGCCTGGCCGTGTTGTTGTCGCGTTTGCCgg > 2:1136085/1‑139 (MQ=255) gCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGTTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGa > 1:2405421/1‑140 (MQ=255) gCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCATTAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGt > 2:903330/1‑128 (MQ=255) gCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCATTAGTGGGGACGCCTAATAGCCTGGCGGTGTCTTTGTCGCCTTTGCCgg > 2:1187815/1‑139 (MQ=255) gCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGt < 1:903330/128‑1 (MQ=255) gCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCTTTTGCCGa > 2:1574033/1‑140 (MQ=255) gCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGa > 1:2445115/1‑140 (MQ=255) gCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGa > 2:2013553/1‑140 (MQ=255) gCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGa > 1:1442190/1‑140 (MQ=255) cGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAg < 1:1867788/140‑1 (MQ=255) aTAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTg > 2:2338907/1‑140 (MQ=255) gtgCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGAGCCCCg > 2:1935588/1‑140 (MQ=255) ccTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGc < 2:1628974/139‑1 (MQ=255) ccTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGc > 1:1628974/1‑139 (MQ=255) ccTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCg > 1:1417417/1‑140 (MQ=255) ccTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCCCCTAACAGACTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTCTGCCGAGTCCCCCGGCg > 2:1122429/1‑140 (MQ=255) gCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTa < 2:2288694/140‑1 (MQ=255) cACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGcc < 2:2193816/123‑1 (MQ=255) cACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGcc > 1:2193816/1‑123 (MQ=255) cACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTAc > 2:1540200/1‑140 (MQ=255) cACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTAc > 2:2082664/1‑140 (MQ=255) cACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTGGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTAc > 1:1100674/1‑140 (MQ=255) aCCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGAGGTATGTTTGTCACCTTTGCCCAGTGCCCCGGCGTTACt > 2:1080735/1‑140 (MQ=255) ccAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAAGAGCCTGGCAGTGATTTAGTCGCCTTGGCCGGGTGCCCCGGCGTTACTg > 2:658101/1‑140 (MQ=255) ccAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGcc < 2:1809937/128‑1 (MQ=255) ccAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGcc > 1:1809937/1‑128 (MQ=255) ccAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTg < 1:2237478/140‑1 (MQ=255) aGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGc > 1:2343176/1‑140 (MQ=255) aGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGc > 2:2166367/1‑140 (MQ=255) cGAGGCCGCCGCTCGGGCCTGTCCGGAGGTCTCGGCCGCTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCACCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCgg < 1:1080735/140‑1 (MQ=255) cGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCgg > 2:2406166/1‑140 (MQ=255) cGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCgg < 2:2204561/140‑1 (MQ=255) cGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCgg < 1:2163154/140‑1 (MQ=255) cGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCgg < 1:2278289/140‑1 (MQ=255) aGGCCGCCGCTCGCGCCTGCTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGCCGCCTAACAGCCTGGCGCTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑tg > 2:479/1‑139 (MQ=255) gccgccGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGAGTTATTGGCGCCTTTTCCGGGTTCCCCGGAGTTACTGGCGG‑ttaa > 1:704089/1‑137 (MQ=255) gccgccGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGAGGTGTTTTTGTCTCTTGTGCCGAGTTCCCCCGCGTTTCTGGCGG‑Taaa > 2:1071123/1‑139 (MQ=255) cgccgcTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGa < 2:455772/140‑1 (MQ=255) cgccgcTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGa > 2:233637/1‑140 (MQ=255) gccgcTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCGATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGCGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCCCCGTTACTGGCGG‑AAATgtc > 2:2173535/1‑138 (MQ=255) gccgcTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTGGCCATTGACGAGTGCCTCGGCATTACTGGCGG‑GTATGaa > 2:639890/1‑139 (MQ=255) gccgcTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTACCACGGCGTCACTGGCGG‑GAAttaa > 1:1158861/1‑137 (MQ=255) ccgcTCGCGCCTGTTCGGAGGTCTCGGCCACCAGCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACa < 2:1100674/140‑1 (MQ=255) ccgcTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACa < 1:1808951/140‑1 (MQ=255) tGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGGTTAATAAAAGCCataagcc > 2:159575/1‑134 (MQ=255) ggTCTCGGCCACTACGAGCGCATTGCCCTTATGATAGGGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCtt < 1:1136085/140‑1 (MQ=255) tcGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TGATGAAAGCCCGTA‑CCCCCCGCCGtttttt > 2:2183672/1‑139 (MQ=255) tcGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTg < 1:233637/140‑1 (MQ=255) ggCCACTACCAGCGCAATGGCCCGAAGATTGTGCTCATTAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTgcg < 1:956479/140‑1 (MQ=255) ccACTACCAGCGCAATGGCCTGCTGCTAGTGCTCAATTGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGcgcg < 1:1052701/140‑1 (MQ=255) ccACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGcgcg < 2:1442190/140‑1 (MQ=255) ccACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGcgcg < 1:2338907/140‑1 (MQ=255) cTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCgcggcg < 2:450430/140‑1 (MQ=255) cTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑GAATTACAGCCAGTA‑CCCCCCGCGCTTTTTTTgcggcg > 2:1939482/1‑140 (MQ=255) aCCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTc < 1:2183672/140‑1 (MQ=255) aCCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTc < 1:1678754/140‑1 (MQ=255) aCCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTc < 2:198261/140‑1 (MQ=255) ccAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTcc < 1:1395599/140‑1 (MQ=255) ccAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTcc < 1:2082664/140‑1 (MQ=255) ccAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTcc < 1:2013553/140‑1 (MQ=255) cgcAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTCCGTAt < 1:1935588/140‑1 (MQ=255) cgcAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CCCCCCGCGCCTTTTGCGCCGCGGCCGGAt > 1:1377129/1‑140 (MQ=255) cgcAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑GAATGACAGCCCGTA‑CCCCCCGCGCTTTTTTTGCGGCGGCCgggt > 2:1594991/1‑137 (MQ=255) cgcAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑GAAAGAATGCCACTA‑TCCCACGTGCTTTTCTTGCGGCGTCCggtt > 1:1170243/1‑137 (MQ=255) gcAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTCCGTATc < 1:2136255/140‑1 (MQ=255) cAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTCCGTATCa < 2:1417417/140‑1 (MQ=255) cAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTCCGTATCa < 2:2405421/140‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATTACAGCCCGGA‑CGCCCCGCGCTTTTTTTGCGGCGGCCGCATCaaa > 2:2136255/1‑139 (MQ=255) aTGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTCCGTATCAAg > 1:1518012/1‑140 (MQ=255) ccTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTCCGTATCAAGGGCg < 1:1397349/140‑1 (MQ=255) cTGATGATAGTGCTCTATAGTGGGGCCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTCCGTATCAAGGGCgg < 1:1187815/140‑1 (MQ=255) gatAGTGCTCAATAGCGGGGTCTCCCAACTGCCTGGCCGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTCCGTATCAAGGGCGGTGAgg < 1:658101/140‑1 (MQ=255) tAGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTCCGTATCAAGGGCGGTGAGGCg < 1:2353081/140‑1 (MQ=255) aGTGCTCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑GAATTAAAGCCACTA‑CTGCCCGCGCGTTTTTTGCCGCGTTCCCATCCAGGGCGGGGGGGCgg > 2:1684233/1‑139 (MQ=255) tCAATAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAAAGACAGCCCAGA‑CGCCCCGCGCTTTTTTTGCGGCGGCCGTATCCAGGGGGGGGGGGCGGCCttt > 2:2354641/1‑140 (MQ=255) aTAGTGGGGTCGCCTATCAGCCTGGCGGTGCGTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTCCGTATCAAGGGCGGTGAGGCGTCCTTTGGc < 2:1158861/140‑1 (MQ=255) tAGTGGGGTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑CGGAAACAGCCAGGAGCCCCCGGGGCTTTTTTCCCGGCTTCCG‑AACAATGGGGTGGAGGGGACCTTTggta > 2:968737/1‑138 (MQ=255) ggggTCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTCCGTATCAAGGGCGGTGAGGCGTCCTTTGGCAATgg < 2:2161532/140‑1 (MQ=255) | TTCGTCCGCCAGGGAGTAAGCTCCTTTATTACGGCGATAGTGTGCCTGCACCAGCGAGGCCGCCGCTCGCGCCTGTTCGAAGGTCTCGGCCACTACCAGCGCAATGGCCTGATGATAGTGCTCAATAGTGGGGCCGCCTAACAGCCTGGCGGTGTTTTTGTCGCCTTTGCCGAGTGCCCCGGCGTTACTGGCGG‑TAATGACAGCCAGTA‑CGCCCGGCGCTTTTTGCGCGGCGTCCGTATCAAGGGCGGTGAGGCGTCCTTTGGCAATGG > NC_000913/300497‑300765 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |