| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,193,588 | A→G | V194A (GTG→GCG) | mrp ← | P‑loop NTPase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,193,588 | 0 | A | G | 98.8% | 296.2 / ‑6.0 | 82 | V194A (GTG→GCG) | mrp | P‑loop NTPase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (37/44); total (37/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGGAATGTTTTGCGCCAGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACACCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGCCATATGGGTACCGTCCGGCGAAGTTGGACGCTGATTTTCTGCGCCCAACATTGTTGGGATTGATG > NC_000913/2193452‑2193723 | tGGAATGTTTTGCGCCAGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCAcgccacgcca < 2:1586458/140‑1 (MQ=255)tGGAATGTTTTGCGCCAGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCAcgccacgcca < 1:212397/140‑1 (MQ=255) tGTTTTGCGCCAGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCCCCAGACAGTCAAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACACGGGCATTAACGCGTTGCTCGCCACCGGTCCACGCCACGTCATCGCa < 2:874808/140‑1 (MQ=255) tGTTTTGCGCCAGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCa > 1:733910/1‑140 (MQ=255) tGTTTTGCGCCAGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCa < 2:929758/140‑1 (MQ=255) tGTTTTGCGCCAGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCa < 1:278378/140‑1 (MQ=255) ttttGCGCCAGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCAtt > 2:867661/1‑140 (MQ=255) tttGCGCCAGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTg < 2:222695/140‑1 (MQ=255) cgcCAGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTgtcgt < 2:524306/140‑1 (MQ=255) aGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGt < 2:660912/140‑1 (MQ=255) gCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTg < 1:18527/140‑1 (MQ=255) tCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGAcc < 2:1093021/140‑1 (MQ=255) tGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATa < 2:1204347/140‑1 (MQ=255) aaTGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAAc < 1:867661/140‑1 (MQ=255) aaTGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAAc < 2:1652221/140‑1 (MQ=255) aTGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAAcc > 1:659164/1‑140 (MQ=255) aTGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAAcc > 2:628976/1‑140 (MQ=255) tGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCa > 1:732278/1‑140 (MQ=255) tGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCa > 1:384547/1‑140 (MQ=255) aCCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATa < 2:578600/132‑1 (MQ=255) aCCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATa > 1:578600/1‑132 (MQ=255) gTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATa > 2:1266552/1‑128 (MQ=255) gTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATa < 1:1266552/128‑1 (MQ=255) gTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCaattgaatt > 2:1470947/1‑140 (MQ=255) cTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGtt > 1:1371703/1‑140 (MQ=255) ggcggcATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGc < 2:659164/140‑1 (MQ=255) cATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGc > 1:1675704/1‑140 (MQ=255) tatCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCa < 2:803853/140‑1 (MQ=255) tatCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCa > 1:1136478/1‑140 (MQ=255) atCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCAt > 1:941692/1‑140 (MQ=255) tCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATg > 2:639701/1‑140 (MQ=255) cAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATga < 1:628976/140‑1 (MQ=255) cACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACa < 2:732278/140‑1 (MQ=255) aGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAAt < 2:1210917/140‑1 (MQ=255) gATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCAt < 2:1194640/129‑1 (MQ=255) gATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCAt > 1:1194640/1‑129 (MQ=255) gATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATc > 2:905379/1‑140 (MQ=255) gATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATc > 2:343303/1‑140 (MQ=255) gATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGCCCACGCCAGGCCATCGCATGGT‑GTCAAGGGCCCAGAT‑ACCAATTTGATTTGGTGCCAGGGCCATGAGActaaacc > 2:133946/1‑134 (MQ=255) aGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGt < 2:354546/140‑1 (MQ=255) aGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGt < 2:1371703/140‑1 (MQ=255) tCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAAt > 2:539055/1‑134 (MQ=255) tCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAAt < 1:539055/134‑1 (MQ=255) tCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGc < 1:343303/140‑1 (MQ=255) tCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGc > 2:698788/1‑140 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2:748613/140‑1 (MQ=255) aTCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGCCatat > 1:1682230/1‑140 (MQ=255) cGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGcc < 2:430108/133‑1 (MQ=255) cGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGcc < 2:509110/133‑1 (MQ=255) cGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGcc < 2:577499/133‑1 (MQ=255) cGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGcc > 1:577499/1‑133 (MQ=255) cGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGcc > 1:430108/1‑133 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(MQ=255) cATCGGTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGCCATATGGGTACCGTCCGGCGAAGTTGGACGCTGATTTTCTGCGCCCAACAttg < 1:905379/140‑1 (MQ=255) gTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGCCATATGGGTACCGTCCGGCGAAGTTGGACGCTGATTTTCTgcg < 1:369050/125‑1 (MQ=255) gTCCACGCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGCCATATGGGTACCGTCCGGCGAAGTTGGACGCTGATTTTCTgcg > 2:369050/1‑125 (MQ=255) cgccacgccaTCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGCCATATGGGTACCGTCCGGCGAAGTTGGACGCTGATTTTCTGCGCCCAACATTGTTGGGATTGa < 2:1675704/140‑1 (MQ=255) gCCACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGCCATATGGGTACCGTCCGGCGAAGTTGGACGCTGATTTTCTGCGCCCAACATTGTTGGGATTGAt < 1:133946/140‑1 (MQ=255) ccACGCCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGCCATATGGGTACCGTCCGGCGAAGTTGGACGCTGATTTTCTGCGCCCAACATTGTTGGGATTGATg < 2:393896/140‑1 (MQ=255) ccACACCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGCCATATGGGTACCGTCCGGCGAAGTTGGACGCTGATTTTCTGCGCCCAACATTGTTGGGATTGATg < 1:260850/140‑1 (MQ=255) | TGGAATGTTTTGCGCCAGCGTCAATTGAATGTCACCGGTGCCTGGCGGCATATCAAGCACCAGATAGTCGAGATCCGGCCACAAGGTTTCCTGCAACATCTGCATTAACGCCTTGCTCGCCATCGGTCCACGCCACACCATCGCATTGTCGTC‑AGTGACCAGATAACCAATTGAATTGGTTGCCA‑GGCCATGAGACATAATCGGTGCCATATGGGTACCGTCCGGCGAAGTTGGACGCTGATTTTCTGCGCCCAACATTGTTGGGATTGATG > NC_000913/2193452‑2193723 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |