Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 511,219 | T→C | E54G (GAA→GGA) E54G (GAA→GGA) |
copA ← copA ← |
Cu(+) exporting P‑type ATPase Cu(+) exporting P‑type ATPase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 511,219 | 0 | T | C | 100.0% | 226.2 / NA | 61 | E54G (GAA→GGA) E54G (GAA→GGA) | copA copA | Cu(+) exporting P‑type ATPase Cu(+) exporting P‑type ATPase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (31/30); total (31/30) |
TCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTC > NC_000913/511087‑511352 | tcgtcatcgGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAg < 2:256026/140‑1 (MQ=255) tcgGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTc < 1:1254420/140‑1 (MQ=255) cGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTgg < 1:384268/140‑1 (MQ=255) gCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGt < 1:83717/140‑1 (MQ=255) cTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGt > 1:1330564/1‑140 (MQ=255) tCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTg < 1:993983/140‑1 (MQ=255) tCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTg < 1:147399/140‑1 (MQ=255) aGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTgcg > 2:478355/1‑140 (MQ=255) aaCCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCtt < 1:1063459/140‑1 (MQ=255) ccGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCa < 1:182100/140‑1 (MQ=255) tGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCtt < 1:146406/134‑1 (MQ=255) tGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCtt > 2:146406/1‑134 (MQ=255) aGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGa > 1:1209048/1‑140 (MQ=255) tCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATc > 1:484290/1‑140 (MQ=255) ccGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAg > 1:1115125/1‑132 (MQ=255) ccGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAg < 2:1115125/132‑1 (MQ=255) cGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCg > 2:280868/1‑140 (MQ=255) gACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGc < 1:522193/140‑1 (MQ=255) aCGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATcc < 1:1294824/137‑1 (MQ=255) aCGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATcc > 2:1294824/1‑137 (MQ=255) gATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCt < 1:561058/140‑1 (MQ=255) gATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCt < 1:577444/140‑1 (MQ=255) aTTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTc > 2:704186/1‑140 (MQ=255) aCTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCaa < 1:116043/135‑1 (MQ=255) aCTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCaa > 2:116043/1‑135 (MQ=255) tCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCgg > 2:75811/1‑140 (MQ=255) tCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCgg > 1:801630/1‑140 (MQ=255) tCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCgg > 2:135488/1‑140 (MQ=255) tCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCgg > 1:555238/1‑140 (MQ=255) ccGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCaa < 1:1032243/132‑1 (MQ=255) ccGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCaa > 2:1032243/1‑132 (MQ=255) cGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGAc > 1:1195551/1‑140 (MQ=255) cGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGAc > 1:536427/1‑140 (MQ=255) cGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGa < 2:1355089/133‑1 (MQ=255) cGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGa > 1:1355089/1‑133 (MQ=255) cGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATAAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGtt > 1:716184/1‑140 (MQ=255) gTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCa < 2:1195551/140‑1 (MQ=255) tAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGa > 1:881681/1‑140 (MQ=255) tAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGa > 1:695368/1‑140 (MQ=255) tttGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGActttc > 2:153928/1‑140 (MQ=255) gTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCa < 2:536427/140‑1 (MQ=255) gCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCAcgc > 2:673523/1‑140 (MQ=255) gCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCa > 1:985805/1‑140 (MQ=255) gCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCa > 2:22201/1‑140 (MQ=255) gCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCa > 2:261764/1‑140 (MQ=255) cGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAg > 2:81785/1‑140 (MQ=255) cGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGAAACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCAc < 1:917034/127‑1 (MQ=255) cGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGAAACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCAc > 2:917034/1‑127 (MQ=255) gTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGt < 2:881681/140‑1 (MQ=255) gTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGt < 1:22201/140‑1 (MQ=255) gTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGt < 2:695368/140‑1 (MQ=255) gTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGt < 2:985805/140‑1 (MQ=255) gTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGt < 1:261764/140‑1 (MQ=255) gTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGt < 1:75811/140‑1 (MQ=255) aTAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGt > 2:364562/1‑137 (MQ=255) aTAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGt < 1:364562/137‑1 (MQ=255) tAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGt < 2:853511/136‑1 (MQ=255) tAACCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGt > 1:853511/1‑136 (MQ=255) aaCCCGCTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCg < 1:81785/140‑1 (MQ=255) cTTGTTTGATGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGAc > 1:466714/1‑140 (MQ=255) aTGGTTCCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTc < 1:280868/140‑1 (MQ=255) | TCGTCATCGGCGGTCGCTGCCGGAAGCGCCTCAGAAACCGCTGTCAGTGCTTCCGACGGGATTGATGACTCCGCCAGCGGTTTAGCCTTTGGGTGGCTTACAGATGCGTCATAACCCGCTTGTTTGATGGTTTCGATCAGCTGTTCTGCACTGGCAGTCCCGGTAACGTGCGCTTCAGTGATAGACACATCCGCCTGCTCAACATCCGGACGCTGTTCAAGACTTTCTTTCACGCGTTTAACGCAGTGACCGCAGGACAGGCCGTC > NC_000913/511087‑511352 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |