| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,854,090 | G→A | G57S (GGT→AGT) | emrD → | multidrug efflux pump EmrD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,854,090 | 0 | G | A | 99.2% | 400.7 / NA | 119 | G57S (GGT→AGT) | emrD | multidrug efflux pump EmrD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (71/47); minor base T (1/0); total (72/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GATGTTGGTATTACTCGTGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGATTGCCG > NC_000913/3853954‑3854225 | gATGTTGGTATTACTCGTGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAgtg < 2:1347351/140‑1 (MQ=255)gATGTTGGTATTACTCGTGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAgtg > 2:2427444/1‑140 (MQ=255) aTGTTGGTATTACTCGTGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAgtgt > 2:1931517/1‑140 (MQ=255) gTTGGTATTACTCGTGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGtct < 1:2010085/140‑1 (MQ=255) gTTGGTATTACTCGTGCCCGTCGGTCAGATGCCGCCAACTATTTATATACCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGtct < 2:1072913/140‑1 (MQ=255) tGGTATTACTCGTGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTca < 2:1407325/140‑1 (MQ=255) tGGTATTACTCGTGGCCCTCGGTCAGATGGCGCAACCCACTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTca < 2:973368/140‑1 (MQ=255) ggTATTACTCGTGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGTGCGAAATGGGCGCTTAGCTGCGGACTTACAGTGTCTcac > 2:697249/1‑140 (MQ=255) ggTATTACTCGTGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTcac > 1:1676589/1‑140 (MQ=255) ggTATTACTCGTGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGGAATGGGCGCTTAGCTGCCGACTTACAGTGTCTcac > 2:796485/1‑140 (MQ=255) tATTACTCGTGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAg < 2:559330/140‑1 (MQ=255) ttACTCGTGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCt < 1:2427444/140‑1 (MQ=255) tACTCGTGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTg > 1:1653111/1‑140 (MQ=255) gTGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTa > 1:1430180/1‑140 (MQ=255) tGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTAt > 1:455704/1‑140 (MQ=255) tGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTACAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTAt > 2:483562/1‑140 (MQ=255) ggCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCTTAATGGGCGCTTATCTACTGACTTAAAGTGACTCACAGCTGTTTTATg > 2:900014/1‑140 (MQ=255) ggCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATg > 2:1730665/1‑140 (MQ=255) ggCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATg > 1:1398551/1‑140 (MQ=255) gCCGTCGGTCAGATGGCCCAAACCATTTATATTCCCGCTATTGCCGATGTGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATgg < 2:1004486/140‑1 (MQ=255) cGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGcc < 2:1870595/140‑1 (MQ=255) cGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGcc < 1:1931517/140‑1 (MQ=255) cGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGcc < 1:1730665/140‑1 (MQ=255) tCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCGGCTGACTTACAGTGCCTCACACCTGTTTTATGGCCCg > 1:888779/1‑140 (MQ=255) gTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGCCTTCTAGTGTCTCACAGCAGTTTTATCGCCCGAtt > 2:1136552/1‑140 (MQ=255) aTGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGtttt > 2:407528/1‑124 (MQ=255) gcgcAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACTGTGTCTCTCAGATGTTTTATGCCCCGATTTCCGACcg > 1:847457/1‑140 (MQ=255) cgcAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACcgc > 2:1278191/1‑140 (MQ=255) gcAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACcgcg > 1:2469650/1‑140 (MQ=255) aTTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGgccg < 1:2258797/140‑1 (MQ=255) ttATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGgccgcc > 1:2440672/1‑140 (MQ=255) ttATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGgccgcc > 2:2148218/1‑140 (MQ=255) tataTTCCAGCTATTGCCGATAGGGCGCGCGTTCTCAACGTCCGTGAATGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGccgccg < 2:948968/140‑1 (MQ=255) atatTCCAGCTATTGTCGATATAGCTCGCTATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGa < 1:1136552/140‑1 (MQ=255) ttCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGgccgcc < 2:353928/135‑1 (MQ=255) ttCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGgccgcc > 2:2116721/1‑135 (MQ=255) ttCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGgccgcc > 1:353928/1‑135 (MQ=255) ttCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGgccgcc < 1:2116721/135‑1 (MQ=255) ccAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGTCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGt > 1:1910233/1‑140 (MQ=255) ccAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCggg > 2:1614356/1‑139 (MQ=255) ccAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCggg > 1:2116784/1‑139 (MQ=255) ccAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCgg > 2:2286827/1‑139 (MQ=255) ccAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCgg < 1:2286827/139‑1 (MQ=255) ccAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGt > 1:1797928/1‑140 (MQ=255) ccAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGt > 1:2212645/1‑140 (MQ=255) ccAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGt > 1:450628/1‑140 (MQ=255) cAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTg > 2:2181603/1‑140 (MQ=255) gCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACTGCTGTTTTATGGACCGATTTCCGACGGCGTAGGCCGCCGACCGGTGAt > 2:767200/1‑140 (MQ=255) gCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTTTGGCCCGGGTTCCGACAGCGGAAGCCGCCGACC‑GTGATc > 2:1156802/1‑140 (MQ=255) gCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATTGCCCGATGTCCAACTGCGTGGACCGCCGACCGGTGAt > 1:711484/1‑140 (MQ=255) gCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGAt < 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atatGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGa < 1:1278191/140‑1 (MQ=255) gcgcgcGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTc < 1:2399208/140‑1 (MQ=255) cgcgcgATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTcc > 2:1537474/1‑140 (MQ=255) cgcgcgATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTcc > 1:2107821/1‑140 (MQ=255) cgcgATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCAt > 2:2129672/1‑140 (MQ=255) gcgATCTCAACGTCCTTGAAGGTGCTGTGAAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCAtt < 1:919737/140‑1 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2:1269860/1‑140 (MQ=255) cGGTGCAGAGCGTAATCGGCGCTTATCTGCTTACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTcgcg < 2:1090499/140‑1 (MQ=255) gTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCCACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGt > 1:194272/1‑140 (MQ=255) tGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTc < 1:1111493/140‑1 (MQ=255) gCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGAcc < 1:1483976/140‑1 (MQ=255) cGTAATGGGCGCTTACCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCATGACCt < 1:960261/140‑1 (MQ=255) gTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTc < 1:1644815/140‑1 (MQ=255) gTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTc < 2:1965097/140‑1 (MQ=255) gcgcTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTg > 1:325165/1‑140 (MQ=255) cgcTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGa > 1:1865189/1‑140 (MQ=255) cgcTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGa < 1:457835/140‑1 (MQ=255) gcTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGTTGGCAACACTGTTCGCGGTCAGGACCTCCAGTTTGAc > 1:646777/1‑140 (MQ=255) gcTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGAc > 2:1761292/1‑140 (MQ=255) cTTATCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACg < 2:2469650/140‑1 (MQ=255) aTCTGCTGACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGgtg < 1:1537474/140‑1 (MQ=255) tgctgACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTg > 1:264978/1‑140 (MQ=255) ctgACTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCCCGCCCTCCAGTTTGACGGTGTTGAt > 1:862452/1‑140 (MQ=255) aCTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGATTgc > 1:1653515/1‑140 (MQ=255) aCTTACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGATCGCGGTAACGACCGCCAGTTGGACGGTGTTGATTgc > 1:716962/1‑140 (MQ=255) ttACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGAtt < 2:1785833/136‑1 (MQ=255) ttACAGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGAtt > 1:1785833/1‑136 (MQ=255) | GATGTTGGTATTACTCGTGGCCGTCGGTCAGATGGCGCAAACCATTTATATTCCAGCTATTGCCGATATGGCGCGCGATCTCAACGTCCGTGAAGGGGCGGTGCAGAGCGTAATGGGCGCTTATCTGCTGACTTACGGTGTCTCACAGCTGTTTTATGGCCCGATTTCCGACCGCGTGGGCCGCCGACCGGTGATCCTCGTCGGAATGTCCATTTTTATGCTGGCAACGCTGGTCGCGGTCACGACCTCCAGTTTGACGGTGTTGATTGCCG > NC_000913/3853954‑3854225 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |