Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 3,745,828 T→C V342A (GTA→GCA)  yiaN → 2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009133,745,8280TC100.0% 270.6 / NA 77V342A (GTA→GCA) yiaN2,3‑diketo‑L‑gulonate:Na(+) symporter ‑ membrane subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (36/41);  total (36/41)

CTGCCGATGATGGTTTCTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGTATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGC  >  NC_000913/3745692‑3745957
                                                                                                                                         |                                                                                                                                 
cTGCCGATGATGGTTTCTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCAtt                                                                                                                                >  1:266941/1‑140 (MQ=255)
 tGCCGATGATGGTTTCTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTa                                                                                                                               <  1:585140/140‑1 (MQ=255)
   ccGATGATGGTTTCTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAAt                                                                                                                             >  2:89960/1‑140 (MQ=255)
      atgatgGTTTCTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAATGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGcc                                                                                                                          <  2:647020/140‑1 (MQ=255)
      atgatgGTTTCTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCCTTAATGcc                                                                                                                          <  2:824115/140‑1 (MQ=255)
      atgatgGTTTCTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGcc                                                                                                                          <  2:397876/140‑1 (MQ=255)
      atgatgGTTTCTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGcc                                                                                                                          <  1:8202/140‑1 (MQ=255)
      atgatgGTTTCTGATTTACTGCAACCGTTGGTAGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGcc                                                                                                                          <  1:118589/140‑1 (MQ=255)
       tgatgGTTTCTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCt                                                                                                                         <  2:193798/140‑1 (MQ=255)
        gatgGTTTCTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCtt                                                                                                                        <  1:491254/140‑1 (MQ=255)
             tttCTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGcc                                                                                                                          >  2:687092/1‑133 (MQ=255)
             tttCTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGcc                                                                                                                          <  1:687092/133‑1 (MQ=255)
                cTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTaaa                                                                                                                <  2:399901/140‑1 (MQ=255)
                cTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTaaa                                                                                                                >  2:260694/1‑140 (MQ=255)
                cTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTaaa                                                                                                                <  1:260694/140‑1 (MQ=255)
                cTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTaaa                                                                                                                <  1:736518/140‑1 (MQ=255)
                cTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTaaa                                                                                                                <  1:582554/140‑1 (MQ=255)
                 tGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAag                                                                                                               >  2:298827/1‑140 (MQ=255)
                           cAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAAt                                                                                                     >  2:29388/1‑140 (MQ=255)
                             aCCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCg                                                                                                   >  1:621198/1‑140 (MQ=255)
                                 ttGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATTGATcc                                                                                               >  2:341402/1‑140 (MQ=255)
                                   ggTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGa                                                                                             >  1:686591/1‑140 (MQ=255)
                                      cGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGattt                                                                                          >  2:582302/1‑140 (MQ=255)
                                         ttCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGatttatt                                                                                       >  1:321513/1‑140 (MQ=255)
                                               gcgTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGgtg                                                                                 <  2:375469/140‑1 (MQ=255)
                                                  tCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCa                                                                              <  1:298827/140‑1 (MQ=255)
                                                    tgctgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATg                                                                            >  2:549110/1‑140 (MQ=255)
                                                     gctgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGt                                                                           <  1:29388/140‑1 (MQ=255)
                                                     gctgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGt                                                                           <  1:269368/140‑1 (MQ=255)
                                                     gctgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGt                                                                           <  2:195843/140‑1 (MQ=255)
                                                     gctgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGt                                                                           <  2:19228/140‑1 (MQ=255)
                                                     gctgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGt                                                                           <  1:255814/140‑1 (MQ=255)
                                                     gctgTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGt                                                                           <  2:794376/140‑1 (MQ=255)
                                                            aTCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCAt                                                                    >  2:781094/1‑140 (MQ=255)
                                                               gTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTaa                                                                 <  1:137167/140‑1 (MQ=255)
                                                               gTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTaa                                                                 <  2:321513/140‑1 (MQ=255)
                                                                tCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAAc                                                                >  2:566228/1‑140 (MQ=255)
                                                                 cATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACt                                                               >  2:443908/1‑140 (MQ=255)
                                                                       ggtggCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCaa                                                         <  1:566228/140‑1 (MQ=255)
                                                                           gCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCgg                                                     >  2:471030/1‑140 (MQ=255)
                                                                            cTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGc                                                    >  2:46930/1‑140 (MQ=255)
                                                                            cTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGc                                                    >  1:692756/1‑140 (MQ=255)
                                                                              aTCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCgg                                                     >  1:496568/1‑138 (MQ=255)
                                                                              aTCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCgg                                                     <  2:496568/138‑1 (MQ=255)
                                                                              aTCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCtt                                                  >  1:765381/1‑140 (MQ=255)
                                                                               tCCTGATTGTCGGCATGGTCAGGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTa                                                 >  2:588303/1‑140 (MQ=255)
                                                                                ccTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTaa                                                >  2:594688/1‑140 (MQ=255)
                                                                                    aTTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTac                                            >  2:292912/1‑140 (MQ=255)
                                                                                      tGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTacac                                          <  2:765381/140‑1 (MQ=255)
                                                                                      tGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTacac                                          <  1:89960/140‑1 (MQ=255)
                                                                                        tCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCg                                        <  1:497013/140‑1 (MQ=255)
                                                                                        tCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCg                                        <  1:471030/140‑1 (MQ=255)
                                                                                         cGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTacac                                          <  2:197769/137‑1 (MQ=255)
                                                                                         cGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTacac                                          >  1:197769/1‑137 (MQ=255)
                                                                                         cGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGc                                       >  2:726995/1‑140 (MQ=255)
                                                                                          ggCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGcc                                      >  1:280520/1‑140 (MQ=255)
                                                                                           gCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCt                                     >  1:192774/1‑140 (MQ=255)
                                                                                           gCAAGGTCAAGGGTTTAACCCCGTTGGTTATAATTCTTTCCCCGGCATTAATGGCTTTAGTTAAAGAGACAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCt                                     <  1:341402/140‑1 (MQ=255)
                                                                                             aTGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTAt                                   <  1:582302/140‑1 (MQ=255)
                                                                                             aTGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTAt                                   <  1:781094/140‑1 (MQ=255)
                                                                                               ggTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCg                                 <  2:192774/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                  cATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTa                              <  2:701925/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                  cATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTAACATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTa                              <  2:621198/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                   aTGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTaa                             <  1:588303/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                     ggATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATg                           <  2:467774/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                         ttAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACt                       <  2:686591/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                           aaCGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGCGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTAAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTa                     >  2:661884/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                           aaCGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTa                     >  2:149595/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                           aaCGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTa                     >  1:8463/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                               ccGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGt                 <  1:443908/140‑1 (MQ=255)
                                                                                                                cGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGtt                >  1:673758/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                cGACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGtt                >  1:472847/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                 gACGGTATTAATTCTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTa               >  1:515100/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                               cTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGc  >  2:737449/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                               cTTACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGc  >  1:593728/1‑140 (MQ=255)
                                                                                                                                 tACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGc  >  1:9451/1‑138 (MQ=255)
                                                                                                                                 tACCCCGGCATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGc  <  2:9451/138‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                         |                                                                                                                                 
CTGCCGATGATGGTTTCTGATTTACTGCAACCGTTGGTCGATTCACCGCGTCTGCTGTTTATCGTCATTATGGTGGCTATCCTGATTGTCGGCATGGTCATGGATTTAACGCCGACGGTATTAATTCTTACCCCGGTATTAATGCCTTTAGTTAAAGAGGCAGGAATCGATCCGATTTATTTCGGTGTCATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGC  >  NC_000913/3745692‑3745957

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: