| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,443,630 | (G)5→6 | coding (580/2640 nt) | ydbH → | PF11739 family protein YdbH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,443,625 | 1 | . | G | 97.7% | 144.8 / ‑3.3 | 43 | coding (575/2640 nt) | ydbH | PF11739 family protein YdbH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base G (21/21); total (22/21) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
CATTAACCTCTGATATCCAGCAACTGCGTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGT‑GGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAGCTGGACTGGCAGGAAAATAGCGGGC > NC_000913/1443490‑1443753 | cATTAACCTCTGATATCCAGCAACTGCGTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGT‑gggg < 1:280029/140‑1 (MQ=255) ccTCTGATATCCAGCAACTGCGTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGT‑gggg‑ggaatt < 1:349346/140‑6 (MQ=255) ctctGATATCCAGCAACTGCGTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAAttt > 2:134940/1‑140 (MQ=255) ctGATATCCAGCAACTGCGTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGc < 1:404800/140‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGa < 2:764358/140‑1 (MQ=255) gTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGT‑GGGGAGAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGa > 1:606900/1‑140 (MQ=255) gTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAATCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGa > 1:6846/1‑140 (MQ=255) tCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGa < 2:441487/140‑1 (MQ=255) cAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGAc < 2:247294/140‑1 (MQ=255) aGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACt < 2:529162/140‑1 (MQ=255) gggCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATg > 1:675276/1‑135 (MQ=255) gggCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATg < 2:675276/135‑1 (MQ=255) ggCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTGAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTc < 1:589471/140‑1 (MQ=255) aaTTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCa < 1:340358/140‑1 (MQ=255) aGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGAc > 1:738025/1‑140 (MQ=255) aacaacTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGcc > 2:297086/1‑140 (MQ=255) ttACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGa < 2:615663/140‑1 (MQ=255) aCAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAAc > 2:721799/1‑140 (MQ=255) aCAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAAc < 1:241327/140‑1 (MQ=255) cAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCa < 1:678212/140‑1 (MQ=255) aGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCAc > 1:588245/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) tGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGcc < 2:158365/140‑1 (MQ=255) cgtcgCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAg > 1:155542/1‑140 (MQ=255) cgtcgCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAg > 1:21040/1‑140 (MQ=255) cgTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAGCTGGa > 2:233076/1‑140 (MQ=255) tGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAGCTGGACTgg < 1:233076/140‑1 (MQ=255) gAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAGCTGGACTGGc < 1:411575/140‑1 (MQ=255) gccgccGGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAGCTGGACTGGCAGGAAAAt > 1:736606/1‑140 (MQ=255) gccgGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAGCTGGACTGGCAGGAAAATAGc < 1:297086/140‑1 (MQ=255) gccgGTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAGCTGGACTGGCAGGAAAATAGc < 1:134940/140‑1 (MQ=255) ggTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAGCTGGACTGGCAGGAAAATAGCggg < 2:21040/140‑1 (MQ=255) ggTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAGCTGGACTGGCAGGAAAATAGCggg < 2:155542/140‑1 (MQ=255) gTAAAACTGGTGGGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGTGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAGCTGGACTGGCAGGAAAATAGCGGGc < 1:600092/140‑1 (MQ=255) | CATTAACCTCTGATATCCAGCAACTGCGTTATCAGGGCGAAAAAGTTAAATTTCAAGGCCAGCTGAAAGGGCAACAACTTACAGTCAGCGAACTGGATGTCGTCGCGTTTGAAAATCAGCCGCCGGTAAAACTGGT‑GGGG‑GAATTTGCTATGCCGCTCGTGCCGGATGGACTTCCTGTAAGTGGGCATGCTACTGCGACGTTAAACTTGCCGCAGGAACCGTCACTGGTGGATGCCGAGCTGGACTGGCAGGAAAATAGCGGGC > NC_000913/1443490‑1443753 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |