| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,007,246 | C→T | G461G (GGC→GGT) | recQ → | ATP‑dependent DNA helicase RecQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,007,246 | 0 | C | T | 99.2% | 402.3 / NA | 118 | G461G (GGC→GGT) | recQ | ATP‑dependent DNA helicase RecQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (54/63); minor base G (1/0); total (55/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGCCCGGTGCTGCGCGGCGAATCCT > NC_000913/4007109‑4007382 | aGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGAt > 1:314698/1‑140 (MQ=255) aTTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATaa < 1:1389620/140‑1 (MQ=255) gCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATAACAAACTGAAACTCGATGGCACGGGTCGTGATAAAAg > 1:1146254/1‑140 (MQ=255) cccTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGc < 1:2076142/140‑1 (MQ=255) cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTTTGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCa < 2:556936/140‑1 (MQ=255) cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCa < 2:314698/140‑1 (MQ=255) cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCa < 1:612062/140‑1 (MQ=255) cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCa < 1:327495/140‑1 (MQ=255) cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCAGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCa < 2:1645755/140‑1 (MQ=255) cTTTCCACCATTGGTCCGGTGAATCAGCGGTTTGGCATGGGTTATGTGTTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCa < 2:1146254/140‑1 (MQ=255) ttCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCa < 2:2168880/138‑1 (MQ=255) ttCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATg < 1:2057491/140‑1 (MQ=255) ttCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATg < 1:1488571/140‑1 (MQ=255) ccaccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATaa < 1:2043124/130‑1 (MQ=255) ccaccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATaa > 2:2043124/1‑130 (MQ=255) ccaccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGaa > 2:2252869/1‑140 (MQ=255) ccaccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGaa > 1:1425340/1‑140 (MQ=255) ccaccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGGCATGACAAACTGAAAGGCTATGGCAGGGGTAGTGATAAAAGCCATGaa > 2:650097/1‑140 (MQ=255) cccaTTGGTCGTGTGTATCAGCGGTTTGGTATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACa < 1:972272/139‑1 (MQ=255) caTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACAtt > 2:1393194/1‑140 (MQ=255) caTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGCGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACAtt < 2:349303/140‑1 (MQ=255) aTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTg > 2:1550035/1‑140 (MQ=255) ttGGTCGTGTGAATCAGTGGTTTGGGATGGGCTATGTGGAGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTgg < 2:781158/140‑1 (MQ=255) ttGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTgg > 1:1880004/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTggg > 2:1897526/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTggg < 2:361607/140‑1 (MQ=255) ggTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGt < 1:1474851/140‑1 (MQ=255) gTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTggg > 1:1948536/1‑138 (MQ=255) gTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTggg < 2:1948536/138‑1 (MQ=255) gTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTg > 1:185912/1‑140 (MQ=255) tgtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCg > 2:2332513/1‑140 (MQ=255) tgtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCg > 2:1888075/1‑140 (MQ=255) tgtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGAGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCg > 1:547841/1‑140 (MQ=255) tgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTg > 1:259324/1‑140 (MQ=255) tgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTg > 1:312326/1‑140 (MQ=255) tgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTAATAAAAACCATGAACATTGGGTGAGCGTg > 1:1022355/1‑140 (MQ=255) tCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATcc > 1:2028867/1‑140 (MQ=255) cGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCa < 2:2097266/140‑1 (MQ=255) gTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGc < 1:1369707/140‑1 (MQ=255) gTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGc < 1:2119238/140‑1 (MQ=255) gggATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGAt < 1:50125/140‑1 (MQ=255) ggATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGAtt < 2:2004885/140‑1 (MQ=255) tggtggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTg < 1:1608305/140‑1 (MQ=255) tggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTg > 2:2008910/1‑140 (MQ=255) tggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTg > 2:138524/1‑140 (MQ=255) tggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTg > 2:2128188/1‑140 (MQ=255) aGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGc < 1:138524/140‑1 (MQ=255) gTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCa < 1:2344892/140‑1 (MQ=255) gATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCaaa > 2:491503/1‑140 (MQ=255) tCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAata < 2:2028867/140‑1 (MQ=255) gtgCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGcc < 1:2252869/140‑1 (MQ=255) gtgCTAATAACCAGCATATCCGTGACTATAGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGcc < 1:686203/140‑1 (MQ=255) cTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAg > 2:1316271/1‑140 (MQ=255) aataaCCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCa > 1:198132/1‑140 (MQ=255) aataaCCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCATGGTGACGCTAAATATTGCCCAGCa > 1:1027344/1‑140 (MQ=255) aaCCAGCGTATCCGCTACTATGCTCCTGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTc < 1:810769/140‑1 (MQ=255) aaCCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTc < 1:491503/140‑1 (MQ=255) ccAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTg < 2:1242162/140‑1 (MQ=255) aGCGTATCCGCGACTTTGGTCAGGACAAAGTGAAAGTTTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGcc < 1:831534/140‑1 (MQ=255) aGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGcc < 2:2169478/140‑1 (MQ=255) gCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGccc > 1:452677/1‑140 (MQ=255) gCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACATCGACCTAGTGACGCACAATACTGCCCAGCATTCTGccc > 2:831534/1‑140 (MQ=255) cGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTc > 2:333471/1‑134 (MQ=255) cGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTc < 1:333471/134‑1 (MQ=255) cGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCt < 1:1888075/140‑1 (MQ=255) cGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCGCGGCCAGCAGACGCAAAATATGTCCCAGCATTCTGCCCt > 2:1151952/1‑140 (MQ=255) tATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCCGCCAGGTGACGCAAAATATTGGCCAGCATTCTGCCCTAc > 2:1109115/1‑140 (MQ=255) tATCCGCGACTATGGCCATGACAAATTGACAGTCTATAGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTAc < 1:650097/140‑1 (MQ=255) tCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGcc > 1:1954556/1‑134 (MQ=255) tCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACaa < 2:333139/140‑1 (MQ=255) aCTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACa > 1:107028/1‑140 (MQ=255) aTGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACagag > 2:2371706/1‑140 (MQ=255) tGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAGAATATTGACCAGCAATCTGCCCTACAACTGACAGAgg > 1:884882/1‑140 (MQ=255) ggTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGc > 2:1898815/1‑140 (MQ=255) cATGACAAACTGAAAGTTTATGCCATGGGTCGTGAAAAACGCCATGAAAATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCcgc < 2:904145/140‑1 (MQ=255) aTGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTACCCGGCATTCTGACCTAAAACTGACAGAGGCcgcg > 2:859570/1‑140 (MQ=255) gACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCcgcgcg > 1:242450/1‑140 (MQ=255) gACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCcgcgcg > 2:86401/1‑140 (MQ=255) gACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCcgcgcg > 1:495523/1‑140 (MQ=255) aCAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCgcgcgc > 1:1987830/1‑140 (MQ=255) cAAACTGAAAGTCTATGTCATGGGTCGTGATAAAAGCCACGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGcc < 2:1022355/140‑1 (MQ=255) cAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGcc < 2:259324/140‑1 (MQ=255) cAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGcc < 1:1550035/140‑1 (MQ=255) cAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGcc < 2:198132/140‑1 (MQ=255) cAAACTGAAAGTCTATGCCATGTGTCGTGATTAAACCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGcc < 2:1027344/140‑1 (MQ=255) aaaCTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACagag < 2:2385155/129‑1 (MQ=255) aaaCTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACagag > 1:2385155/1‑129 (MQ=255) aaCTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTTGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGCCCg < 1:2050404/140‑1 (MQ=255) aCTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGCCCgg > 2:607374/1‑140 (MQ=255) aCTGAAAGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCACCATTCTGTCCTGCATCTGACAGAGGCCGCGCGCCCgg > 1:1063788/1‑140 (MQ=255) aaGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCcgc < 1:1230549/127‑1 (MQ=255) aaGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCcgc > 2:1230549/1‑127 (MQ=255) aGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGCCCGGtgctgc < 1:2371706/140‑1 (MQ=255) aGTCTATGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGCCCGGtgctgc > 1:583305/1‑140 (MQ=255) aTGGCATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGCCCGGTGCTGCgcggc > 1:1556025/1‑140 (MQ=255) cATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGCCCGGTGCTGCGCGGCGAAt < 1:1897526/140‑1 (MQ=255) cATGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGCCCGGTGCTGCGCGGCGAAt < 2:583305/140‑1 (MQ=255) aTGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGCCCGGTTCTGCGCGGCGAATc < 2:1556025/140‑1 (MQ=255) aTGGGTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGCCCGGTGCTGCGCGGCGAATc < 1:1316271/140‑1 (MQ=255) gggTCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGCCCGGTGCTGCGCGGCGAATCct > 2:2159346/1‑140 (MQ=255) | GCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATTCACCTCGGCCTGGTGACGCAAAATATTGCCCAGCATTCTGCCCTACAACTGACAGAGGCCGCGCGCCCGGTGCTGCGCGGCGAATCCT > NC_000913/4007109‑4007382 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |