| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 58,993 | (A)7→8 | coding (520/651 nt) | yabP → | putative uncharacterized protein YabP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 58,986 | 1 | . | A | 98.4% | 428.7 / ‑1.3 | 121 | coding (513/651 nt) | yabP | putative uncharacterized protein YabP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base A (55/64); total (56/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.46e-01 | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
TTAAGTGTCACTTTTTTCATTGAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGT‑AAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGA > NC_000913/58849‑59124 | ttAAGTGTCACTTTTTTCATTGAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGT‑aa > 2:1020320/1‑140 (MQ=255) tAAGTGTCACTTTTTTCATTGAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGT‑aaa < 2:198802/140‑1 (MQ=255) gtgtCACTTTTTTCATTGAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGT‑aaaaaa < 1:192412/140‑1 (MQ=255) tgtCACTTTTTTCATTGAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGT‑aaaaaaa > 1:36093/1‑140 (MQ=255) gtCACTTTTTTCATTGAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGT‑aaaaaaaa < 1:1097012/140‑2 (MQ=255) aCTTTTTTCATTGAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGT‑aaaaaaaacaa > 2:477340/1‑136 (MQ=255) tttCATTGAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGaaa < 1:1103093/140‑1 (MQ=255) tttCATTGAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGaaa < 1:1238908/140‑1 (MQ=255) cATTGAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGt > 2:310328/1‑140 (MQ=255) ttGAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAg < 2:871118/140‑1 (MQ=255) ttGAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAg < 1:908098/140‑1 (MQ=255) ttGAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAg < 2:1161807/140‑1 (MQ=255) ttGAAAAGAATAAGATAAGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAg < 2:212155/140‑1 (MQ=255) gAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCa > 2:381475/1‑140 (MQ=255) aGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGa < 1:1117862/140‑1 (MQ=255) gAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGat < 1:685080/140‑1 (MQ=255) aaTAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGata < 1:842353/140‑1 (MQ=255) gATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCtt > 2:793191/1‑140 (MQ=255) gTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTa < 2:1344213/137‑1 (MQ=255) gTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATga < 1:931686/140‑1 (MQ=255) gTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATga < 1:793191/140‑1 (MQ=255) gTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATga > 1:844466/1‑140 (MQ=255) gTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATga < 1:280829/140‑1 (MQ=255) gTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATga > 1:958785/1‑140 (MQ=255) gTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATga > 2:679822/1‑140 (MQ=255) gTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATga > 2:280829/1‑140 (MQ=255) gTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATga > 1:123421/1‑140 (MQ=255) aCTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATgaga < 2:123421/140‑1 (MQ=255) cAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGAc > 1:783872/1‑140 (MQ=255) aGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGAcc > 2:758480/1‑140 (MQ=255) aGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGAcc > 1:1658545/1‑140 (MQ=255) gACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCt > 2:14743/1‑140 (MQ=255) gACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCt < 1:1020320/140‑1 (MQ=255) aCGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGata < 2:951655/122‑1 (MQ=255) ttGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGTTATCCTTTATGAGAGACCTGGGt > 2:306073/1‑140 (MQ=255) ttGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGt > 1:423573/1‑140 (MQ=255) ttGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGt > 2:551278/1‑140 (MQ=255) ttGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGT‑AAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTg < 1:1611526/140‑1 (MQ=255) tGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTg < 1:722631/140‑1 (MQ=255) tGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTg < 1:310328/140‑1 (MQ=255) tGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTg < 2:499627/140‑1 (MQ=255) tGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTg < 2:844466/140‑1 (MQ=255) gCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTgg < 2:726368/140‑1 (MQ=255) gCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTgg > 2:1187997/1‑140 (MQ=255) gCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAAt > 1:470866/1‑140 (MQ=255) tGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGc > 2:417045/1‑140 (MQ=255) tAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTg > 1:565545/1‑130 (MQ=255) tAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTg < 2:565545/130‑1 (MQ=255) tAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTg > 1:204610/1‑130 (MQ=255) tAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAAc < 2:1094268/140‑1 (MQ=255) tAAGGGCCAAGGTAACTCGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAAc > 2:1544713/1‑140 (MQ=255) aGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCt < 2:1095210/140‑1 (MQ=255) gggCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTg < 1:1645869/140‑1 (MQ=255) aaGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgt > 1:1030543/1‑140 (MQ=255) cTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccc > 2:1065878/1‑140 (MQ=255) cTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccc > 1:598537/1‑140 (MQ=255) gggCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGG‑ATGCTAACCTGGGCgtgctaccccgga < 1:1273222/140‑1 (MQ=255) ggCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccgga < 1:551278/140‑1 (MQ=255) ggCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccgga < 2:1206408/140‑1 (MQ=255) ggCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccgga < 2:423811/140‑1 (MQ=255) ggCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccgga < 1:1221975/140‑1 (MQ=255) gCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccggac > 2:1324191/1‑140 (MQ=255) gCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccgga < 2:502763/139‑1 (MQ=255) gCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccgga > 1:502763/1‑139 (MQ=255) tGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccggacggtg < 1:522395/140‑1 (MQ=255) tGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccggacggtg > 2:243601/1‑140 (MQ=255) aaGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACGTGGGCgtgctaccccggacggtgctaccccgga < 2:1646362/140‑1 (MQ=255) aaGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccggatggtgctaccccgga < 2:184144/140‑1 (MQ=255) aaGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccggacggtgctaccccgga < 2:919658/140‑1 (MQ=255) aaGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccggacggtgctaccccgga < 2:1030543/140‑1 (MQ=255) aaGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccggacggtgctaccccgga < 1:1144682/140‑1 (MQ=255) aaGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccggacggtgctaccccgga < 1:1448383/140‑1 (MQ=255) aGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCgtgctaccccggacggtgctacaccggac < 1:710006/140‑1 (MQ=255) cTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTgctaccccggacggtgctaccccggacggt > 2:1004450/1‑140 (MQ=255) cTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTgctaccccggacggtgctaccccggacggt > 2:843037/1‑140 (MQ=255) cTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTgctaccccggacggtgctaccccggacggt > 2:1332281/1‑140 (MQ=255) ttACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGctaccccggacggtgctaccccggacggtg < 1:1544713/140‑1 (MQ=255) cccGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggtgctaaccc > 2:80317/1‑140 (MQ=255) ccGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggtgctaacccg > 2:493462/1‑140 (MQ=255) ggCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCGGGACGGTGCTACcccggacggtgctaacccgga < 2:192382/140‑1 (MQ=255) ggCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGTTGCTACcccggacggtgctaacccgga < 1:306073/140‑1 (MQ=255) ggCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggtgctaacccgga < 1:1004450/140‑1 (MQ=255) ttGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggtgctaacccggacggt > 2:1434696/1‑140 (MQ=255) tGACATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggtgctaacccggacggtg < 1:1472761/140‑1 (MQ=255) cATGAGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggtgctaacccggacggtgcta > 1:523389/1‑140 (MQ=255) aGGGATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACcccggacggtgctaacccgga > 1:482599/1‑128 (MQ=255) gATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGa < 2:423573/140‑1 (MQ=255) gATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGa > 2:1546475/1‑140 (MQ=255) gATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGa < 1:1065878/140‑1 (MQ=255) gATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGa < 1:914940/140‑1 (MQ=255) gATTGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGa < 1:493462/140‑1 (MQ=255) ttGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACg > 1:210045/1‑140 (MQ=255) ttGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACg > 1:535037/1‑140 (MQ=255) ttGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACg > 1:1426827/1‑140 (MQ=255) tGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACgg < 2:535037/140‑1 (MQ=255) tGTTACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACgg > 2:393257/1‑140 (MQ=255) ttACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTg < 2:598537/140‑1 (MQ=255) ttACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTg < 1:1169885/140‑1 (MQ=255) ttACCTTGGTAAAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTg < 1:1187997/140‑1 (MQ=255) gT‑AAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGa > 1:1191890/1‑140 (MQ=255) | TTAAGTGTCACTTTTTTCATTGAAAAGAATAAGATATGTACTCAGACGTTGCAGCTGCATAAGGGCCAAGGTAACTTGGGCGTTGATCTTAGAAAGGCTTACCTTCCCGGCGTTGACATGAGGGATTGTTACCTTGGT‑AAAAAAACAATGAAAGGTAGCAATGATATCCTTTATGAGAGACCTGGGTGGAATGCTAACCTGGGCGTGCTACCCCGGACGGTGCTACCCCGGACGGTGCTAACCCGGACGGTGCTAACCTGGACGGTGCTACCGTGA > NC_000913/58849‑59124 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |