| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,890,443 | G→A | G70S (GGC→AGC) | tnaB → | tryptophan:H(+) symporter TnaB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,890,443 | 0 | G | A | 99.7% | 1178.5 / NA | 335 | G70S (GGC→AGC) | tnaB | tryptophan:H(+) symporter TnaB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (158/176); minor base C (0/1); total (158/177) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
GTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAA > NC_000913/3890306‑3890578 | tggAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCt < 2:1286117/140‑1 (MQ=255) tggAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCt < 2:2111467/140‑1 (MQ=255) tggAGGTACGTTTGCTACACCTGTTGATCTTCCCGTTGCATGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCt < 2:1178619/140‑1 (MQ=255) gAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTcc < 1:498434/140‑1 (MQ=255) gAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTcc < 2:270958/140‑1 (MQ=255) gAGGTATGTTTGCTTTAACTGTTGATCTTGCGGGTTCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTcc < 2:1075200/140‑1 (MQ=255) aGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCa > 1:1319321/1‑140 (MQ=255) aGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCa > 1:392880/1‑140 (MQ=255) aGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCa > 2:567248/1‑140 (MQ=255) aGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCa > 1:1607141/1‑140 (MQ=255) ggTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAg > 2:1695213/1‑140 (MQ=255) gTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGt > 2:2167553/1‑140 (MQ=255) aTGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTAATAGAAGCTAATGTAGATTATCGCGTCAGCTCCAGttt > 1:740507/1‑140 (MQ=255) gTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTa > 1:2258076/1‑140 (MQ=255) tttACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTaa < 1:358291/135‑1 (MQ=255) tttACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTaa > 2:358291/1‑135 (MQ=255) tttACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCa > 2:370315/1‑140 (MQ=255) tttACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCa > 1:2137624/1‑140 (MQ=255) ttACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCAt > 1:1285139/1‑140 (MQ=255) tGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAaca > 2:394854/1‑128 (MQ=255) tGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCa < 1:568782/137‑1 (MQ=255) tGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCCTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGGCAGGTCGAGTTTTCACACCATCACCAAAg > 1:834086/1‑140 (MQ=255) ttGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTa < 2:1607141/140‑1 (MQ=255) tGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTaa > 2:1135232/1‑140 (MQ=255) tGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTa > 1:19899/1‑140 (MQ=255) tGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTa > 2:1946865/1‑140 (MQ=255) gCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTaa < 2:19899/140‑1 (MQ=255) ccTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAac > 1:546376/1‑140 (MQ=255) ggTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGt < 2:68981/134‑1 (MQ=255) ggTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACAcc < 1:235120/140‑1 (MQ=255) ggTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACAcc < 2:2080366/140‑1 (MQ=255) ggTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTACTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCAACATCAAAGAATTAATCGGTAACAcc > 1:668576/1‑140 (MQ=255) ttttCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTgg < 1:1459871/140‑1 (MQ=255) ttCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTGTAAGACCGTCACCAAAAATTTAATCGGTAACACCTGGaa > 2:656487/1‑140 (MQ=255) gggTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTa > 2:493147/1‑140 (MQ=255) gggTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTa > 1:1729743/1‑140 (MQ=255) tGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCa < 2:2239647/140‑1 (MQ=255) tGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCa < 2:2017505/140‑1 (MQ=255) gCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAg < 2:309717/140‑1 (MQ=255) gCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAg < 1:1946865/140‑1 (MQ=255) gCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTAATAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAg < 1:2064893/140‑1 (MQ=255) ccTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGc > 2:471115/1‑140 (MQ=255) ccTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGc > 2:2398370/1‑140 (MQ=255) ccTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGc < 1:2302419/140‑1 (MQ=255) tATCCTTTTCATTGCTTGGTTTTCATTGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTa < 1:1218295/140‑1 (MQ=255) tATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCg > 1:531864/1‑140 (MQ=255) aTCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGt > 2:2258261/1‑140 (MQ=255) aTCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGt > 1:1562739/1‑140 (MQ=255) tCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAAACGGTAACACCTCGAGCATTATGAGCGGTATTACCGtt > 1:759290/1‑140 (MQ=255) tGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCt < 1:2277405/140‑1 (MQ=255) tGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCt > 2:1890614/1‑140 (MQ=255) tGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCt < 1:1907091/140‑1 (MQ=255) tGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCCGTACCACATGGAACATTATCACCGGTATTACCGTTGCCt > 2:841697/1‑140 (MQ=255) tGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATT‑TTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCtt > 1:2090237/1‑140 (MQ=255) cTGGTTTTCAATGCTTCTTTCCCGGTTATTGCTATGAGAAGCAAATTTCAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCg < 2:753071/140‑1 (MQ=255) cTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATTGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCg < 1:1695213/140‑1 (MQ=255) cTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCg < 2:1551566/140‑1 (MQ=255) cTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCg < 2:132794/140‑1 (MQ=255) cTGATTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCC‑GTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGt < 2:2289113/140‑1 (MQ=255) tGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGt < 1:471115/140‑1 (MQ=255) tGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGt < 1:1029468/140‑1 (MQ=255) tGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGt < 2:1256737/140‑1 (MQ=255) tGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTCATTCGAACCAAATTTATATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGt < 2:759290/140‑1 (MQ=255) ggTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGtt < 1:1081831/140‑1 (MQ=255) ggTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGtt < 1:88245/140‑1 (MQ=255) ggTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATCACCGTTGCCTTCGtt > 1:63222/1‑140 (MQ=255) ggTTTTCAATGCTTCATTCCGGATTATTGCTATTAGAGGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGtt < 1:1174074/140‑1 (MQ=255) gTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTtc > 1:1494101/1‑140 (MQ=255) gTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTtc > 2:579320/1‑140 (MQ=255) ttttCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTtct > 2:1389058/1‑140 (MQ=255) tttCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTtctc < 2:531864/140‑1 (MQ=255) aaTGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCtata > 1:384272/1‑140 (MQ=255) gCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATcc < 1:1389058/140‑1 (MQ=255) ttCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTc < 2:1802363/140‑1 (MQ=255) aTTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACt < 1:1543055/140‑1 (MQ=255) ttCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACtt < 1:2398370/140‑1 (MQ=255) ttCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACtt < 1:2191757/140‑1 (MQ=255) ttCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACtt < 1:420756/140‑1 (MQ=255) ttCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACtt < 1:67119/140‑1 (MQ=255) ggTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGcc < 1:319420/140‑1 (MQ=255) ggTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGcc < 1:2040117/140‑1 (MQ=255) ggTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTACCTGCGATCTCTAAATCCTCACTTATGcc > 1:955086/1‑140 (MQ=255) attattgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTctct < 2:433277/121‑1 (MQ=255) attgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCtata > 2:1481716/1‑140 (MQ=255) tgttattAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATAtc < 1:1858955/140‑1 (MQ=255) attaGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCTTTCGTTCACTATATACTCACTGATGCCTATATCTCTg > 1:683807/1‑140 (MQ=255) attaGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACtt < 1:605571/125‑1 (MQ=255) attaGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACtt > 2:605571/1‑125 (MQ=255) attaGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTg > 1:449740/1‑140 (MQ=255) ttaGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGc > 2:1733536/1‑140 (MQ=255) gAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTaa < 1:27288/140‑1 (MQ=255) aGCAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGGCTATATCTCTGCTAATg < 2:66972/140‑1 (MQ=255) cAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCt > 2:797674/1‑123 (MQ=255) cAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGt < 2:449740/140‑1 (MQ=255) cAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGt < 1:1513945/140‑1 (MQ=255) cAAATTTAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGt < 1:2487171/140‑1 (MQ=255) ttAAATTATCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGAt < 2:2342563/140‑1 (MQ=255) tCCCGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGAt < 2:2088245/132‑1 (MQ=255) cccGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGt > 1:1783209/1‑126 (MQ=255) cccGTCAGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGa > 2:94707/1‑140 (MQ=255) | GTGGAGGTATGTTTGCTTTACCTGTTGATCTTGCCGGTGCCTGGTTTTTCTGGGGTGCCTTTATCCTTATCATTGCCTGGTTTTCAATGCTTCATTCCGGGTTATTGTTATTAGAAGCAAATTTAAATTATCCCGTCGGCTCCAGTTTTAACACCATCACCAAAGATTTAATCGGTAACACCTGGAACATTATCAGCGGTATTACCGTTGCCTTCGTTCTCTATATCCTCACTTATGCCTATATCTCTGCTAATGGTGCGATCATTAGTGAAA > NC_000913/3890306‑3890578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |