| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,204,803 | T→C | L70L (TTA→CTA) | yehL → | putative AAA(+) MoxR family ATPase YehL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,204,803 | 0 | T | C | 98.3% | 212.1 / ‑4.3 | 60 | L70L (TTA→CTA) | yehL | putative AAA(+) MoxR family ATPase YehL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (25/34); minor base A (1/0); total (26/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
AAAACAAAATGATAACGCACCTTGCCCGCCCGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCAT > NC_000913/2204667‑2204932 | aaaaCAAAATGATAACGCACCTTGCCCGCCCGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAg < 1:25823/140‑1 (MQ=255) aaaCAAAATGATAACGCATCTTGCCCGCCCGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGt < 2:974907/140‑1 (MQ=255) aaaCAAAATGATAACGCACCTTGCCCGCCCGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGt < 2:1644938/140‑1 (MQ=255) aaTGATAACGCACCTTGCCCGCCCGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCACTGTCGAACGTATGCTAGTCActct > 1:153689/1‑140 (MQ=255) tAACGCACCTTGCCCGCCCGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTa < 1:1141357/140‑1 (MQ=255) ccTTGCCCGCCCGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCcg > 2:731526/1‑140 (MQ=255) ccTTGCCCGCCCGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCcg < 2:1446304/140‑1 (MQ=255) ccTTGCCCGCCCGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCcg < 1:447892/140‑1 (MQ=255) cTTGCCCGCCCGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCcgc > 1:598585/1‑140 (MQ=255) ttGCCCGCCCGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCcgcg > 2:1295935/1‑140 (MQ=255) ttGCCCGCCCGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCcgcg > 2:1685419/1‑140 (MQ=255) gcccgcccGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGt < 2:1425192/140‑1 (MQ=255) gcccgcccGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGt < 2:898186/140‑1 (MQ=255) cgcccgGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTg < 2:293380/140‑1 (MQ=255) gcccgGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGa > 1:1551310/1‑140 (MQ=255) cccgGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGAt > 2:152620/1‑140 (MQ=255) cgGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGt > 2:510326/1‑140 (MQ=255) ggTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGtt < 1:528517/140‑1 (MQ=255) ggTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGtt < 1:731526/140‑1 (MQ=255) ggCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTttggtgttggtg < 1:1685419/140‑1 (MQ=255) ggCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTtggtg < 1:1295935/140‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ttATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTcttctt < 1:611170/140‑1 (MQ=255) tATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCttcttt < 1:701805/140‑1 (MQ=255) ttGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAGGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGaa > 1:1560297/1‑140 (MQ=255) ttGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGaa > 1:1443708/1‑140 (MQ=255) ttGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGATAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGaa > 1:1482297/1‑140 (MQ=255) tGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAAt > 2:1036188/1‑140 (MQ=255) tGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAAt > 2:1325964/1‑140 (MQ=255) ggCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAAtt > 2:1209986/1‑140 (MQ=255) ggCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAAtt > 2:34160/1‑140 (MQ=255) ggCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAAtt > 1:919981/1‑140 (MQ=255) gCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTa < 1:510326/140‑1 (MQ=255) gacgaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACt < 1:34160/140‑1 (MQ=255) cgaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTgg < 1:908567/140‑1 (MQ=255) cgaACCGCAAAATATCAGCCGTAAGGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTgg < 2:1560297/140‑1 (MQ=255) gaAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGc < 2:1443708/140‑1 (MQ=255) aaGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCtcttct < 1:797247/124‑1 (MQ=255) aaGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCtcttct > 2:797247/1‑124 (MQ=255) cAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGc < 2:444267/140‑1 (MQ=255) cAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCTGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAgcg > 1:988263/1‑140 (MQ=255) aGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAgcgg < 2:1551310/140‑1 (MQ=255) gCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAgcggc < 1:1303722/140‑1 (MQ=255) tAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATg < 1:1325964/140‑1 (MQ=255) aaaGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGc > 1:875636/1‑140 (MQ=255) aaaGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGc > 1:377069/1‑140 (MQ=255) gtggtgATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCgg < 1:1003599/140‑1 (MQ=255) gtgATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGtt > 1:640753/1‑140 (MQ=255) gtgATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGtt > 2:181600/1‑140 (MQ=255) gATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTaa < 1:152620/140‑1 (MQ=255) gCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATc < 2:540606/140‑1 (MQ=255) gCCCCTCCACTGTCGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATc < 2:153689/140‑1 (MQ=255) ccGCTGTCGAACGTAAGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCACAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGc > 2:366215/1‑140 (MQ=255) cGAACGTATGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCAt > 2:1373948/1‑140 (MQ=255) aTGCTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGc < 1:1550538/126‑1 (MQ=255) | AAAACAAAATGATAACGCACCTTGCCCGCCCGGTTGGCAGTTAAGTTTGCCTGCGGCCCGTGCTTTTATCCTTGGCGACGAAGCGCAAAATATCAGCCGTAAAGTGGTGATTAGCCCCTCCGCTGTCGAACGTATGTTAGTCACTCTTGCTACCGGCCGCGGTTTGATGTTGGTGGGGGAACCGGGTACCGCAAAATCTCTTCTTTCTGAATTACTGGCAACCGCTATTAGCGGCGATGCCGGGTTAACCATCCAGGGCGGGGCAT > NC_000913/2204667‑2204932 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |