| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 377372 = | NA (NA) | noncoding (37/37 nt) | other | REP32a | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACG > NC_000913/377233‑377510 | caGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACg > 2:43976/1‑140 (MQ=255) gatgcgacgctaacgcgtcttatcaggcctacaaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaacgcgtcttatcaggcctacGGCTtac < 2:15107‑M2/7‑2 (MQ=255) atgcgacgctaacgcgtcttatcaggcctacaaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctttgcgcgtcttatcaggcctacGGCTtac < 1:432222‑M2/7‑2 (MQ=255) atgcgacgctaacgcgtcttatcaggcctacaaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctatgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTAt < 1:73205‑M2/7‑1 (MQ=255) atgcgacgctaacgcgtcttatcaggcctacaaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctatgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTAt < 1:148570‑M2/7‑1 (MQ=255) cTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGAT‑AGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATgg > 1:344383/1‑140 (MQ=255) gcgcCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCg < 1:675917/140‑1 (MQ=255) acgctaacgcgtcttatcaggcctacaaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctatgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTATGGGCg < 2:53771‑M2/12‑1 (MQ=255) cgctaacgcgtcttatcaggcctacaaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaacgcgtcttatcaggcctacGGTTTAt < 1:573724‑M2/7‑1 (MQ=255) gAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAgtg < 1:102400/140‑1 (MQ=255) 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gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:168272/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:173937/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:348067/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:252108/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:788169/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:764604/140‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCCTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:69688/140‑1 (MQ=255) cGACGCTATGCGCGTCTTATTAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGc < 2:8583/140‑1 (MQ=255) cGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCtatgtctc > 1:384228/1‑133 (MQ=255) cGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGc < 2:350900/140‑1 (MQ=255) 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ttatcaggcctacGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGAt > 2:487363‑M2/14‑140 (MQ=255) ttatcaggcctacGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGAt > 2:469060‑M2/14‑140 (MQ=255) ttatcaggcctacGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGAt > 2:280178‑M2/14‑140 (MQ=255) tatcaggcctacGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATa > 1:175109‑M2/13‑140 (MQ=255) atcaggcctacGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTCCGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATaa > 2:592494‑M2/12‑140 (MQ=255) cctacGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGtt < 1:223789‑M2/135‑1 (MQ=255) cGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACg < 1:469060‑M2/139‑1 (MQ=255) cGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACg > 1:697113‑M2/2‑140 (MQ=255) cGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACg > 1:391612‑M2/2‑140 (MQ=255) | CAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACG > NC_000913/377233‑377510 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |