| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 885,658 | A→G | I158I (ATT→ATC) | ybjI ← | 5‑amino‑6‑(5‑phospho‑D‑ribitylamino)uracil phosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 885,658 | 0 | A | G | 98.3% | 201.2 / ‑4.7 | 59 | I158I (ATT→ATC) | ybjI | 5‑amino‑6‑(5‑phospho‑D‑ribitylamino)uracil phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (27/30); total (27/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCCATAATTTCTGCAGTTGGCGAAGGCCATTGGCTTTATGTACGCCGGGGATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGAATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCATCGTCATATTTTTTGAG > NC_000913/885522‑885789 | cccATAATTTCTGCAGTTGGCGAAGGCCATTGGCTTTATGTACGCCGGGGATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATc > 1:217643/1‑140 (MQ=255) cATAATTTCTGCAGTTGGCGAAGGCCATTGGCTTTATGTACGCCGGGGATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAg > 1:361722/1‑140 (MQ=255) tGCAGTTGGCGAAGGCCATTGGCTTTATGTACGCCGGGGATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGGCACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGa < 2:228013/140‑1 (MQ=255) gTTGGCGAAGGCCATTGGCTTTATGTACGCCGGGGATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGa > 1:904900/1‑140 (MQ=255) aGGCCATTGGCTTTATGTACGCCGGGGATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGcc < 1:766844/140‑1 (MQ=255) aGGCCATTGGCTTTATGTACGCCGGGGATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGcc < 2:275688/140‑1 (MQ=255) ccATTGGCTTTATGTACGCCGGGGATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCaaa < 2:966116/140‑1 (MQ=255) ccATTGGCTTTATGTACGCCGGGGATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGG‑ATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAAc < 2:302813/140‑1 (MQ=255) tGGCTTTATGTACGCCGGGGATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTa < 2:361722/140‑1 (MQ=255) cGCCGGGGATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATcc > 1:121648/1‑140 (MQ=255) cGGGGATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCctct > 1:346450/1‑140 (MQ=255) ggggATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTa < 2:716064/140‑1 (MQ=255) gggATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTaa < 2:694581/140‑1 (MQ=255) ggATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAg > 1:1091127/1‑140 (MQ=255) ggATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAg > 1:583154/1‑140 (MQ=255) cGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTa < 2:217643/140‑1 (MQ=255) cGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTa < 2:129344/140‑1 (MQ=255) cGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTa < 2:121648/140‑1 (MQ=255) aTGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTaa < 1:369565/125‑1 (MQ=255) aTGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTaa > 2:369565/1‑125 (MQ=255) aTGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATc > 2:113464/1‑140 (MQ=255) aTGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACAGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATc > 2:921271/1‑140 (MQ=255) tgctgcCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCg > 1:437031/1‑140 (MQ=255) gCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCa > 1:462301/1‑140 (MQ=255) gCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCa < 2:346450/140‑1 (MQ=255) cGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGa < 1:113464/140‑1 (MQ=255) ggTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGAc < 1:463242/140‑1 (MQ=255) ggTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGAATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGAc < 1:120026/140‑1 (MQ=255) tgGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTg > 2:704398/1‑140 (MQ=255) ggACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGa < 2:356296/140‑1 (MQ=255) cGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGataat > 1:323749/1‑140 (MQ=255) acacCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATAc > 1:978617/1‑140 (MQ=255) cacCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACa > 2:566116/1‑140 (MQ=255) tatCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTccacc < 1:837631/140‑4 (MQ=255) tatCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGcc < 2:323749/140‑1 (MQ=255) tCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACAt < 2:540711/131‑1 (MQ=255) tCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACAt > 1:540711/1‑131 (MQ=255) cGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCAcc > 2:150564/1‑140 (MQ=255) ccGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGt > 1:136123/1‑140 (MQ=255) ccGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGt > 1:409961/1‑140 (MQ=255) ccGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGt > 2:299093/1‑140 (MQ=255) ccGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGt > 1:397188/1‑140 (MQ=255) ccGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGt > 2:189626/1‑140 (MQ=255) ccGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGt > 1:967862/1‑140 (MQ=255) ccGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGt < 1:150564/140‑1 (MQ=255) aTGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGtttt > 2:270009/1‑140 (MQ=255) aTGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGtttt > 2:1118588/1‑140 (MQ=255) tGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTc > 2:503854/1‑140 (MQ=255) cTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATgg < 1:299093/140‑1 (MQ=255) cATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCa < 2:136123/140‑1 (MQ=255) tAATGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCATCGt < 1:825570/140‑1 (MQ=255) aTGCTTTTTGTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCATCGTCa 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gTACTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCATCGTCATATTTTTTg < 2:913031/140‑1 (MQ=255) aCTTGTGGGATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCATCGTCATATTTTTTGAg < 1:189626/140‑1 (MQ=255) | CCCATAATTTCTGCAGTTGGCGAAGGCCATTGGCTTTATGTACGCCGGGGATAATCAGATCGATGCTGCCGTTGCCGGTGTGGACCGACACCATAATATCGCCGATGGCCTCATGTAATGCTTTTTGTACTTGTGGAATCAGTTCATCGGAAAGATTCAGGCCAAACTTAAAGAAGATATCCTCTAAGTTGTCAAAGTTATCGACGTATTCCAGACGGTGATAATACATTTCCGCCACCGTTTTCATGGCATCGTCATATTTTTTGAG > NC_000913/885522‑885789 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |