| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,580,584 | (A)6→7 | coding (207/1158 nt) | ydeM ← | putative anaerobic sulfatase maturation enzyme YdeM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,580,578 | 1 | . | A | 99.0% | 340.1 / ‑4.0 | 95 | coding (213/1158 nt) | ydeM | putative anaerobic sulfatase maturation enzyme YdeM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base A (48/46); total (49/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACCAACCAGAAATTCATGTTCTTTGAGAAAGGCACACCATTCATTATTCAATAAAATGCCATTCGTTTGTAATGCATTAAAAATACGTTTTTGGCCTGCATAGCGTTGTTGATAGTGAATAACTTTAC‑GG‑AAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTG > NC_000913/1580449‑1580712 | accaaccaGAAATTCATGTTCTTTGAGAAAGGCACACCATTCATTATTCAATAAAATGCCATTCGTTTGTAATGCATTAAAAATACGTTTTTGGCCTGCATAGCGTTGTTGATAGTGAATAACTTTAC‑GG‑aaaaaaatcc > 1:81941/1‑136 (MQ=255)accaaccaGAAATTCATGTTCTTTGAGAAAGGCACACCATTCATTATTCAATAAAATGCCATTCGTTTGTAATGCATTAAAAATACGTTTTTGGCCTGCATAGCGTTGTTGATAGTGAATAACTTTAC‑GG‑aaaaaaatcc > 2:914154/1‑136 (MQ=255) caaccaGAAATTCATGTTCTTTGAGAAAGGCACACCATTCATTATTCAATAAAATGCCATTCGTTTGTAATGCATTAAAAATACGTTTTTGGCCTGCATAGCGTTGTTGATAGTGAATAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAg < 2:81941/140‑1 (MQ=255) aaccaGAAATTCATGTTCTTTGAGAAAGGCACACCATTCATTATTCAATAAAATGCCATTCGTTTGTAATGCATTAAAAATACGTTTTTGGCCTGCATAGCGTTGTTGATAGTGAATAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAgg < 2:1253285/140‑1 (MQ=255) 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1:1211836/1‑140 (MQ=255) cacCATTCATTATTCAATAAAATGCCATTCGTTTGTAATGCATTAAAAATACGTTTTTGGCCTGCATAGCGTTGTTGATAGTGAATAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAgg < 1:509768/140‑1 (MQ=255) acCATTCATTATTCAATAAAATGCCATTCGTTTGTAATGCATTAAAAATACGTTTTTGGCCTGCATAGCGTTGTTGATAGTGAATAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGt > 1:68260/1‑140 (MQ=255) ccATTCATTATTCAATAAAATGCCATTCGTTTGTAATGCATTAAAAATACGTTTTTGGCCTGCATAGCGTTGTTGATAGTGAATAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTa > 2:270804/1‑140 (MQ=255) attcattATTCAATAAAATGCCATTCGTTTGTAATGCATTAAAAATACGTTTTTGGCCTGCATAGCGTTGTTGATAGTGAATAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTaaa < 2:1141678/140‑1 (MQ=255) tcattATTCAATAAAATGCCATTCGTTTGTAATGCATTAAAAATACGTTTTTGGCCTGCATAGCGTTGTTGATAGTGAATAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAAt > 2:1232468/1‑140 (MQ=255) 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ttgATAGTGAATAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATccatccat > 2:1256375/1‑140 (MQ=255) ttgATAGTGAATAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATccatccat > 2:1551736/1‑140 (MQ=255) ttgATAGTGAATAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATccatccat > 1:165183/1‑140 (MQ=255) aGTGAATAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTc > 1:655835/1‑140 (MQ=255) tGAATAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCAt < 1:650140/140‑1 (MQ=255) tGAATAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAACAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCAt < 2:895355/140‑1 (MQ=255) aaTAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCAttttt > 1:1201538/1‑135 (MQ=255) aaTAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCAttttt < 2:1201538/135‑1 (MQ=255) aaTAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGa > 2:793731/1‑140 (MQ=255) aaTAACTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTAATCCATCCATTTTTAATGa < 2:1064308/140‑1 (MQ=255) cTTTAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTaaa > 2:160603/1‑140 (MQ=255) tAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTg > 2:433030/1‑140 (MQ=255) tAC‑GGAAAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTg > 2:965458/1‑140 (MQ=255) | ACCAACCAGAAATTCATGTTCTTTGAGAAAGGCACACCATTCATTATTCAATAAAATGCCATTCGTTTGTAATGCATTAAAAATACGTTTTTGGCCTGCATAGCGTTGTTGATAGTGAATAACTTTAC‑GG‑AAAAAATCCAGGCCAGCCAGAGTGGGTTCACCGCCTTGCCAGGTAAAATAGACCTGATTGCCAGACGCTGCGATATATTGTTTGATGAACTCTTTCAGAGTGCTGTCATCCATCCATTTTTCATGAGTAAACTG > NC_000913/1580449‑1580712 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |