| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,798,725 | A→G | D196D (GAT→GAC) | waaU ← | putative ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase 4 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,798,725 | 0 | A | G | 98.9% | 305.8 / ‑4.8 | 87 | D196D (GAT→GAC) | waaU | putative ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase 4 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (33/53); total (34/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
TTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCT > NC_000913/3798589‑3798861 | tttCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCt < 1:727328/140‑1 (MQ=255) ttCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTa > 2:962968/1‑140 (MQ=255) ttCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTa < 2:1150928/140‑1 (MQ=255) aGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGt < 1:489113/140‑1 (MQ=255) tgtTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTc > 1:283618/1‑129 (MQ=255) gtTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATg < 1:255455/140‑1 (MQ=255) ttttCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGc < 1:1061189/140‑1 (MQ=255) cttcttGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACATAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCg > 2:1197124/1‑140 (MQ=255) ttGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGACATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGt < 1:354994/140‑1 (MQ=255) tataACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTtggtgg < 1:1182135/140‑1 (MQ=255) tataACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGAtggtgg < 2:1186652/140‑1 (MQ=255) ataACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTATTGGTTTAATATTGACTATTCTTGTATCTCCATTAAATTTTTTTATTTTATCTTCAACTTCTACTGGAAAATCCAGGCCGAAGTtgtggga > 2:480788/1‑135 (MQ=255) ataACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGa > 1:240541/1‑140 (MQ=255) ataACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGa > 2:68175/1‑140 (MQ=255) aaCTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATTGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGaaa > 1:1150235/1‑140 (MQ=255) aaCTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGaaa > 2:1188119/1‑140 (MQ=255) aaCTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGaaa > 2:72458/1‑140 (MQ=255) cTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAAt < 1:265604/140‑1 (MQ=255) ttATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTa > 1:393403/1‑140 (MQ=255) aTTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTAcc < 2:393403/140‑1 (MQ=255) attGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTAccc < 1:886097/139‑1 (MQ=255) tttgtCAAAAGTTAGGCGGCATTTTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCt < 1:480788/136‑1 (MQ=255) ttGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCt < 1:748266/140‑1 (MQ=255) ttGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCt < 2:1182866/140‑1 (MQ=255) ttGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCt < 2:520689/140‑1 (MQ=255) ttGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCt < 1:343746/140‑1 (MQ=255) tGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTc < 2:527612/140‑1 (MQ=255) tGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTc < 1:68175/140‑1 (MQ=255) cTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCAc > 2:217104/1‑140 (MQ=255) cTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCAc > 2:1114095/1‑140 (MQ=255) cTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCAc > 1:592310/1‑140 (MQ=255) tAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAata < 1:217104/140‑1 (MQ=255) aGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATg > 1:370557/1‑140 (MQ=255) gACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGc > 1:1137038/1‑140 (MQ=255) cGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCtt < 2:370557/140‑1 (MQ=255) ggCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTc < 1:631724/140‑1 (MQ=255) ggCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTc < 1:1188119/140‑1 (MQ=255) gCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCa > 1:382135/1‑140 (MQ=255) gCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCa > 2:492680/1‑140 (MQ=255) gCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCa > 2:292962/1‑140 (MQ=255) tatTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTa < 2:424575/140‑1 (MQ=255) ttttGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTa < 1:54693/140‑1 (MQ=255) ttttGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTa > 1:396321/1‑140 (MQ=255) tttGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTAt < 2:644119/140‑1 (MQ=255) tGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTg < 1:1069334/140‑1 (MQ=255) aCCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTc < 1:996057/140‑1 (MQ=255) ccTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCg < 1:888847/140‑1 (MQ=255) aaTGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCgtgt > 2:86871/1‑140 (MQ=255) aTGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTa < 1:1044116/140‑1 (MQ=255) aataatGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCatat > 2:590310/1‑140 (MQ=255) aCTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCttt > 2:288097/1‑140 (MQ=255) aCTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCttt > 2:761945/1‑140 (MQ=255) tATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTa < 1:876112/140‑1 (MQ=255) ttCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTaaa > 1:424350/1‑140 (MQ=255) ttCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTaaa > 1:850946/1‑140 (MQ=255) ttCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTaaa > 1:1035467/1‑140 (MQ=255) tCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAAc > 2:634500/1‑140 (MQ=255) ttGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACAt < 2:327892/140‑1 (MQ=255) gTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTc < 2:240541/140‑1 (MQ=255) aTCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCAt < 2:424350/140‑1 (MQ=255) tctcCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATc > 2:54985/1‑140 (MQ=255) tcCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGt > 1:1052478/1‑140 (MQ=255) tcCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGt > 1:727322/1‑140 (MQ=255) tcCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGt > 1:1119079/1‑140 (MQ=255) cAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTgg < 1:1060059/140‑1 (MQ=255) aaTAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTggg > 1:428023/1‑140 (MQ=255) aTAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTgggg < 2:396321/140‑1 (MQ=255) aTAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTgggg < 1:86871/140‑1 (MQ=255) tAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGa < 1:634500/140‑1 (MQ=255) aaaTTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGAt > 2:583517/1‑140 (MQ=255) aaTTCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATg < 1:492680/140‑1 (MQ=255) ttCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTgggg > 1:438207/1‑135 (MQ=255) ttCTTTTATTTTATCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTgggg < 2:438207/135‑1 (MQ=255) ttttattttaTCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTaaa < 1:590310/140‑1 (MQ=255) tattttatCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATg < 2:1011177/140‑1 (MQ=255) attttatCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGa < 2:850946/140‑1 (MQ=255) ttttatCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGaa < 1:237404/140‑1 (MQ=255) atCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGt < 1:292962/140‑1 (MQ=255) atCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGt < 1:1114095/140‑1 (MQ=255) atCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGt < 2:256014/140‑1 (MQ=255) atCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGt < 1:148310/140‑1 (MQ=255) atCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGt < 1:288097/140‑1 (MQ=255) tCTTCAACGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTa < 1:583517/140‑1 (MQ=255) aaCGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGaa > 1:468375/1‑130 (MQ=255) aaCGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGaa < 2:468375/130‑1 (MQ=255) aaCGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGt < 1:289673/134‑1 (MQ=255) aaCGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCt < 1:761945/140‑1 (MQ=255) aaCGTCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCt < 1:882603/140‑1 (MQ=255) | TTTCAAAGTGTGTTTTCACTTCTTGATATATAACTTTTATTTGCTCAAACGTAAGACGGCATATTTTTTTTGCACCTAATGGATTAATAATGACTATTCTTGTATCTCCAATAAATTCTTTTATTTTATCTTCAACATCTACTGGTAAATGCAAGTCGTAGTTGGTGGAAAATTTACCCTCACCATAAATATGCTTCAGTATTTCTATTGCTCGTGTACTCATATGTTCTTTTAAACATTCATCGTGGGGATGGTAAAATGAATAGTAACGCT > NC_000913/3798589‑3798861 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |