| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 2,988,019 | T→C | Y162H (TAT→CAT) | yqeH → | putative LuxR family transcriptional regulator YqeH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,988,019 | 0 | T | C | 99.5% | 661.3 / NA | 185 | Y162H (TAT→CAT) | yqeH | putative LuxR family transcriptional regulator YqeH |
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
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ttCACCATAATGGGGCATATGGTTTCTGGTTATAATCCATATCAGATTGCTGAAGTTCTGGATATGGATATCCGTAGCATCTACGCGTACAAGCAACGAATCGAAAAGAGAATGGGTGGTAAAATAAACGAAttatttat < 1:213718/140‑1 (MQ=255) ttCACCATAATGGGGCATATGGTTTCTGGTTATAATCCATATCAGATTGCTGAAGTTCTGGATATGGATATCCGTAGCATCTACGCGTACAAGCAACGAATCGAAAAGAGAATGGGTGGTAAAATAAACGAAttatttat < 2:197848/140‑1 (MQ=255) cATAATGGGGCATATGGTTTCTGGTTATAATCCATATCAGATTGCTGAAGTTCTGGATATGGATATCCGTAGCATCTACGCGTACAAGCAACGAATCGAAAAGAGAATGGGTGGTAAAATAAACGAATTATTTATTCGtt < 1:1695115/140‑1 (MQ=255) cATAATGGGGCATATGGTTTCTGGTTATAATCCATATCAGATTGCTGAAGTTCTGGATATGGATATCCGTAGCATCTACGCGTACAAGCAACGAATCGAAAAGAGAATGGGTGGTAAAATAAACGAATTATTTATTCGtt > 1:1543881/1‑140 (MQ=255) tAATGGGGCATATGGTTTCTGGTTATAATCCATATCAGATTGCTGAAGTTCTGGATATGGATATCCGTAGCATCTACGCGTACAAGCAACGAATCGAAAAGAGAATGGGTGGTAAAATAAACGAATTATTTATTCGTTca > 1:1308428/1‑140 (MQ=255) ggggCATATGGTTTCTGGTTATAATCCATATCAGATTGCTGAAGTTCTGGATATGGATATCCGTAGCATCTACGCGTACAAGCAACGAATCGAAAAGAGAATGGGTGGTAAAATAAACGAATTATTTATTCGTTCACAtt < 2:164971/140‑1 (MQ=255) ggggCATATGGTTTCTGGTTATAATCCATATCAGATTGCTGAAGTTCTGGATATGGATATCCGTAGCATCTACGCGTACAAGCAACGAATCGAAAAGAGAATGGGTGGTAAAATAAACGAATTATTTATTCGTTCACAtt < 2:1469674/140‑1 (MQ=255) ggggCATATGGTTTCTGGTTATAATCCATATCAGATTGCTGAAGTTCTGGATATGGATATCCGTAGCATCTACGCGTACAAGCAACGAATCGAAAAGAGAATGGGTGGTAAAATAAACGAATTATTTATTCGTTCACAtt < 1:2230744/140‑1 (MQ=255) gggCATATGGTTTCTGGTTATAATCCATATCAGATTGCTGAAGTTCTGGATATGGATATCCGTAGCATCTACGCGTACAAGCAACGAATCGAAAAGAGAATGTGTGGTAAGATATACGAATTATGTATTCGTTCACATTc > 1:743062/1‑140 (MQ=255) | CAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTCACCATAATGGGGTATATGGTTTCTGGTTATAATCCATATCAGATTGCTGAAGTTCTGGATATGGATATCCGTAGCATCTACGCGTACAAGCAACGAATCGAAAAGAGAATGGGTGGTAAAATAAACGAATTATTTATTCGTTCACATTC > NC_000913/2987882‑2988155 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |