| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,113,143 | A→G | T761A (ACC→GCC) | opgH → | osmoregulated periplasmic glucans (OPGs) biosynthesis protein H |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,113,143 | 0 | A | G | 99.3% | 497.5 / ‑4.9 | 143 | T761A (ACC→GCC) | opgH | osmoregulated periplasmic glucans (OPGs) biosynthesis protein H |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (92/50); total (93/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.34e-01 | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
TGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTGCTGCTAAGCGATCCGG > NC_000913/1113006‑1113278 | tGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGcc > 2:1266100/1‑140 (MQ=255) cccGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCATCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGAACGCAGTGGTTAACCCGTCATTTAAAGCTCAGGCAGCCGCAATGGCGa > 2:729206/1‑140 (MQ=255) gAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACcgc > 2:2272385/1‑140 (MQ=255) aaGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACcgcg > 2:451062/1‑140 (MQ=255) aaGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACcgcg > 2:624749/1‑140 (MQ=255) tATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCa > 1:2158178/1‑140 (MQ=255) aTTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCAc < 1:584336/140‑1 (MQ=255) gccgccgcGGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACcgcg > 2:381743/1‑140 (MQ=255) gccgccgcAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCAGCGATGGCGACCGCGCGTCACcgcg > 1:1041999/1‑140 (MQ=255) ccgcAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAg > 1:1608769/1‑140 (MQ=255) cgcAGGTGCTGGTTGATACCGAACGGTTCATTGAGATCAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGt < 1:982832/140‑1 (MQ=255) gcAGGTGCTGGTTGATATCGATAGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGTTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTa < 2:1009015/140‑1 (MQ=255) gcAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTa < 1:1315326/140‑1 (MQ=255) gcAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTa < 2:2340916/140‑1 (MQ=255) gCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGc < 1:364358/140‑1 (MQ=255) tACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCg > 1:1969354/1‑140 (MQ=255) aTCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGt > 2:2457383/1‑140 (MQ=255) aTCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGt > 2:1420092/1‑140 (MQ=255) aTCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGt > 2:2123125/1‑140 (MQ=255) aTCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGt > 2:430218/1‑140 (MQ=255) aTCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCACCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAAGCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCGGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCGAGTAAGGTGCTGGAAATCGCGCGt > 2:1515318/1‑140 (MQ=255) ttCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCg > 1:2237762/1‑140 (MQ=255) tCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGc < 1:2402615/140‑1 (MQ=255) ttGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCAc < 1:381743/140‑1 (MQ=255) gaTGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTg > 2:1384115/1‑140 (MQ=255) gaTGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTg > 1:423019/1‑140 (MQ=255) aTGAATCGTCAACGCTTCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGa > 1:120648/1‑140 (MQ=255) tCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGcc < 1:443398/125‑1 (MQ=255) tCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGgcgc > 1:1362181/1‑140 (MQ=255) aaCGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCTCCCGTGCCCGCCATGTTGAACAGGCGCTg > 1:829727/1‑140 (MQ=255) tCCCTTGATGATGGCTTTATGCTCGCAGTGTTTAAGCCGTCATTTAACTCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACga < 2:1041999/140‑1 (MQ=255) tCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACga > 1:1507095/1‑140 (MQ=255) tCCCTTGATGATGGCTTGATGCTCGCAGTGTTTCAGCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACga < 2:1137328/140‑1 (MQ=255) cTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGAc > 1:481852/1‑140 (MQ=255) tgatgaTGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGc < 2:1659311/140‑1 (MQ=255) gatgatGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGcc < 1:624749/140‑1 (MQ=255) atgatgGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCGCGTGAACTCCACGTTGCACAGCCGCTGAACGAGACGCCa > 2:1109847/1‑140 (MQ=255) atgatgGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCa > 2:1785960/1‑140 (MQ=255) atgGCTTTATGCACGCAATGTTTAACCCGTCATTTAACGATCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGGCGCCagag < 2:942184/140‑1 (MQ=255) ggCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGaa > 2:1674253/1‑140 (MQ=255) ggCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGaa > 1:558908/1‑140 (MQ=255) ggCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGaa > 2:1931045/1‑140 (MQ=255) ggCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGaa > 2:31102/1‑140 (MQ=255) ggCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGaa > 1:1022681/1‑140 (MQ=255) ggCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGCCGCTGACCGAGACGCCAGAGaa > 1:1127672/1‑140 (MQ=255) ggCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTCGAAAAGACGCTGACCGAGACGCCAGAGaa > 1:956786/1‑140 (MQ=255) cTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACga > 1:476083/1‑126 (MQ=255) cTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGc > 1:2351653/1‑140 (MQ=255) cTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGc > 1:1792966/1‑140 (MQ=255) tATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGc > 2:1483188/1‑128 (MQ=255) tATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGa < 1:2457383/140‑1 (MQ=255) cACGCAGTGTTTAACCCCTCATCTAACGCTCTGGCAGCCCCAATGGCGTCCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATcg < 2:829727/140‑1 (MQ=255) gCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGGACAGGCGTTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGa > 2:844512/1‑140 (MQ=255) gCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAg < 1:2090984/129‑1 (MQ=255) gCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAg > 2:2090984/1‑129 (MQ=255) gCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGa < 2:334989/140‑1 (MQ=255) gCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGa > 1:1590195/1‑140 (MQ=255) gCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGa < 2:2237762/140‑1 (MQ=255) tgtTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGAtcgt > 1:177610/1‑140 (MQ=255) tgtTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGAtcgt > 2:1407934/1‑140 (MQ=255) tttAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGAtcgtcg < 1:1407934/140‑1 (MQ=255) aaCCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCt > 2:1805840/1‑140 (MQ=255) aCCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACGGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTg < 1:824401/140‑1 (MQ=255) aCCCGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAGGCTGAATCGCGATCGTCGCCTg > 1:1003191/1‑140 (MQ=255) ccGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGt > 1:1473235/1‑140 (MQ=255) cGTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGCGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGtg < 2:1422751/140‑1 (MQ=255) cGTCATTTAACGCTCCGGCAGCTGCCATGTCGACCGCCCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGtg < 1:871595/140‑1 (MQ=255) gTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACGGCCACGTTGAACAGACGCTGAACGAGACGCCCGAGAAGCTGAATCTCGATCGTCGCCTGGtgc > 2:824401/1‑140 (MQ=255) gTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGTCGCTGAACTAGACGCCGGAGAAGCTCAATCGCGATCGTCGCCTGGtgc > 2:1031678/1‑140 (MQ=255) gTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGTGAATCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGtgc > 1:729265/1‑140 (MQ=255) gTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTg < 1:2251807/136‑1 (MQ=255) gTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGtgc > 2:1616870/1‑140 (MQ=255) gTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGtgc > 1:2324796/1‑140 (MQ=255) gTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGtgc > 1:1297814/1‑140 (MQ=255) gTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGtgc > 2:1975671/1‑140 (MQ=255) gTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGtgc > 2:566344/1‑140 (MQ=255) gTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGtgc > 2:347254/1‑140 (MQ=255) gTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGtgc > 2:2159568/1‑140 (MQ=255) gTCATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAAACGCCAGAGAAACTAAATCGCAATCGTCGCCTGGtgc > 1:1019013/1‑140 (MQ=255) cATTTAACGCTCTGGTAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGtgctg > 1:185884/1‑140 (MQ=255) cATTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTTACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGtgctg > 1:1610428/1‑140 (MQ=255) aTTTAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATAGCGATCGTCGCCTGGtgctgc < 1:31102/140‑1 (MQ=255) tttAACGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTgctgct < 1:1953103/140‑1 (MQ=255) aaCGCTCTGGCAGCCTCAATGGAGAACGCTCGTCACGGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTGCTGCTAAg < 1:729206/140‑1 (MQ=255) aaCGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTTACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTGCTGCTAAg < 2:1610428/140‑1 (MQ=255) aaCGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTGCTGCTAAg < 2:558908/140‑1 (MQ=255) aaCGCTCTGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTGCTGCTAAg < 1:1805840/140‑1 (MQ=255) ctctGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTGCTGCTAAGCGAt < 2:177610/140‑1 (MQ=255) ctctGGCAGCCGCAATGCCGACTGCGCGTCACCGCCCCACTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTGCTGCTAAGCGAt < 2:729265/140‑1 (MQ=255) ctGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTGCTGCTAAGCGATcc > 1:238411/1‑140 (MQ=255) tGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCTATCATCTCCTGGTACTGCTAAGCGATCCg > 1:872566/1‑140 (MQ=255) tGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTGCTGCTAAg > 1:1225332/1‑133 (MQ=255) tGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTGCTGCTAAGCGATCCg > 1:147010/1‑140 (MQ=255) tGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTGCTGCTAAGCGATCCg > 2:1744683/1‑140 (MQ=255) tGGCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACCCCAGAGAAACTGGATCGCGATCGTCGCCTGTTGCTGCTAAGCGATCCg > 2:1016479/1‑140 (MQ=255) ggCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGtgc > 2:468280/1‑125 (MQ=255) ggCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGtgc < 1:468280/125‑1 (MQ=255) ggCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTGCTGCTAAGCGATCCgg < 2:1241128/140‑1 (MQ=255) ggCAGCCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTAAATCGCGATCGCCGACTGGTGCTGCTAAGCGATCCgg > 1:943663/1‑140 (MQ=255) ggCAGCCGCAATGGCGACCGCGAGTCACCGCTCCAGTAACGTGCTGGACATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTGCTGCTAAGCGATCCgg < 2:643632/140‑1 (MQ=255) | TGTTCCTGATCCCGGAAGAGTATTCGCCGCCGCAGGTGCTGGTTGATACCGATCGGTTCCTTGAGATGAATCGTCAACGCTCCCTTGATGATGGCTTTATGCACGCAGTGTTTAACCCGTCATTTAACGCTCTGGCAACCGCAATGGCGACCGCGCGTCACCGCGCCAGTAAGGTGCTGGAAATCGCCCGTGACCGCCACGTTGAACAGGCGCTGAACGAGACGCCAGAGAAGCTGAATCGCGATCGTCGCCTGGTGCTGCTAAGCGATCCGG > NC_000913/1113006‑1113278 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |