| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,529,541 | T→C | pseudogene (1652/2049 nt) | rhsE → | RhsE protein in rhs element |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,529,541 | 0 | T | C | 98.7% | 539.5 / ‑3.1 | 151 | pseudogene (1652/2049 nt) | rhsE | RhsE protein in rhs element |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (70/79); total (71/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
CCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACT > NC_000913/1529404‑1529677 | cccGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGGTTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCAc < 2:1227596/140‑1 (MQ=255)cccGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCAc < 1:707353/140‑1 (MQ=255) cGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCt > 2:1303774/1‑140 (MQ=255) gACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTgg > 2:466/1‑140 (MQ=255) gACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTgg > 2:1002513/1‑140 (MQ=255) aCCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGga > 2:628651/1‑140 (MQ=255) gATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGgattga < 1:407290/140‑1 (MQ=255) aTTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGgattgat > 1:504645/1‑140 (MQ=255) aTTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGgattgat > 2:838706/1‑140 (MQ=255) aTTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGgattgat > 2:222221/1‑140 (MQ=255) aTTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGgattgat > 1:1277604/1‑140 (MQ=255) aTTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGgattgat > 1:135356/1‑140 (MQ=255) tGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGattgattg < 2:1277604/140‑1 (MQ=255) ggTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATtgct < 2:735191/140‑1 (MQ=255) tGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCa > 1:1088872/1‑140 (MQ=255) agagGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCaaa > 2:734793/1‑140 (MQ=255) agagGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCaaa > 1:343430/1‑140 (MQ=255) agGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACa < 1:1043708/140‑1 (MQ=255) agGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACa < 1:1237050/140‑1 (MQ=255) agGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACa < 2:504645/140‑1 (MQ=255) gTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGc < 1:397769/140‑1 (MQ=255) gTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGc < 2:224339/140‑1 (MQ=255) gTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGc < 1:222221/140‑1 (MQ=255) gTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGc < 2:296633/140‑1 (MQ=255) gTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGc < 1:1307001/140‑1 (MQ=255) gTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGc < 1:79955/140‑1 (MQ=255) gatggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCAtt > 2:314643/1‑140 (MQ=255) gatggaATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCAtt < 2:26036/140‑1 (MQ=255) aaTATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCAtt > 2:901557/1‑135 (MQ=255) aaTATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTaa < 1:734793/140‑1 (MQ=255) aaTATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTaa < 2:1088872/140‑1 (MQ=255) gTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAATGGGGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAg > 1:702408/1‑140 (MQ=255) aGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTAc < 2:910499/140‑1 (MQ=255) aGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTAc > 1:193316/1‑140 (MQ=255) aGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTAc > 1:1359623/1‑140 (MQ=255) gTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTAcc > 2:857178/1‑140 (MQ=255) gTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTAcc < 1:838706/140‑1 (MQ=255) tATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCa > 1:68002/1‑140 (MQ=255) aTCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAg < 2:193316/140‑1 (MQ=255) aTCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAg > 2:1258643/1‑140 (MQ=255) tCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTaa > 1:1024347/1‑126 (MQ=255) ccGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGtt < 1:1258643/140‑1 (MQ=255) gTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTaa > 2:769645/1‑123 (MQ=255) gTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTaa < 1:769645/123‑1 (MQ=255) ttGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCgg < 1:1002513/140‑1 (MQ=255) tGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGt < 1:262982/140‑1 (MQ=255) tGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGt < 1:516460/140‑1 (MQ=255) aTCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCg < 1:1276963/135‑1 (MQ=255) tCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATg > 2:1193521/1‑140 (MQ=255) ccATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGat < 2:149395/140‑1 (MQ=255) aTACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGatat < 1:1147546/140‑1 (MQ=255) aTACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGatat < 2:310622/140‑1 (MQ=255) tACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGtt > 2:1351244/1‑127 (MQ=255) gTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGtt < 1:1000621/122‑1 (MQ=255) tAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTAtt > 1:310287/1‑140 (MQ=255) tAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTAtt > 1:991837/1‑140 (MQ=255) cccAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTAttgttg > 2:166667/1‑140 (MQ=255) aaT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg < 2:682971/140‑1 (MQ=255) aaT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg > 2:1095273/1‑140 (MQ=255) aaT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg < 2:760826/140‑1 (MQ=255) aaT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg > 1:447309/1‑140 (MQ=255) aT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTAttgt < 1:94521/134‑1 (MQ=255) t‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg > 2:66496/1‑138 (MQ=255) t‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg < 1:66496/138‑1 (MQ=255) gTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTc > 1:442086/1‑140 (MQ=255) aTTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg > 1:861739/1‑124 (MQ=255) aTTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCg < 2:861739/124‑1 (MQ=255) aTTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGa < 2:702615/126‑1 (MQ=255) aTTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGgc < 1:166667/140‑1 (MQ=255) aTTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGgc > 1:695415/1‑140 (MQ=255) agaATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGTTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGgccgcc > 1:809981/1‑140 (MQ=255) gACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCaa < 2:695415/140‑1 (MQ=255) gACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCaa < 1:291839/140‑1 (MQ=255) cATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATg < 1:75485/140‑1 (MQ=255) aTCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATga > 2:100369/1‑140 (MQ=255) cAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATgaga < 2:419285/140‑1 (MQ=255) cAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCaa < 1:48911/135‑1 (MQ=255) cAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATgaga < 2:306133/140‑1 (MQ=255) cAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATgaga > 2:345694/1‑140 (MQ=255) cAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATgaga < 2:286327/140‑1 (MQ=255) ggTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACa < 2:1264971/140‑1 (MQ=255) tGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTATCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACAtt < 2:667769/140‑1 (MQ=255) cTAATTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTa > 2:416688/1‑140 (MQ=255) aTTTATGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATga > 2:1081299/1‑127 (MQ=255) tGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACtt < 1:1156969/135‑1 (MQ=255) tGCCGTATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGAtgt > 2:1098076/1‑140 (MQ=255) tATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGa > 1:222143/1‑140 (MQ=255) tATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGa < 2:984057/140‑1 (MQ=255) tATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGa > 1:1090738/1‑140 (MQ=255) tATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGa > 1:601168/1‑140 (MQ=255) tATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGa < 1:859065/140‑1 (MQ=255) tATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGa < 1:230390/140‑1 (MQ=255) tATCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGa < 2:447309/140‑1 (MQ=255) aTCTGGTGCACCTGGTTTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGaa < 1:345694/140‑1 (MQ=255) tCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGaa < 1:407191/139‑1 (MQ=255) tCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGaa > 2:9038/1‑139 (MQ=255) tCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGaa < 1:9038/139‑1 (MQ=255) tCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGaa > 2:407191/1‑139 (MQ=255) tCTGGTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGa < 2:405631/138‑1 (MQ=255) ggTGCACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCA‑TACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACt > 2:198656/1‑140 (MQ=255) | CCCGGACCCGATTGGGTTGAGAGGTGGATGGAATATGTATCAGTATCCGTTGAATCCCATACAAGTGATAGACCCAAT‑‑GGGGTTAGATGCGATTGAGAATATGACATCAGGTGGACTAATTTATGCCGTATCTGGTGTACCTGGATTGATTGCTGCAAACAGCATTACTAACAGTGCTTACCAGTTCGGTTATGATATGGATGCTATTGTTGGCGGAGCTCATAATGGGGCCGCCGATGCAATGAGACATTGTTACTTGATGTGTCGAATGACT > NC_000913/1529404‑1529677 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |