| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 2,911,200 | A→G | V47A (GTG→GCG) | mazE ← | antitoxin of the MazF‑MazE toxin‑antitoxin system MazE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,911,200 | 0 | A | G | 99.0% | 728.3 / NA | 208 | V47A (GTG→GCG) | mazE | antitoxin of the MazF‑MazE toxin‑antitoxin system MazE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/0); new base G (114/92); total (116/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
CCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCACTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTACGCTACTGTGG > NC_000913/2911064‑2911334 | tatCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCt < 2:1335230/140‑1 (MQ=255) tatCGGGTACGTATCGGCTTACAATAACCCGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCt < 1:999108/140‑1 (MQ=255) atCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTc > 1:414273/1‑140 (MQ=255) atCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTc > 1:1851160/1‑140 (MQ=255) ggTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCaata > 1:1314121/1‑140 (MQ=255) tACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCaataat > 1:280478/1‑140 (MQ=255) tACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCaataat > 1:479212/1‑140 (MQ=255) cGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAAtaatta > 2:91749/1‑140 (MQ=255) cGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAAtaatta > 2:1393886/1‑140 (MQ=255) aTCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATaattaatt < 1:222933/140‑1 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1:659072/1‑140 (MQ=255) gTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCa < 1:2039299/140‑1 (MQ=255) gTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCa < 1:362237/140‑1 (MQ=255) ggTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAAc > 2:1380016/1‑140 (MQ=255) tttCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTa > 2:2233909/1‑140 (MQ=255) gCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCggg < 2:144602/140‑1 (MQ=255) gTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGAt > 1:1614862/1‑140 (MQ=255) gTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGaa > 1:1806216/1‑140 (MQ=255) ttCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCGGATTGAGCGCCTCCATTAACGTAGCCGGGATTCGCACCGTCGGTGAAt > 2:1143487/1‑140 (MQ=255) ttCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAAt > 2:1295265/1‑140 (MQ=255) aGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCa < 2:2087856/140‑1 (MQ=255) cGTAAATACGGGCTCTATACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAAc > 1:2294539/1‑140 (MQ=255) gTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCTGCACCGCCGATGAATTTCCCCAACg > 1:1025936/1‑140 (MQ=255) gTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCa > 1:71132/1‑137 (MQ=255) gTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACg > 1:1761165/1‑140 (MQ=255) gTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACg > 1:196487/1‑140 (MQ=255) gTAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGACTGCATTAACGTGGCCTGGATCCGCGCCGCTGGTGAATTTCCCCAACg > 2:649599/1‑140 (MQ=255) tAAATACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGc > 2:1417015/1‑140 (MQ=255) tACGGGCTCTTTACGCGTTGGCACAATAATTCATTAGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTa < 2:1046956/140‑1 (MQ=255) tACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTa < 1:1380016/140‑1 (MQ=255) tACGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTa < 2:1904667/140‑1 (MQ=255) cGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTACg < 1:1895473/140‑1 (MQ=255) cGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTACg < 1:2017344/140‑1 (MQ=255) cGGGCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCCCCCCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTACg < 2:413117/140‑1 (MQ=255) cGGGCTCTTTACGCGCTCGCTCCATAATTAATTTGCCATTCACCAGGTAAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTACg < 2:748369/140‑1 (MQ=255) gCTCTTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTACGCTa > 1:2182971/1‑140 (MQ=255) ctctTTACGCGCTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTACGCTAc > 1:1538268/1‑140 (MQ=255) | CCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGATGTCGTTGACCAGTTCAGCAAGCGTAAATACGGGCTCTTTACGCACTGGCTCAATAATTAATTTGCCATCCACCAGGTCAATCTTCACTTCATCATCAATATTCAGATTGAGCGCCTGCATTAACGTAGCCGGGATCCGCACCGCCGGTGAATTTCCCCAACGCTTTACGCTACTGTGG > NC_000913/2911064‑2911334 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |