| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,838,210 | (A)5→4 | intergenic (‑105/+44) | hydN ← / ← ascG | putative electron transport protein HydN/DNA‑binding transcriptional repressor AscG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,838,206 | 0 | A | . | 97.4% | 310.3 / 2.3 | 78 | intergenic (‑101/+48) | hydN/ascG | putative electron transport protein HydN/DNA‑binding transcriptional repressor AscG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base . (42/34); total (43/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
TTACTCGCGTCAGCAATGATGAAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGGAAAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGTTTTCGGCGGTGAGAAATCCCCGCCATCGAGCA > NC_000913/2838074‑2838339 | ttACTCGCGTCAGCAATGATGAAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAGTGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGGaaaacgat > 2:574966/1‑136 (MQ=255) aCTCGCGTCAGCAATGATGAAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGt > 2:19409/1‑140 (MQ=255) aCTCGCGTCAGCAATGATGAAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGt > 2:498754/1‑140 (MQ=255) aCTCGCGTCAGCAATGATGAAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGt > 2:220356/1‑140 (MQ=255) cTCGCGTCAGCAATGATGAAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTc < 1:1213919/140‑1 (MQ=255) cgcgTCAGCAATGATGAAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCAt < 2:487798/140‑1 (MQ=255) gcgTCAGCAATGATGAAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGAAGG‑AAAACGATGTCATc < 1:268791/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAATGATGAAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGa > 2:838408/1‑140 (MQ=255) cAGCAATGATGAAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGaca < 2:1172660/140‑1 (MQ=255) aaTGATGAAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAg < 1:827776/140‑1 (MQ=255) atgatgAAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGt < 1:632391/140‑1 (MQ=255) tgatgaAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTg < 2:1129251/140‑1 (MQ=255) tgatgaAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTg > 1:359133/1‑140 (MQ=255) tgatgaAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTg > 2:293702/1‑140 (MQ=255) tgaAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCAGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACg < 1:1020242/140‑1 (MQ=255) aaaCGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGAt < 1:494498/140‑1 (MQ=255) aCGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGa > 2:170181/1‑140 (MQ=255) cGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGAc > 1:174322/1‑140 (MQ=255) gTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACAt > 2:80668/1‑140 (MQ=255) ttCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGa > 2:817141/1‑133 (MQ=255) ttCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGa < 1:817141/133‑1 (MQ=255) ttCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACa < 2:965507/138‑1 (MQ=255) ttCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACa > 1:965507/1‑138 (MQ=255) tcatcaAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACAtgt < 1:792279/140‑1 (MQ=255) tcaAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGtgat < 2:1047409/140‑1 (MQ=255) tcaAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGtgat > 1:835799/1‑140 (MQ=255) aTTCTCCAGCAGTGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACa < 1:574966/140‑1 (MQ=255) tctcCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACCGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGAc < 1:1148262/127‑1 (MQ=255) tctcCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACCGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGAc > 2:1148262/1‑127 (MQ=255) tcCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGt > 2:81720/1‑140 (MQ=255) tcCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGt > 2:972931/1‑140 (MQ=255) tGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATcgcg > 1:549593/1‑140 (MQ=255) aCAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGaa < 1:838408/140‑1 (MQ=255) aCAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGaa < 1:952986/140‑1 (MQ=255) aGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAgg < 2:831157/140‑1 (MQ=255) aGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAgg > 1:1096691/1‑140 (MQ=255) aGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAgg < 2:652889/140‑1 (MQ=255) aGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATCTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAgg < 2:1128509/140‑1 (MQ=255) ttAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAAG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAg > 2:570065/1‑140 (MQ=255) tAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGc > 1:879195/1‑140 (MQ=255) aaTGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATcgcg < 2:614277/132‑1 (MQ=255) aaTGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATcgcg > 1:614277/1‑132 (MQ=255) tGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAAt > 1:757541/1‑140 (MQ=255) cgcCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAAtga > 1:237007/1‑140 (MQ=255) gcCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAAtgag < 2:1096691/140‑1 (MQ=255) ccGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAAtgagt > 1:763434/1‑140 (MQ=255) ccGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAAtgagt > 1:298136/1‑140 (MQ=255) ccGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAAtgagt > 1:87875/1‑140 (MQ=255) gATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAAtgagtga > 2:614491/1‑140 (MQ=255) tACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATgagtgagt < 2:359133/140‑1 (MQ=255) tACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATgagtgagt < 1:80668/140‑1 (MQ=255) tCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCgcgg > 1:1193080/1‑140 (MQ=255) acaAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCgcggcg < 2:237007/140‑1 (MQ=255) caAATCATGCCAGATTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGGAAAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCgcggcg > 2:109571/1‑140 (MQ=255) aaaTCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCgcggcg < 1:1185609/138‑1 (MQ=255) aaaTCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCgcggcg > 2:1185609/1‑138 (MQ=255) aaTCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGAt < 2:84912/140‑1 (MQ=255) aTCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATc > 2:269824/1‑140 (MQ=255) tGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGtt > 2:168902/1‑140 (MQ=255) tGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGtt > 2:562386/1‑140 (MQ=255) tGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGtt > 2:692502/1‑140 (MQ=255) tGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTAACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGtt > 2:653634/1‑140 (MQ=255) gCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGttt > 2:39228/1‑140 (MQ=255) gCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGttt > 2:815605/1‑140 (MQ=255) gCCAGTTTTTAATTTAATGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGttt > 2:160806/1‑140 (MQ=255) tttAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTg > 1:213581/1‑140 (MQ=255) aCTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGtttt > 1:1031286/1‑140 (MQ=255) tATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGTTTTcggcg < 2:213581/140‑1 (MQ=255) aTTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGTTTTcggcgg < 1:168902/140‑1 (MQ=255) aTTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGTTTTcggcgg < 1:653634/140‑1 (MQ=255) aaGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGTTTTCGGCGGTgag < 1:692502/140‑1 (MQ=255) ggAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGTTTTCGGCGGTGAGaa > 1:445065/1‑140 (MQ=255) ggAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGTTTTCGGCGGTGAGaa > 2:1064655/1‑140 (MQ=255) ggAAATTAATTTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGTTTTCGGCGGTGAGaa < 1:293702/140‑1 (MQ=255) ttaattTCTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGGGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGTTTTCGGCGGTGAGAAATccc > 2:1094056/1‑140 (MQ=255) tCTGTAATGCAGGAAAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGTTTTCGGCGGTGAGAAATCCCCGCCa < 1:109571/140‑1 (MQ=255) cTGTAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGTTTTCGGCGGTGAGAAATCCCCGCCATc < 1:1064655/140‑1 (MQ=255) tAATGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGTTTTCGGCGGTGAGAAATCCCCGCCATCGAg > 1:130022/1‑140 (MQ=255) aTGCAGG‑AAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGTTTTCGGCGGTGAGAAATCCCCGCCATCGAGCa < 1:160806/140‑1 (MQ=255) | TTACTCGCGTCAGCAATGATGAAACGGTTCATCAAATTCTCCAGCAATGACAGTTAATGCGCCGATACATTCACAAATCATGCCAGTTTTTAATTTACTGTTATTTAAGGAAATTAATTTCTGTAATGCAGGAAAAACGATGTCATCGACACTAGTGACGATGACATGTGATGACAATGTTTATCGCGAAGGAGCAATGAGTGAGTCGCGGCGGATCAGTTTTCCGCTGAAGGTTTTCGGCGGTGAGAAATCCCCGCCATCGAGCA > NC_000913/2838074‑2838339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |