| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,604,172 | C→T | A232A (GCC→GCT) R5* (CGA→TGA) |
yjjQ → bglJ → |
DNA‑binding transcriptional repressor YjjQ DNA‑binding transcriptional regulator BglJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,604,172 | 0 | C | T | 100.0% | 473.7 / NA | 130 | A232A (GCC→GCT) R5* (CGA→TGA) | yjjQ bglJ | DNA‑binding transcriptional repressor YjjQ DNA‑binding transcriptional regulator BglJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (56/74); total (56/74) | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
CCCAAAAAAACAGTGCGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCAGGAGTCATTTCAGG > NC_000913/4604036‑4604304 | cccAAAAAAACAGTGCGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGaa > 2:1282376/1‑140 (MQ=255)cccAAAAAAACAGTGCGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGaa > 1:1219984/1‑140 (MQ=255)cccAAAAAAACAGTGCGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGaa > 1:1380978/1‑140 (MQ=255) aaaaaaCAGTGCGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCACAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTaa > 1:1513942/1‑140 (MQ=255) aaaaaCAGTGCGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTaag < 2:1652058/140‑1 (MQ=255) cAGTGCGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAagag < 1:1068475/140‑1 (MQ=255) cAGTGCGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAagag < 2:880950/140‑1 (MQ=255) cAGTGCGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAagag < 2:856290/140‑1 (MQ=255) tGCGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTaagaa < 2:1257006/134‑1 (MQ=255) tGCGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGaaa > 2:1191329/1‑140 (MQ=255) gCGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAAt > 1:789267/1‑140 (MQ=255) cGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTaag < 2:1629318/130‑1 (MQ=255) cGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTaag > 1:1629318/1‑130 (MQ=255) aTGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTc > 1:883459/1‑140 (MQ=255) tGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGaa < 2:1514118/134‑1 (MQ=255) tGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCg < 1:402707/140‑1 (MQ=255) aCTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCAt > 2:308845/1‑140 (MQ=255) ttCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAAt < 2:1219984/140‑1 (MQ=255) ttCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAAt < 1:1194827/140‑1 (MQ=255) caGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGt < 1:1282376/140‑1 (MQ=255) aGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTc < 2:799103/140‑1 (MQ=255) aGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTc < 1:551349/140‑1 (MQ=255) aGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTc < 2:767487/140‑1 (MQ=255) aGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTc < 2:482414/140‑1 (MQ=255) aGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTc < 1:308845/140‑1 (MQ=255) aCGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGa < 1:398488/140‑1 (MQ=255) aCGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGa < 2:1652257/140‑1 (MQ=255) aCGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGa < 2:500986/140‑1 (MQ=255) cGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGag < 2:781409/140‑1 (MQ=255) gCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCGGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGagt > 1:291469/1‑140 (MQ=255) gCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGagt < 2:693321/140‑1 (MQ=255) gCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGagt < 2:391563/140‑1 (MQ=255) cTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGagta > 1:995638/1‑140 (MQ=255) aaaTGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAgtagta < 1:1398843/140‑1 (MQ=255) aTGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATc < 1:830001/140‑1 (MQ=255) aTGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATc < 1:356966/140‑1 (MQ=255) aTGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATc < 2:325858/140‑1 (MQ=255) aTGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATc < 2:789267/140‑1 (MQ=255) aTGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATc < 1:667256/140‑1 (MQ=255) aTGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAgtagta > 2:795773/1‑134 (MQ=255) aTGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAgtagta < 1:795773/134‑1 (MQ=255) cATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTg < 1:1148031/140‑1 (MQ=255) cATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTg < 1:1168580/140‑1 (MQ=255) ggATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTgaga > 1:500381/1‑140 (MQ=255) gATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGagag > 1:143401/1‑140 (MQ=255) aTAAATAGCGCGCAGGGTG‑‑‑GAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTAt < 1:480888/130‑1 (MQ=255) aTAAATAGCGCGCAGGGTG‑‑‑GAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTAt > 2:480888/1‑130 (MQ=255) tAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAgtagta < 1:867621/125‑1 (MQ=255) tAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAgtagta > 2:867621/1‑125 (MQ=255) tAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGtt > 2:1056472/1‑140 (MQ=255) tAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGtt > 2:1119441/1‑140 (MQ=255) cgcgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAg > 1:1094224/1‑140 (MQ=255) cgcgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAg > 2:1309409/1‑140 (MQ=255) gcgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa < 2:1695577/140‑1 (MQ=255) gcgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa < 2:500381/140‑1 (MQ=255) gcgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa > 2:784480/1‑140 (MQ=255) gcgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa < 2:143401/140‑1 (MQ=255) gcgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa < 1:475016/140‑1 (MQ=255) cgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGaa > 1:467531/1‑140 (MQ=255) cgcAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGaa > 2:980675/1‑140 (MQ=255) aaGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCggg < 2:1094224/140‑1 (MQ=255) aaGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCggg < 1:1309409/140‑1 (MQ=255) agagAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGt < 1:1679927/140‑1 (MQ=255) agaACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTaa < 2:266306/140‑1 (MQ=255) aacttaacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAAcc > 1:195505/1‑140 (MQ=255) aacttaacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAAcc > 1:18303/1‑140 (MQ=255) aacttaacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAAcc < 1:929607/140‑1 (MQ=255) cttaacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa < 1:518204/122‑1 (MQ=255) cttaacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa > 1:392782/1‑122 (MQ=255) cttaacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa < 2:392782/122‑1 (MQ=255) cttaacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGa > 2:518204/1‑122 (MQ=255) cttaacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGt > 2:640490/1‑134 (MQ=255) cttaacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGt < 1:640490/134‑1 (MQ=255) aacttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTtat < 1:296522/140‑1 (MQ=255) acttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTtata < 1:784480/140‑1 (MQ=255) acttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTtata < 2:995638/140‑1 (MQ=255) acttGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTCTGCGGGTAACCCTtata < 2:668579/140‑1 (MQ=255) gCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCt > 1:1382454/1‑140 (MQ=255) ccTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCGTTATaa > 2:1469841/1‑136 (MQ=255) ccTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATaa < 1:1469841/136‑1 (MQ=255) ccTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTc < 2:989426/140‑1 (MQ=255) ccTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTc < 1:1389866/140‑1 (MQ=255) ccTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTc < 2:621710/140‑1 (MQ=255) ccTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTc < 2:467531/140‑1 (MQ=255) ccTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTc < 1:749268/140‑1 (MQ=255) cTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTcc < 1:1119441/140‑1 (MQ=255) ttATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCta < 2:195505/140‑1 (MQ=255) tATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCtat > 1:170604/1‑140 (MQ=255) aTGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCtata > 1:834813/1‑140 (MQ=255) gaTGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGt > 1:1265193/1‑140 (MQ=255) aTGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTcc < 1:1552959/125‑1 (MQ=255) tGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCa > 2:725907/1‑140 (MQ=255) tGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCa > 1:741312/1‑140 (MQ=255) tGCCGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCa < 2:637421/140‑1 (MQ=255) ccGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTcc < 1:1062491/122‑1 (MQ=255) ccGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTcc > 2:1062491/1‑122 (MQ=255) ccGCAGAATGGAACACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCAgg > 1:516157/1‑140 (MQ=255) aaCACAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCAGGAGTCATTTCa < 2:671657/139‑1 (MQ=255) acacAGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATAGCTATACCAGTCAGGAGTCATTTCAgg > 1:1188980/1‑140 (MQ=255) aGCTGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCAGGa < 1:12350/125‑1 (MQ=255) | CCCAAAAAAACAGTGCGATGCGTCGACTGGCAATTCACAGCAACGCTGAAATGTATGCATGGATAAATAGCGCGCAGGGTGCAAGAGAACTTAACTTGCCTTCTGTTTATGGAGATGCCGCAGAATGGAACACAGCCGAATTAAGAAGAGAAATGTCGCACTCATAGAAAAATGCGTCATGAGTAGTATCGGTATTGAGAGTTTATTCAGAAAGTTTGCGGGTAACCCTTATAAGCTCCATACCTATACCAGTCAGGAGTCATTTCAGG > NC_000913/4604036‑4604304 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |