Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 2,857,096 | Δ2,538 bp | coding (4‑2541/2562 nt) | mutS → | DNA mismatch repair protein MutS |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 2857096 | 2859633 | 2538 | 81 [0] | [0] 79 | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2857095 | 0 (0.000) | 79 (0.980) | 48/276 | 0.4 | 100% | coding (3/2562 nt) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
? | NC_000913 | 2859634 = | 0 (0.000) | coding (2542/2562 nt) | mutS | DNA mismatch repair protein MutS |
AGCATCAAGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2856962‑2857095 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTAC > NC_000913/2859634‑2859770 AGCATCAAGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTG > 2:633632/1‑140 CATCAAGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAA > 2:1013763/1‑140 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CGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAAAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGA < 2:1292244/140‑1 TGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAAC > 2:531154/1‑140 TGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAAC < 1:531154/140‑1 TGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAAC > 1:508988/1‑140 TGCGCCTTATGTGATTACAACG‑AAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGAC > 1:146514/1‑140 CGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACA > 2:1073125/1‑140 CGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACA > 1:735302/1‑140 CTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACT > 1:391418/1‑140 CTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACT > 2:1065142/1‑140 TTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACATCTG < 2:391418/140‑1 TATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGA > 2:160999/1‑140 TACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAA > 2:232352/1‑140 TACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAA > 2:382594/1‑140 TACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAA > 1:1021206/1‑140 ACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAA < 1:524858/140‑1 CGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATACCCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAA < 1:235178/140‑1 AAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAA < 1:382594/140‑1 AATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACA < 2:1021206/140‑1 AATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACA < 1:397108/140‑1 AATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACA < 2:962039/140‑1 TAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 1:933835/140‑1 TAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 1:898795/140‑1 TAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 1:232352/140‑1 AAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCCTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCC < 1:443932/140‑1 AAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCT < 1:633632/140‑1 AAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTG < 2:146514/140‑1 TCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAAT < 2:691583/140‑1 TCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAAT > 1:1055048/1‑140 TCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 1:519070/131‑1 TCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC > 2:519070/1‑131 TCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC < 2:685164/131‑1 TCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACC > 1:685164/1‑131 CATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGC < 2:354149/140‑1 CATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGC > 2:805787/1‑140 TTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTT > 2:555552/1‑140 TTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTT > 1:543360/1‑140 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ATCAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTA < 1:555552/140‑1 CAGGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACA < 2:543360/140‑1 GGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGG > 1:1256502/1‑140 GGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGG > 2:200319/1‑140 GGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGG > 1:1144707/1‑140 GGGAACCGGACATAACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTA‑TTTACAGGG > 2:1125462/1‑140 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AACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCC < 1:1073125/140‑1 AACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCC < 1:1283131/140‑1 AACCCCATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCC < 1:951359/140‑1 CATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTA > 2:1347419/1‑140 ATGCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTAC > 2:745121/1‑140 AGCATCAAGAACTCGCCGTTCGCTTCTTCCCCTGAAATGATTAACTCCGGTATCATGTGCGCCTTATGTGATTACAACGAAAATAAAAACCATCACACCCCATTTAATATCAGGGAACCGGACATAACCCCATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2856962‑2857095 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTAC > NC_000913/2859634‑2859770 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |