| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 19,445 | C→T | P244L (CCA→CTA) | nhaR → | DNA‑binding transcriptional activator NhaR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 19,445 | 0 | C | T | 98.9% | 311.5 / ‑5.9 | 89 | P244L (CCA→CTA) | nhaR | DNA‑binding transcriptional activator NhaR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (47/41); total (47/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.72e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
TTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAAT > NC_000913/19314‑19581 | ttCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCttt < 2:386657/140‑1 (MQ=255) tCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTa < 2:1591282/140‑1 (MQ=255) aGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATg > 2:1262056/1‑140 (MQ=255) aGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATg < 1:1325651/140‑1 (MQ=255) gggCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGa > 1:343883/1‑140 (MQ=255) ggCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAAc < 2:1268209/124‑1 (MQ=255) ggCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAAc > 1:1268209/1‑124 (MQ=255) ggCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGAc > 2:1070944/1‑140 (MQ=255) ggCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGAc > 2:1661295/1‑140 (MQ=255) cgcAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACtt > 1:188480/1‑140 (MQ=255) cAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACtttt > 2:533670/1‑140 (MQ=255) cAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACtttt > 1:477820/1‑140 (MQ=255) cAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACtttt > 2:639094/1‑140 (MQ=255) aaTTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTAt < 1:540194/140‑1 (MQ=255) cTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCatat > 1:894650/1‑126 (MQ=255) cTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCatat < 2:894650/126‑1 (MQ=255) cTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGa > 2:1609098/1‑140 (MQ=255) cTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATaaaa < 2:1505854/140‑1 (MQ=255) ttAACTCCCAGGGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGt > 1:1496028/1‑140 (MQ=255) tAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCg < 1:1291652/140‑1 (MQ=255) aCTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTa > 1:12740/1‑140 (MQ=255) cA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAAt > 1:1595012/1‑140 (MQ=255) cA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAAt > 2:1665393/1‑140 (MQ=255) cA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAAt > 2:1424419/1‑140 (MQ=255) a‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAAtt > 2:1377436/1‑140 (MQ=255) gATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt < 1:1665393/140‑1 (MQ=255) aTTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt < 1:157836/139‑1 (MQ=255) aTTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGt > 2:157836/1‑139 (MQ=255) aTTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTc > 2:244938/1‑140 (MQ=255) ttAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTcg > 2:917692/1‑140 (MQ=255) ttAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTcg < 1:1424419/140‑1 (MQ=255) tAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTcgc < 1:244938/140‑1 (MQ=255) tAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTcgc > 1:392860/1‑140 (MQ=255) tAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCgag < 2:343883/140‑1 (MQ=255) aGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGACGTAGAAATTGGTCGCGTCgaga > 1:467092/1‑140 (MQ=255) gAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGaa < 1:1377436/140‑1 (MQ=255) gAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGaa < 1:942455/140‑1 (MQ=255) gAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGaa < 1:639094/140‑1 (MQ=255) gAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGaa < 2:188480/140‑1 (MQ=255) gAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGCCGCGTCGACaa < 2:481458/140‑1 (MQ=255) ccTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGa < 1:533670/140‑1 (MQ=255) ccTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGa < 2:392860/140‑1 (MQ=255) ccTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGa < 2:1076719/140‑1 (MQ=255) tCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGACAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAAtg < 2:1146287/135‑1 (MQ=255) tCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAAtg > 1:1146287/1‑135 (MQ=255) tCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATg < 2:477820/140‑1 (MQ=255) tCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATg > 2:1093779/1‑140 (MQ=255) tCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATg > 2:1200212/1‑140 (MQ=255) cGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCgag > 1:620518/1‑130 (MQ=255) cGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCgag < 2:620518/130‑1 (MQ=255) cGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGaa > 2:1558464/1‑132 (MQ=255) cGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGaa < 1:1558464/132‑1 (MQ=255) gCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGaa < 1:1070944/140‑1 (MQ=255) aGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTTGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGa > 2:641500/1‑132 (MQ=255) aGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTTGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGa < 1:641500/132‑1 (MQ=255) aGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGa < 1:1242831/132‑1 (MQ=255) aGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGa > 2:1242831/1‑132 (MQ=255) tttGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTa < 1:917692/140‑1 (MQ=255) tgatgCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATg < 1:1609098/140‑1 (MQ=255) gatgCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTATAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGc < 1:396630/140‑1 (MQ=255) gatgCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGc < 1:1493284/140‑1 (MQ=255) gCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTAt > 1:140883/1‑140 (MQ=255) gCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTAt > 1:1584451/1‑140 (MQ=255) tttGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGGAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTg > 1:1077584/1‑140 (MQ=255) atgaAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGa > 2:500350/1‑140 (MQ=255) aGCTTTTGGTGTGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGga > 2:554309/1‑140 (MQ=255) aGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGga < 1:500350/140‑1 (MQ=255) aGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGga < 1:1200212/140‑1 (MQ=255) aTGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCAccc > 2:1315021/1‑140 (MQ=255) aTGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCAccc > 1:134761/1‑140 (MQ=255) cacaATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGGAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCcggc < 2:1077584/140‑1 (MQ=255) cacaATGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCcggc < 1:1315021/140‑1 (MQ=255) aaTGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGt > 1:1220582/1‑140 (MQ=255) tGCAATCTTCGTTGCCCTAACGCTCTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTAc > 1:435749/1‑140 (MQ=255) cAATCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAg < 1:1093779/140‑1 (MQ=255) aaTCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGc > 2:206771/1‑140 (MQ=255) aaTCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGc > 1:1570471/1‑140 (MQ=255) tCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGa > 1:365927/1‑140 (MQ=255) tCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGa < 2:1584451/140‑1 (MQ=255) tCTTCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGa > 2:914681/1‑140 (MQ=255) tCGTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATc < 2:883093/140‑1 (MQ=255) gTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCTAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTg > 1:1337174/1‑140 (MQ=255) gTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTg > 2:446646/1‑140 (MQ=255) gTTGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTg > 2:1541170/1‑140 (MQ=255) ttGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTg > 2:926033/1‑139 (MQ=255) ttGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTg < 1:926033/139‑1 (MQ=255) tGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATc < 1:1052351/136‑1 (MQ=255) tGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATc > 2:1052351/1‑136 (MQ=255) tGCCCTAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCa < 1:1541170/140‑1 (MQ=255) ccctAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAAt < 2:365927/140‑1 (MQ=255) ccctAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAAt < 1:237758/140‑1 (MQ=255) ccctAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAAt < 1:554309/140‑1 (MQ=255) | TTCAATGTTAGGGCGCAAATTGCTTAACTGGTTTAACTCCCA‑GGGATTAAACGTAGAAATCCTCGGCGAGTTTGATGATGCCGCTTTGATGAAAGCTTTTGGTGCGATGCACAATGCAATCTTCGTTGCCCCAACGCTTTATGCATATGACTTTTATGCCGATAAAACTGTCGTAGAAATTGGTCGCGTCGAGAATGTGATGGAAGAGTACCATGCTATTTTTGCTGAGCGGATGATTCAGCACCCGGCGGTACAGCGAATCTGCAAT > NC_000913/19314‑19581 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |