| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,717,821 | (C)5→6 | coding (708/1038 nt) | yfiF ← | putative methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,717,816 | 1 | . | C | 98.5% | 242.6 / ‑3.5 | 68 | coding (713/1038 nt) | yfiF | putative methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (40/27); total (40/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
AACAGCGGTTTACCCTGCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCAGAACGCAATCCTGCGCGCCT > NC_000913/2717678‑2717950 | aaCAGCGGTTTACCCTGCTCGCTGAAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAgccg‑‑c > 2:43369/1‑140 (MQ=255) aGCGGTTTACCCTGCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑‑c‑ccc < 2:708452/140‑1 (MQ=255) cGGTTTACCCTGCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑‑c‑ccccc < 2:468489/140‑2 (MQ=255) cGGTTTACCCTGCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑‑c‑ccccc > 2:1165741/1‑139 (MQ=255) tttACCCTGCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑‑c‑cccccgac < 2:132075/140‑5 (MQ=255) tACCCTGCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGTGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTc > 1:955961/1‑140 (MQ=255) tGCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCcagca < 1:1165741/140‑1 (MQ=255) tGCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑‑c‑ccccc < 1:309620/130‑2 (MQ=255) tGCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑‑c‑ccccc > 2:309620/1‑129 (MQ=255) gCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCcagcag > 2:639730/1‑140 (MQ=255) cTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGt > 1:603698/1‑140 (MQ=255) cTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGt > 2:332987/1‑140 (MQ=255) cTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGt > 1:66584/1‑140 (MQ=255) tCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTg > 2:890593/1‑140 (MQ=255) tGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑‑CACCCCGACTCCAGCAGTGCCGc < 2:209939/140‑1 (MQ=255) gTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGca < 1:1313645/140‑1 (MQ=255) tCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGcac < 1:890593/140‑1 (MQ=255) tACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACg > 1:488372/1‑140 (MQ=255) tgtAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACAcc > 2:681872/1‑140 (MQ=255) tAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCtt < 2:1073015/140‑1 (MQ=255) aCCTGCCTGACGGAAATCATCGAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTc > 2:968428/1‑140 (MQ=255) cctgcctgACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCa > 1:1287570/1‑140 (MQ=255) cctgcctgACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCa > 1:1103106/1‑140 (MQ=255) cctgcctgACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGCGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCa > 1:1284460/1‑140 (MQ=255) gcctgACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACg > 2:931001/1‑127 (MQ=255) gcctgACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACg < 1:931001/127‑1 (MQ=255) gcctgACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGc > 2:1087865/1‑140 (MQ=255) gcctgACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGc > 2:16942/1‑140 (MQ=255) gcctgACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGc > 2:499429/1‑140 (MQ=255) ctgACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCg > 1:105872/1‑140 (MQ=255) ctgACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCg < 1:69293/140‑1 (MQ=255) ctgACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCg < 1:1327829/140‑1 (MQ=255) atcatcCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTgcgcg < 1:294069/140‑1 (MQ=255) atcatcCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTgcgcg < 2:66584/140‑1 (MQ=255) atcatcCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTgcgcg > 1:1064247/1‑140 (MQ=255) tcCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCATTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGc > 2:1046372/1‑140 (MQ=255) cACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTgcgc > 1:1304630/1‑140 (MQ=255) tAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGcatcat > 1:734592/1‑140 (MQ=255) tAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGcatcat > 1:901104/1‑140 (MQ=255) aaCAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATg < 2:1287570/140‑1 (MQ=255) aaCAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATg < 2:1304630/140‑1 (MQ=255) aaCAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATg < 2:491833/140‑1 (MQ=255) aaCAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATg < 2:603698/140‑1 (MQ=255) aaCAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATg > 1:615330/1‑140 (MQ=255) aCAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGc < 1:43369/140‑1 (MQ=255) aTGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGTAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCAc > 1:1067057/1‑140 (MQ=255) aTGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCAc < 2:1284460/140‑1 (MQ=255) gttgtCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGc < 1:654824/135‑1 (MQ=255) gttgtCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGc > 2:654824/1‑135 (MQ=255) ttgtCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATg > 1:1108413/1‑133 (MQ=255) ttgtCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATg < 2:1108413/133‑1 (MQ=255) ttgtCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCa > 2:405104/1‑140 (MQ=255) ttgtCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCa < 1:598275/140‑1 (MQ=255) gtCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCAGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAgg > 2:1295586/1‑140 (MQ=255) tCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGt > 2:1095556/1‑140 (MQ=255) tCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGt > 1:667752/1‑140 (MQ=255) tAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGCCC‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCg > 2:522337/1‑140 (MQ=255) tAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCAcc > 2:1130816/1‑128 (MQ=255) tAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCAcc < 1:1130816/128‑1 (MQ=255) tAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCgg > 1:425854/1‑140 (MQ=255) aCGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGt < 1:332987/140‑1 (MQ=255) gCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTc < 1:1095556/140‑1 (MQ=255) ctctGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTcc > 1:179208/1‑140 (MQ=255) ctctGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTcc > 1:296292/1‑140 (MQ=255) ctGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAg < 2:105872/140‑1 (MQ=255) ctGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAg < 1:1046372/140‑1 (MQ=255) gccgccTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGcc < 1:639730/140‑1 (MQ=255) ccgccTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCa < 1:681872/140‑1 (MQ=255) ccgccTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCAGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCa < 1:1295586/140‑1 (MQ=255) gccTTCTGCGGTACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCAGa < 2:425854/140‑1 (MQ=255) tACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCAGAACGCAATCCTg > 2:66695/1‑140 (MQ=255) tACGGATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCAGAACGCAATCCTg > 1:536283/1‑140 (MQ=255) ggATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCAGAACGCAATCCTgcgc > 1:64394/1‑140 (MQ=255) ggATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGAGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCAGAACGCAATCCTgcgc > 1:1091822/1‑140 (MQ=255) gATAGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCAGAACGCAATCCTgcgcg < 1:16942/140‑1 (MQ=255) aGCCGC‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCAGAACGCAATCCTGCGCgcct > 1:553670/1‑140 (MQ=255) | AACAGCGGTTTACCCTGCTCGCTGGAAGTGGTCACTACGGTGTAACCTGCCTGACGGAAATCATCCAGCACGTTAACAATGTTGTCGCCAGTAATCGGCTGAACGTGCTCTGCGCCGCCTTCTGCGGTACGGATAGCCG‑‑C‑CCCCGACTCCAGCAGTGCCGCATCCTGCACCACGACACCTTTCACGCCGAAGTGCGCGCAGCTGCGCATCATGCCACCCAGGTTATGCGGGTTAGATTCGTTTTCCAGTGCCAGAACGCAATCCTGCGCGCCT > NC_000913/2717678‑2717950 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |