Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 489,266 | A→G | K911E (AAA→GAA) | mscK → | potassium dependent, small conductance mechanosensitive channel |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 489,266 | 0 | A | G | 97.2% | 259.0 / ‑2.1 | 72 | K911E (AAA→GAA) | mscK | potassium dependent, small conductance mechanosensitive channel |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (41/29); minor base T (1/1); total (42/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.85e-01 |
AGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATAAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTGGT > NC_000913/489139‑489400 | aGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGtggc < 1:322020/140‑1 (MQ=255) ggTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCg < 1:600635/140‑1 (MQ=255) tctcGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCgcagca < 2:848104/140‑1 (MQ=255) tGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTa > 2:516931/1‑140 (MQ=255) aaTATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAgg > 2:1354090/1‑140 (MQ=255) aaTATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAgg > 2:190406/1‑140 (MQ=255) tactacCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCg > 1:287126/1‑140 (MQ=255) cATCCTTAACTGCATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACt > 2:1000662/1‑140 (MQ=255) aTCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACtt > 1:77825/1‑140 (MQ=255) aTCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACtt > 1:457523/1‑140 (MQ=255) aaCTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGtctc > 2:987742/1‑140 (MQ=255) aaCTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGtctc > 1:913476/1‑140 (MQ=255) aaCTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGtctc > 2:404694/1‑140 (MQ=255) tgcatcatTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCgg < 1:1000662/138‑1 (MQ=255) tACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCgg < 2:148904/140‑1 (MQ=255) aCATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGt < 2:1247051/140‑1 (MQ=255) aCATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGt < 1:127323/140‑1 (MQ=255) catcatTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGtt > 2:1261664/1‑140 (MQ=255) catcatTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGtt > 1:200213/1‑140 (MQ=255) catcatTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGtt > 2:676233/1‑140 (MQ=255) catcatTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGtt > 2:245179/1‑140 (MQ=255) catcatTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGtt > 2:2098/1‑140 (MQ=255) catcatTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGtt < 1:1354090/140‑1 (MQ=255) atcatTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGttt > 1:277384/1‑140 (MQ=255) atcatTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGttt > 2:1348306/1‑140 (MQ=255) atcatTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGttt > 1:669460/1‑140 (MQ=255) atcatTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGttt > 1:298018/1‑140 (MQ=255) catTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGa < 1:1348306/140‑1 (MQ=255) ttattGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATc > 2:630969/1‑140 (MQ=255) ttattGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATc > 2:163357/1‑140 (MQ=255) ttattGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATc > 1:1357657/1‑140 (MQ=255) ttattGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATc > 1:1340883/1‑140 (MQ=255) tattGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCa < 2:151817/140‑1 (MQ=255) tattGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCa > 1:151817/1‑140 (MQ=255) tattGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCa < 2:277384/140‑1 (MQ=255) attGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCAt < 1:630969/140‑1 (MQ=255) ttGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCAtt < 1:878284/140‑1 (MQ=255) ttGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCAtt > 2:428752/1‑140 (MQ=255) ttGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCAtt < 2:1340883/140‑1 (MQ=255) gTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTAtt > 2:314692/1‑140 (MQ=255) gTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTAtt < 1:987742/140‑1 (MQ=255) gTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTAtt < 1:404694/140‑1 (MQ=255) ttGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTc > 2:44130/1‑140 (MQ=255) ttGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTc > 1:136684/1‑140 (MQ=255) tGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCgg < 2:374425/123‑1 (MQ=255) tGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCgg > 1:374425/1‑123 (MQ=255) tGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCg < 2:913476/140‑1 (MQ=255) ggTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGa > 2:403048/1‑140 (MQ=255) ggTGCGATGACGGTGTTCAGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGa > 1:1232924/1‑140 (MQ=255) gTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGaa < 1:403048/140‑1 (MQ=255) gATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTc < 1:163357/140‑1 (MQ=255) gATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTc > 1:911885/1‑140 (MQ=255) gATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTc < 2:1044882/140‑1 (MQ=255) tGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCg < 1:44130/140‑1 (MQ=255) gACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCgg > 2:870826/1‑140 (MQ=255) aCGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGt < 1:314692/140‑1 (MQ=255) gtgtTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCg > 1:1112610/1‑140 (MQ=255) cGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTg > 1:54445/1‑140 (MQ=255) ggATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTgg < 2:200213/140‑1 (MQ=255) aTCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCg > 1:1241480/1‑140 (MQ=255) aTCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCg > 1:944456/1‑140 (MQ=255) aTCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCg > 1:183469/1‑140 (MQ=255) tCGCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGa < 2:327573/140‑1 (MQ=255) gCTGGGCGTCTCTTGGGATTAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTc < 2:878104/122‑1 (MQ=255) gCTGGGCGTCTCTTGGGATTAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTc > 1:878104/1‑122 (MQ=255) gCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGa > 2:835881/1‑138 (MQ=255) gCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGa < 1:835881/138‑1 (MQ=255) gCTGGGCGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATa < 2:287126/140‑1 (MQ=255) cGTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTaa < 2:1112610/140‑1 (MQ=255) gTCTCTTGGGATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAAc < 2:938322/140‑1 (MQ=255) gggATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTGGt > 2:1136341/1‑140 (MQ=255) gggATGAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTGGt > 1:399406/1‑140 (MQ=255) | AGTGCTGGTGCTCTCGCGACTGAATATGCGCCAGGGCGCGTCGTATGCCATTACTACCATCCTTAACTACATCATTATTGCTGTTGGTGCGATGACGGTGTTCGGATCGCTGGGCGTCTCTTGGGATAAACTCCAGTGGCTGGCCGCAGCATTATCCGTAGGTCTTGGTTTTGGTTTACAAGAAATTTTCGGTAACTTCGTCTCCGGTTTGATCATTCTATTCGAACGTCCGGTGCGTATTGGCGATACGGTAACCATTGGT > NC_000913/489139‑489400 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |