| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 252,978 | T→C | R90R (CGT→CGC) | yafP → | putative acyltransferase with acyl‑CoA N‑acyltransferase domain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 252,978 | 0 | T | C | 99.2% | 423.0 / NA | 119 | R90R (CGT→CGC) | yafP | putative acyltransferase with acyl‑CoA N‑acyltransferase domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (77/41); minor base G (1/0); total (78/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
ACGAATCTCGCTGGAAGGAGAAACTCGCGAAATCACAAGTGTGGGTTGCGATCATTAATGCACAACCGGTTGGTTTTATTTCCCGCATTGAACATTATATCGATATGTTATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGG > NC_000913/252842‑253114 | aCGAATCTCGCTGGAAGGAGAAACTCGCGAAATCACAAGTGTGGGTTGCGATCATTAATGCACAACCGGTTGGTTTTATTTCCCGCATTGAACATTATATCGATATGTTATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGCggg < 1:458205/140‑1 (MQ=255) gAATCTCGCTGGAAGGAGAAACTCGCGAAATCACAAGTGTGGGTTGCGATCATTAATGCACAACCGGTTGGTTTTATTTCCCGCATTGAACATTATATCGATATGTTATTTGTTGCCCCTGAATACACCCGCCGCGGGGt < 1:2194121/140‑1 (MQ=255) ctcGCTGGAAGGAGAAACTCGCGAAATCACAAGTGTGGGTTGCGATCATTAATGCACAACCGGTTGGTTTTATTTCCCGCATTGAACATTATATCGATATGTTATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGCGGGGTTGcc > 2:2093375/1‑140 (MQ=255) ggAAGGAGAAACTCGCGAAATCACAAGTGTGGGTTGCGATCATTAATGCACAACCGGTTGGTTTTATTTCCCGCATTGAACATTATATCGATATGTTATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGCGGGGTTGCCAGCGCt < 2:1351287/140‑1 (MQ=255) 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aaTACACCCGCCGCGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGtt < 1:274846/140‑1 (MQ=255) aaTACACCCGCCGCGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGtt < 1:1649541/140‑1 (MQ=255) cacCCGCCGCGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCACAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGtt < 2:2189540/136‑1 (MQ=255) cacCCGCCGCGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCACAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGtt > 1:2189540/1‑136 (MQ=255) acCCGCCGCGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATg > 1:1936443/1‑140 (MQ=255) acCCGCCGCGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATg > 2:413012/1‑140 (MQ=255) ccgccgCGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCCGACGGTTAAGCAGTAGCGCGTTGAATGcc > 1:1209619/1‑140 (MQ=255) cgccgcGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCg < 1:2239594/140‑1 (MQ=255) gccgCGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCgg > 1:385120/1‑140 (MQ=255) gccgCGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCgg > 1:2018059/1‑140 (MQ=255) gccgCGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGGTAGGCAGCAGCGCGTTGAATGCCgg > 1:658408/1‑140 (MQ=255) ccgCGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagca < 1:462517/123‑1 (MQ=255) ccgCGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg > 2:157341/1‑140 (MQ=255) ccgCGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCg < 2:544558/138‑1 (MQ=255) ccgCGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTAAACGTTATAGTTATCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg > 2:798178/1‑140 (MQ=255) | ACGAATCTCGCTGGAAGGAGAAACTCGCGAAATCACAAGTGTGGGTTGCGATCATTAATGCACAACCGGTTGGTTTTATTTCCCGCATTGAACATTATATCGATATGTTATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGG > NC_000913/252842‑253114 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |