| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 234,139 | (A)7→8 | coding (644/756 nt) | gloB ← | hydroxyacylglutathione hydrolase GloB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 234,132 | 1 | . | A | 98.5% | 234.2 / ‑3.7 | 67 | coding (651/756 nt) | gloB | hydroxyacylglutathione hydrolase GloB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base A (36/30); total (37/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.68e-01 | |||||||||||
GGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTT‑A‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGTGCGGAAGAATACTCAAAGCAAACTT > NC_000913/233996‑234266 | ggCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTT‑a‑aa < 1:789486/140‑1 (MQ=255) cGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTT‑a‑aaaa > 1:78534/1‑140 (MQ=255) cGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTT‑a‑aaaa > 2:838609/1‑140 (MQ=255) cGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTT‑a‑aaaa > 2:79988/1‑140 (MQ=255) aaCGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTT‑a‑aaaaaa > 1:868397/1‑140 (MQ=255) aaCGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTT‑a‑aaaaaa > 1:581041/1‑140 (MQ=255) aGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTT‑a‑aaaaaaacgtt > 2:1050887/1‑135 (MQ=255) aTGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAAttt > 1:953119/1‑140 (MQ=255) aCAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGcc < 1:1132830/140‑1 (MQ=255) aGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCt < 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gAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCa > 2:1134437/1‑135 (MQ=255) gAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCa < 1:1134437/135‑1 (MQ=255) aCCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTAc > 2:538901/1‑140 (MQ=255) tATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACggg < 1:133257/140‑1 (MQ=255) ttGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTAt > 1:998337/1‑140 (MQ=255) tGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTAtt > 1:1108722/1‑140 (MQ=255) tAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGAttt > 2:728637/1‑140 (MQ=255) aaCCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGAtttt > 2:920368/1‑140 (MQ=255) aaCCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGAtttt < 1:175142/140‑1 (MQ=255) aaCCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGAtttt > 1:60122/1‑140 (MQ=255) aaCCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGAtttt > 1:187197/1‑140 (MQ=255) aCCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGAttttt > 1:837161/1‑140 (MQ=255) aCCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGAttttt > 2:480841/1‑140 (MQ=255) tGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGcc > 2:875399/1‑140 (MQ=255) tGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGcc > 2:592622/1‑140 (MQ=255) gCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGccc > 1:312509/1‑140 (MQ=255) aaaaCGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGt < 1:775738/140‑1 (MQ=255) aaaaCGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGt < 1:838609/140‑1 (MQ=255) aCGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAAc > 2:358624/1‑140 (MQ=255) cGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACt > 2:9047/1‑140 (MQ=255) tctTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCTCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCAGTAACTcat < 2:1166178/140‑3 (MQ=255) tctTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCt > 1:776315/1‑140 (MQ=255) tctTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCt < 2:581041/140‑1 (MQ=255) tCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTaa < 1:645731/140‑1 (MQ=255) tgttgCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTAc > 1:684287/1‑140 (MQ=255) tgttgCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTAc < 1:268966/140‑1 (MQ=255) gttgCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACg > 2:361117/1‑140 (MQ=255) tgCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGat > 1:745314/1‑140 (MQ=255) tgCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGat > 2:259695/1‑140 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1:819559/1‑140 (MQ=255) tttCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATaataat > 1:624616/1‑136 (MQ=255) tttCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATaataat < 2:624616/136‑1 (MQ=255) tcttcATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTa < 2:953119/140‑1 (MQ=255) tcttcATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTa < 2:1118865/140‑1 (MQ=255) tcttcATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTT‑AGAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTGACGATAATAATCATTTa > 2:1082953/1‑140 (MQ=255) cattaattaAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGTg < 1:1169282/140‑1 (MQ=255) attaattaAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGTGc > 2:1048571/1‑140 (MQ=255) attaattaAATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGTGc > 2:1034105/1‑140 (MQ=255) ttaattaaATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGTGCg < 2:187197/140‑1 (MQ=255) ttaattaaATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGTGCg < 2:57212/140‑1 (MQ=255) ttaattaaATCAATATCTTCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGTGCg < 2:819559/140‑1 (MQ=255) 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2:819824/140‑1 (MQ=255) ttCCGTTCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGTGCGGAAGAATACTCAAAGCa < 2:1108722/140‑1 (MQ=255) ttCTTAA‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGTGCGGAAGAATACTCAAAGCAAACtt > 2:1198723/1‑140 (MQ=255) | GGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTT‑A‑AAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGTGCGGAAGAATACTCAAAGCAAACTT > NC_000913/233996‑234266 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |