Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,284,565 | C→T | L64L (CTG→TTG) | yejM → | putative cardiolipin transport protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,284,565 | 0 | C | T | 83.6% | 142.6 / 19.1 | 61 | L64L (CTG→TTG) | yejM | putative cardiolipin transport protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (7/3); new base T (27/24); total (34/27) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGGGCACTGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCCTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACGCTATTACTGATCGATAGCGAAGTCTTTACTC > NC_000913/2284429‑2284703 | ggggCACTGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCCTgg < 2:549262/140‑1 (MQ=255) ggCACTGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCCTGgtg > 1:322457/1‑140 (MQ=255) tGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGc > 1:550122/1‑140 (MQ=255) tttGCACTGTTCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCAc > 2:72029/1‑140 (MQ=255) tGCACTGTTCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCt < 1:343107/140‑1 (MQ=255) gTTCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGc < 1:771963/140‑1 (MQ=255) gTTCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGc < 2:550122/140‑1 (MQ=255) ttgaaTATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCt > 1:691893/4‑140 (MQ=255) ttCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTAc > 2:174731/1‑135 (MQ=255) ttCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTAc < 1:174731/135‑1 (MQ=255) ttCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCt > 1:428578/1‑140 (MQ=255) ttCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCt > 1:66951/1‑140 (MQ=255) ttCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCt > 1:247060/1‑140 (MQ=255) ttCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCCTGGTGTTCGCCACCTACTTGCt > 1:433834/1‑140 (MQ=255) ttCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCCTGGTGTTCGCCACCTACTTGCt > 1:453621/1‑140 (MQ=255) ttCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCCTGGTGTTCGCCACCTACTTGCt > 1:194748/1‑140 (MQ=255) tCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCctct > 2:409752/1‑140 (MQ=255) tCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCctct > 1:462446/1‑140 (MQ=255) tGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTc > 1:760880/1‑140 (MQ=255) tGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCCTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTc > 2:500647/1‑140 (MQ=255) gCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGa > 1:300630/1‑140 (MQ=255) cTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGAc > 1:532622/1‑140 (MQ=255) tCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCttt > 1:605107/1‑140 (MQ=255) aTTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTAt < 2:66951/140‑1 (MQ=255) tGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTAtcg < 1:72029/140‑1 (MQ=255) ggCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTAtcgt < 2:760880/140‑1 (MQ=255) cAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTAtcgtcg < 1:551327/140‑1 (MQ=255) ccGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCt > 1:436608/1‑140 (MQ=255) ttACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCCTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTccc < 2:453621/140‑1 (MQ=255) tATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCtga > 2:378747/1‑140 (MQ=255) tCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCtgatg < 2:300630/140‑1 (MQ=255) gACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGtt < 2:802757/140‑1 (MQ=255) gACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGtt > 1:802757/1‑140 (MQ=255) gACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGtt > 1:534544/1‑140 (MQ=255) aCTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGttt < 1:409752/140‑1 (MQ=255) tGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCCTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGttttt > 2:177516/1‑140 (MQ=255) aaCGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCa > 1:701609/1‑140 (MQ=255) cGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCAtt > 1:560377/1‑140 (MQ=255) cGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCAtt < 2:534544/140‑1 (MQ=255) gCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGc > 1:278525/1‑140 (MQ=255) tATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAAt < 2:691893/140‑1 (MQ=255) tATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAAt < 2:560377/140‑1 (MQ=255) ttCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGa > 1:129164/1‑140 (MQ=255) ttCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGa < 2:436608/140‑1 (MQ=255) gacaggTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTCCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACg < 1:770294/135‑1 (MQ=255) ccTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACg < 2:532622/140‑1 (MQ=255) cTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACGc < 2:247060/140‑1 (MQ=255) cGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACGCTAt < 2:129164/140‑1 (MQ=255) cGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACGCTAt < 2:605107/140‑1 (MQ=255) tAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACGCTATTa < 2:428578/140‑1 (MQ=255) tCGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACGCTATTACTGATCGAt > 1:473516/1‑140 (MQ=255) cGGCCATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTCCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCGGTCATTCTGGCAACGGCGGGGATGAAGCTATTACTGATctgtc > 2:770294/1‑136 (MQ=255) ccATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAAAGACGCTATTACTGATCGATAGCg > 2:684978/1‑140 (MQ=255) ccATTTCAGCTTCCTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACGCTATTACTGATCGATAGCg < 2:548304/140‑1 (MQ=255) cATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGGATGACGGCATTACTGATCGATAACGa > 2:815714/1‑140 (MQ=255) cATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACGCTATTACTGATCGATAGCGa < 1:488504/140‑1 (MQ=255) cATTTCAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACGCTATTACTGATCGATAGCGa > 2:488504/1‑140 (MQ=255) cATTTCAGCTTCCTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACGCTATTACTGATCGATAGCGa > 1:289721/1‑140 (MQ=255) cAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGTAATGACGCTATTACTGATCGATAGCGa > 2:83338/1‑135 (MQ=255) cAGCTTCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGTAATGACGCTATTACTGATCGATAGCGa < 1:83338/135‑1 (MQ=255) ttCTTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACGCTATTACTGATCGATAGCGAAGTCTTTAc < 1:378747/140‑1 (MQ=255) ccTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGGAAGACGCCATTAATGATCGATAGCGAAGTCTTTtctc > 2:360732/1‑140 (MQ=255) | GGGGCACTGGTTTGCACTGTTCAATATTCTGCTTTCGCTCGTCATTGGCAGCCGTTACCTGTTTATCGCCGACTGGCCGACAACGCTTGCTGGTCGCATTTATTCCTACGTAAGCATTATCGGCCATTTCAGCTTCCTGGTGTTCGCCACCTACTTGCTGATCCTCTTCCCGCTGACCTTTATCGTCGGCTCCCAGAGGCTGATGAGGTTTTTGTCCGTCATTCTGGCAACGGCGGGAATGACGCTATTACTGATCGATAGCGAAGTCTTTACTC > NC_000913/2284429‑2284703 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |