| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,676,025 | G→A | V414M (GTG→ATG) | yhjE → | putative transporter YhjE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,676,025 | 0 | G | A | 98.9% | 592.9 / NA | 177 | V414M (GTG→ATG) | yhjE | putative transporter YhjE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base A (81/93); total (84/93) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.21e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
TTACCAGAGCTGTTTCCGACAGAAGTGCGTTACACCGGAGCATCGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACGGGCTAGGTGCGGTGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCCTGCTGCTGACCCATGAGACGCGACATCAGTCGTTGTAATAAGAGTGAAAAGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTGAATTTCCATACAA > NC_000913/3675893‑3676161 | ttACCAGAGCTGTTTCCGACAGAAGTGCGTTACACCGGAGCATCGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACGGGCTAGGTGCGATGGGGtt < 2:546265/140‑1 (MQ=255) agagCTGTTTCCGACAGAAGTGCGTTACACCGGAGCATCGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACGGGCTAGGTGCGATGGGGTTATATc > 1:1698322/1‑140 (MQ=255) agCTGTTTCCGACAGAAGTGCGTTACACCGGAGCATCGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACGGGCTAGGTGCGATGGGGTTATATCTg > 2:1670747/1‑140 (MQ=255) agCTGTTTCCGACAGAAGTGCGTTACACCGGAGCATCGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACGGGCTAGGTGCGATGGGGTTATATCTg > 2:1791746/1‑140 (MQ=255) tGTTTCCGACAGAAGTGCGTTACACCGGAGCATCGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCGTGGTTGCACACTAATTCCGGGCTAGCTGCGGAGGGGTTAGATCTggcg > 2:1216378/1‑140 (MQ=255) tGTTTCCGACAGAAGTGCGTTACACCGGAGCATCGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACGGGCTAGGTGCGATGGGGTTATATCTggcg > 1:102793/1‑140 (MQ=255) tGTTTCCGACAGAAGTGCGTTACACCGGAGCATCGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACGGGCTAGGTGCGATGGGGTTATATCTggcg > 1:424190/1‑140 (MQ=255) tGTTTCCGACAGAAGTGCGTTACACCGGAGCATCGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACGGGCTAGGTGCGATGGGGTTATATCTggcg > 1:1368640/1‑140 (MQ=255) tGTTTCCGACAGAAGTGCGTTACACCGGAGCATCGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCATGGTTGCAAACTGACTTCGGGCTAGGTGCGGTGGGGTTATATCTggcg > 2:804887/1‑140 (MQ=255) tttCCGACAGAAGTGCGTTACACCGGAGCATCGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTCACTACGGGCTAAGTACGATGGTGTTATATCTggcggc > 1:679143/1‑140 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tCGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACAGGCTAGGTGCGATGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCctgct > 1:1323293/1‑140 (MQ=255) cGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACGGGCTAGGTGCGATGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCctgctg < 2:1698322/140‑1 (MQ=255) cGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGCTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACGGGCTAGGTGCGATGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCctgctg < 1:221930/140‑1 (MQ=255) gTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACGGGCTAGGTGCGATGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCctgctgc < 2:1525821/140‑1 (MQ=255) ttCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACGGGCTAGGTGCGATGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCctgctgct < 1:1670747/140‑1 (MQ=255) ttCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACGGGCTAGGTGCGATGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCctgctgct > 1:2031288/1‑140 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1:1003304/140‑1 (MQ=255) tAGGTGCGATGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCCTGCTGCTGACCCATGAGACGCGACATCAGTCGTTGTAATAAGAGTGAAAAGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTGAATTTCCa < 2:2031288/140‑1 (MQ=255) aGGTGCGATGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCCTGCTGCTGACCCATGAGACGCGACATCAGTCGTTGTAATAAGAGTGAAAAGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTGAATTTCCAt > 1:1553499/1‑140 (MQ=255) gTGCGATGGGGTTATCTCTGGCCGCCATGTCTGGCTTAACGTTAATCGCCCTGCTGCTGACCCATGAGACGCGACATCAGTCGTTGTAATAAGAGTGAAAAGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTGAATTTCCATAc < 1:742773/140‑1 (MQ=255) gTGCGATGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCCTGCTGCTGACCCATGAGACGCGACATCAGTCGTTGTAATAAGAGTGAAAGGCCCGATGCGCTACGCCTATCAGGCCTGAATTTCCATAc > 2:1003304/1‑140 (MQ=255) gTGCGATGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCCTGCTGCTGACCCATGAGACGCGACATCAGTCGTTGTAATAAGAGTGAAAAGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTGAATTTCCATAc > 1:39917/1‑140 (MQ=255) gTGCGATGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCCTGCTGCTGACCCATGAGACGCGACATCAGTCGTTGTAATAAGAGTGAAAAGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTGAATTTCCATAc < 2:1455226/140‑1 (MQ=255) gTGCGATGGGGTTATATCTGGCCGCGATGGCGGGCCTGACGTTAATCGCCCTGCTGCTGACCCATGAGACGCGACATCAGTCGTTGTAATAAGAGTGAAAAGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTGAATTTCCATAc < 2:935233/140‑1 (MQ=255) tGCGATGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCCTGCTGCTGACCCATGAGACGCGACATCAGTCGTTGTAATAAGAGTGAAAAGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTGAATTTCCATACa < 2:402103/140‑1 (MQ=255) gCGATGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCCTGCTGCTGACCCATGAGACGCGACATCAGTCGTTGTAATAAGAGTGAAAAGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTGAATTTCCATACaa < 2:2349592/140‑1 (MQ=255) | TTACCAGAGCTGTTTCCGACAGAAGTGCGTTACACCGGAGCATCGTTCTCTTACAACGTAGCGTCGATTCTCGGGGCTTCCGTTGCGCCATATATCGCAGCCTGGTTGCAGACTAACTACGGGCTAGGTGCGGTGGGGTTATATCTGGCGGCGATGGCTGGCTTGACGTTAATCGCCCTGCTGCTGACCCATGAGACGCGACATCAGTCGTTGTAATAAGAGTGAAAAGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTGAATTTCCATACAA > NC_000913/3675893‑3676161 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |