| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 479,422 | A→G | V166A (GTC→GCC) | maa ← | maltose O‑acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 479,422 | 0 | A | G | 99.5% | 654.0 / ‑5.2 | 186 | V166A (GTC→GCC) | maa | maltose O‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (104/81); total (105/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
GAACACCCTATTTTAACGTGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGACATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGATGGTGACGGGTTTCCCCAGTTCAGCACCGCTATT > NC_000913/479285‑479558 | acacCCTATTTTAACGTGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATc > 1:1443092/1‑140 (MQ=255) cacCCTATTTTAACGTGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCt > 2:587652/1‑140 (MQ=255) cacCCTATTCTAACGTGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCt < 2:1443092/140‑1 (MQ=255) ccTATTTTAACGTGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCtttt > 2:9331/1‑140 (MQ=255) ttttAACGTGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGa > 2:2267940/1‑140 (MQ=255) tttAACGTGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCt > 1:1999635/1‑132 (MQ=255) tttAACGTGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCt < 2:1999635/132‑1 (MQ=255) aCGTGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACt < 1:419799/140‑1 (MQ=255) cGTGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTg > 1:1898412/1‑140 (MQ=255) cGTGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTCTCTGGGGCAGCTTTTGTGACAACTg > 1:1209921/1‑140 (MQ=255) tGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTtgtg < 2:392997/131‑1 (MQ=255) tGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTtgtg > 1:392997/1‑131 (MQ=255) tGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCa > 1:2337086/1‑140 (MQ=255) ggAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGa < 1:1398173/130‑1 (MQ=255) ggAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACt > 1:198119/1‑135 (MQ=255) ggAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCAcc > 2:1950214/1‑140 (MQ=255) ggAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCAcc > 1:2188813/1‑140 (MQ=255) gAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCt < 2:2054248/140‑1 (MQ=255) gAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCt < 2:2246995/140‑1 (MQ=255) agtagAGGGGAAGTATCAGATCTACAACACTTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAgg < 1:1090569/140‑1 (MQ=255) agtagAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAgg < 2:1343053/140‑1 (MQ=255) gtagAGGGGAAGCAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGc > 2:551203/1‑140 (MQ=255) tagAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCt < 2:45981/134‑1 (MQ=255) gagGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTAc > 1:118957/1‑140 (MQ=255) agGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTACGGGGCATCTTGTGCGACAACAGCACCTGAGGCTAcc > 1:1043110/1‑140 (MQ=255) ggggAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCa > 1:396996/1‑140 (MQ=255) ggggAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCa > 1:2085240/1‑140 (MQ=255) gggAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACt > 1:600289/1‑123 (MQ=255) gggAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCac > 1:1407719/1‑140 (MQ=255) ggAAGTAACAGATCTGCCACAATTTAGCAAAACAGTTCCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCacg < 1:1055933/140‑1 (MQ=255) ggAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCacg < 2:1294542/140‑1 (MQ=255) ggAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCacg < 1:2277655/140‑1 (MQ=255) gAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGTATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGAGCATCTTATGTGACAACTGCAGCTGAGGCTACCacga > 1:759575/1‑140 (MQ=255) gAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTa > 1:502204/1‑134 (MQ=255) gAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCacga > 2:1967086/1‑140 (MQ=255) gTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCt < 2:291800/124‑1 (MQ=255) gTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCac < 1:165653/135‑1 (MQ=255) gTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGt > 1:1253902/1‑140 (MQ=255) tAACAGATCTACCACAAGTTTGTATAACAGGTGAGGAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGtt < 2:1203097/140‑1 (MQ=255) aCAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTAAGGCTACCACGACGTTAt < 2:408927/140‑1 (MQ=255) tCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCa > 2:1851331/1‑140 (MQ=255) cTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGTACCTGATGCTACCACGACGTTATCACCaa > 1:1109007/1‑140 (MQ=255) tACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGTGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAAt > 2:1897960/1‑140 (MQ=255) aCCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCacgac > 1:182190/1‑127 (MQ=255) aCCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCa > 1:1519754/1‑137 (MQ=255) aCCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATg > 1:344282/1‑140 (MQ=255) aCCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCCGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCa < 2:1519754/137‑1 (MQ=255) cacaATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGt < 1:584382/140‑1 (MQ=255) cacaATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGt < 1:1922105/140‑1 (MQ=255) cacaATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGt < 2:339222/140‑1 (MQ=255) cacaATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGt < 2:610866/140‑1 (MQ=255) acaATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTc > 2:228492/1‑140 (MQ=255) caATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTca > 1:2035776/1‑140 (MQ=255) aTTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTca > 1:1957341/1‑138 (MQ=255) ttttGCATAACAGTTGTCAAAAACCGATTACCATTCTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCacac < 2:1109007/140‑1 (MQ=255) ttttGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCacac < 2:1771748/140‑1 (MQ=255) ttttGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCacac > 1:2334456/1‑140 (MQ=255) ttttGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCacac > 2:2136675/1‑140 (MQ=255) ttttGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCacac > 1:1569293/1‑140 (MQ=255) ttttGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGACTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACAACTACGTTAACACCAATGGTCacac > 1:826385/1‑140 (MQ=255) ttGCATAACAGTTGCGTCAAACCGATTACAATTGTCTAACTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCa < 2:1067594/140‑1 (MQ=255) ttGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTcaca < 2:1313700/137‑1 (MQ=255) ttGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTcaca > 1:1313700/1‑137 (MQ=255) ttGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCa < 2:2035776/140‑1 (MQ=255) ttGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCa < 1:2252819/140‑1 (MQ=255) tGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAg > 1:148172/1‑140 (MQ=255) cAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACTTTATCACCAATGGGCACACCAGGGTTAAt > 1:939835/1‑140 (MQ=255) cAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTa < 2:2462540/138‑1 (MQ=255) cAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTa > 1:2462540/1‑138 (MQ=255) gTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTCATCACCGATGGTCTCACCAGGGTTAATGa > 1:1044756/1‑140 (MQ=255) ttGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCacac > 1:1623329/1‑127 (MQ=255) ttGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCa > 1:1335969/1‑129 (MQ=255) ttGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGAc > 1:1502914/1‑140 (MQ=255) gCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAAt > 1:432580/1‑135 (MQ=255) aaaaaCCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACGAATGGTCACACCAGGGTTAATGACcgcgc > 1:743232/1‑140 (MQ=255) aaCCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTc > 1:294294/1‑140 (MQ=255) cGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGc < 2:2473755/140‑1 (MQ=255) cGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGc < 1:275471/140‑1 (MQ=255) aaTTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCa < 2:13775/140‑1 (MQ=255) aaTTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCa < 1:9331/140‑1 (MQ=255) aTTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAg < 1:2063958/140‑1 (MQ=255) ttttAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACg < 2:1502914/140‑1 (MQ=255) attCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCa > 2:393312/1‑128 (MQ=255) ttCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCg < 2:2337086/140‑1 (MQ=255) tCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGTGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTGATGACCGCTCGACCACCAATCTAGACGTTATTACCGa > 1:1162501/1‑140 (MQ=255) tCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGa > 1:2203260/1‑140 (MQ=255) tggATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGATGGTGa < 1:1761322/140‑1 (MQ=255) cccACGACTACGTTGTGAGGGGGATCTTTTTTGTCAACTCCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGATGGTGACGGGTTTccc < 2:1183745/140‑1 (MQ=255) cccACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGATGGTGACGGGTTTccc < 2:2203260/140‑1 (MQ=255) cccACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGATGGTGACGGGTTTccc < 1:1851331/140‑1 (MQ=255) cccACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGCGACGACTGCACCTGAGTCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGATGGTGACGGGTTTccc < 2:759575/140‑1 (MQ=255) cACGACAACGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGATGGTGACGGGTTTCCCCa > 1:1606909/1‑140 (MQ=255) aaCGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGATGGTGACGGGTTTCCCCAGTTCAg < 1:402488/140‑1 (MQ=255) aaCGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTAACCCCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCCCGTCCGCCAACCCAGACGTTACTACCGATGGTAACGGGTTTCCCCAGTTCAg < 2:1825513/140‑1 (MQ=255) cGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGATGGTGACGGGTTTCCCCAGTTCAGCa > 2:15869/1‑140 (MQ=255) cGTTGTCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGATGGTGACGGGTTTCCCCAGTTCAGCa < 2:515865/140‑1 (MQ=255) tCCGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGATGGTGACGGGTTTCCCCAGTTCAGCACCGCt > 1:626140/1‑140 (MQ=255) cGGGGCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTAGTACTGATGGTGACGGGGTTCCGCAGTTCAGCACCGCTAt > 2:1022887/1‑140 (MQ=255) ggggCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGATGGTGACGGGTTTCCCCAGTTCAGCACCGCTAtt < 2:1646832/140‑1 (MQ=255) ggggCATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGATGGTGACGGGTTTCCCCAGTTCAGCACCGCTAtt > 2:1717324/1‑140 (MQ=255) | GAACACCCTATTTTAACGTGGGAATAGTAGAGGGGAAGTAACAGATCTACCACAATTTTGCATAACAGTTGCGAAAAACCGATTACAATTTTTTAATTATTCTGGCTGGATTACCGCCCACGACAACGTTGTCCGGGACATCTTTTGTGACAACTGCACCTGAGGCTACCACGACGTTATCACCAATGGTCACACCAGGGTTAATGACCGCGCGTCCGCCAATCCAGACGTTATTACCGATGGTGACGGGTTTCCCCAGTTCAGCACCGCTATT > NC_000913/479285‑479558 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |