| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,070,708 | G→A | T179T (ACC→ACT) | fbaA ← | fructose‑bisphosphate aldolase class II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,070,708 | 0 | G | A | 98.8% | 294.8 / ‑4.4 | 85 | T179T (ACC→ACT) | fbaA | fructose‑bisphosphate aldolase class II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (46/38); total (47/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
ACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCGGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGATCATGTGAGAAGAGAACAGCGGCTTACCGG > NC_000913/3070573‑3070844 | aCCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGc > 1:275621/1‑140 (MQ=255) cGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCaa > 2:703545/1‑140 (MQ=255) ggACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCa < 1:8412/140‑1 (MQ=255) ggACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCa > 1:1078140/1‑140 (MQ=255) aCGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGt > 1:909562/1‑140 (MQ=255) cGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGtt > 1:1294999/1‑140 (MQ=255) cTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCg > 1:538512/1‑140 (MQ=255) tGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGa > 1:135139/1‑140 (MQ=255) tGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGa < 2:331583/140‑1 (MQ=255) aaaCGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGt > 1:963219/1‑140 (MQ=255) aaaCGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGt > 2:461010/1‑140 (MQ=255) aaaCGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGt > 2:931233/1‑140 (MQ=255) aCGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCa > 1:1285818/1‑140 (MQ=255) aCGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCa > 1:97786/1‑140 (MQ=255) aCGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCa > 2:851261/1‑140 (MQ=255) cgGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATg > 2:648016/1‑139 (MQ=255) cgGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATg < 1:648016/139‑1 (MQ=255) cgGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGc < 2:1294999/140‑1 (MQ=255) cgGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGc < 1:396027/140‑1 (MQ=255) ggCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGc > 1:984929/1‑138 (MQ=255) ggCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGc < 2:984929/138‑1 (MQ=255) ggCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCg > 1:531576/1‑140 (MQ=255) cTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGAt < 1:960583/140‑1 (MQ=255) aTTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGAtttt > 2:1106110/1‑140 (MQ=255) cTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACAt < 2:538512/140‑1 (MQ=255) tCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATg < 2:909562/140‑1 (MQ=255) gTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATgcgc < 2:963219/140‑1 (MQ=255) tCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTc < 1:461010/140‑1 (MQ=255) tCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTc < 1:538323/140‑1 (MQ=255) tCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTc < 1:329982/140‑1 (MQ=255) tCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTc < 1:781306/140‑1 (MQ=255) tgtATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAgg > 2:1267/1‑140 (MQ=255) tGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTAtt > 2:721703/1‑140 (MQ=255) tGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTAtt < 1:1267/140‑1 (MQ=255) gCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTAttt > 1:1319600/1‑140 (MQ=255) gCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTAttt > 1:277164/1‑140 (MQ=255) gCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTAttt > 1:1312150/1‑140 (MQ=255) aTCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGc > 2:742259/1‑140 (MQ=255) aaCGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGa < 2:1078140/140‑1 (MQ=255) gTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGAttt < 1:798021/140‑1 (MQ=255) gTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGAttt < 1:703545/140‑1 (MQ=255) tCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGAt > 2:1193429/1‑140 (MQ=255) ccGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATg > 2:487334/1‑140 (MQ=255) ccGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATg < 2:1319600/140‑1 (MQ=255) ggTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCtt > 2:395917/1‑140 (MQ=255) tACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCag < 1:931233/140‑1 (MQ=255) cAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCagag < 2:435403/140‑1 (MQ=255) gCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGAttc > 2:1079976/1‑140 (MQ=255) cAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCagag > 1:75272/1‑135 (MQ=255) cAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCagag < 2:75272/135‑1 (MQ=255) cAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGAttct > 1:58232/1‑140 (MQ=255) aGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGAttctt > 1:791721/1‑140 (MQ=255) aaGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTTGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCa > 2:844806/1‑140 (MQ=255) aaGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCa > 2:36450/1‑140 (MQ=255) aaGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCa < 2:277164/140‑1 (MQ=255) aaGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCa < 2:791721/140‑1 (MQ=255) tCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCa < 2:1200575/135‑1 (MQ=255) tCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCa > 1:1200575/1‑135 (MQ=255) tCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAg > 2:691082/1‑140 (MQ=255) tCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAg > 2:1360824/1‑140 (MQ=255) tCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAg > 1:1143136/1‑140 (MQ=255) tCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAg > 1:502183/1‑140 (MQ=255) tCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAg > 2:631709/1‑140 (MQ=255) cATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAgg > 2:350575/1‑139 (MQ=255) cATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAgg < 1:350575/139‑1 (MQ=255) cATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGt < 2:502183/140‑1 (MQ=255) tgtgGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCg < 1:641881/140‑1 (MQ=255) tgtgGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCg < 2:275621/140‑1 (MQ=255) tgGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGAt < 1:742259/140‑1 (MQ=255) tgGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGAt < 2:1145935/140‑1 (MQ=255) tgGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGAt < 1:647929/140‑1 (MQ=255) gCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGATCa < 1:631709/140‑1 (MQ=255) cTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGATCAt > 2:72436/1‑140 (MQ=255) gttgtCCACGCCGTCTTCTTCACCACCGGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGATCAtgt > 2:843772/1‑140 (MQ=255) tgtCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGa < 1:594211/124‑1 (MQ=255) tgtCCACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGa > 2:594211/1‑124 (MQ=255) ccACGCTGTCTTCTTCACCACCGGTGCAACCCAGTTCGATGTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATGCGGCAGAAAGGGCGATCATGTgagaa < 2:1011125/140‑1 (MQ=255) cACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGATCATGTgagaag > 2:79909/1‑140 (MQ=255) cACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGATCATGTgagaag > 1:941485/1‑140 (MQ=255) cACGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGATCATGTgagaag > 1:670356/1‑140 (MQ=255) cGCCGTCTTCTTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGATCATGTgagaagag > 1:1112495/1‑140 (MQ=255) tcttctTCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGATCATGTGAGAAGAGAACAg < 1:1193429/140‑1 (MQ=255) cttcttCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGATCATGTGAGAAGAGAACAGc < 2:1285818/140‑1 (MQ=255) cttcttCACCACCAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGATCATGTGAGAAGAGAACAGc > 1:862068/1‑140 (MQ=255) accaccAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGATCATGTGAGAAGAGAACAGCGGCTTAc < 2:531576/140‑1 (MQ=255) accAGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGATCATGTGAGAAGAGAACAGCGGCTTACCgg < 2:941485/140‑1 (MQ=255) | ACCGAAGGACGCTGCGATGGTGAAACGCGGGCTGATTTTGCTCAGTTCGGTGTATGCGTAATCAACGTCTTCCGGCTGGGTGTACAGTGCAGAAGCGTCCATGTGGCTGTTGTCCACGCCGTCTTCTTCACCACCGGTGCAACCCAGTTCGATTTCCAGAGTCATGCCGATTTTGGACATGCGCTCCAGGTATTTAGAGCAGATTTCGATGTTCTCTTGCAGAGATTCTTCAGACAGGTCGATCATGTGAGAAGAGAACAGCGGCTTACCGG > NC_000913/3070573‑3070844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |