| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,280,298 | (G)5→6 | coding (82/474 nt) | agaV → | N‑acetyl‑D‑galactosamine specific PTS enzyme IIB component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,280,293 | 1 | . | G | 98.0% | 719.4 / 4.4 | 203 | coding (77/474 nt) | agaV | N‑acetyl‑D‑galactosamine specific PTS enzyme IIB component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/3); new base G (94/105); total (95/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.40e-01 | |||||||||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
ACATCCTGGCGCAGTACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑GGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGACGCTGCAAAAAGTTATCGACA > NC_000913/3280154‑3280421 | cATCCTGGCGCAGTACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑g < 2:2191185/140‑1 (MQ=255) aTCCTGGCGCAGTACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑gg > 1:422190/1‑140 (MQ=255) aTCCTGGCGCAGTACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑gg > 2:2866231/1‑140 (MQ=255) ccTGGCGCAGTACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑ggg‑g > 1:362545/1‑140 (MQ=255) ccTGGCGCAGTACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑ggg‑g > 1:1164603/1‑140 (MQ=255) ccTGGCGCAGTACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑ggg‑g > 1:3416039/1‑140 (MQ=255) ccTGGCGCAGTACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑ggg‑g > 2:2805343/1‑140 (MQ=255) ccTGGCGCAGTACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑gag‑g > 2:1036340/1‑140 (MQ=255) tGGCGCAGTACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑ggg‑ggg < 1:1627662/140‑2 (MQ=255) ggCGCAGTACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑ggg‑gggc < 1:1227582/140‑3 (MQ=255) gcAGTACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑ggg‑gggcaaa < 1:1766576/140‑6 (MQ=255) tACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTg > 1:867622/1‑140 (MQ=255) tACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTg > 1:989228/1‑140 (MQ=255) tACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTg > 2:2700139/1‑140 (MQ=255) tACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑ggg‑ggg < 2:1127756/132‑2 (MQ=255) cacaGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑ggg‑gggc < 2:502545/128‑3 (MQ=255) acaGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTg < 2:1862391/140‑1 (MQ=255) ccTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAg > 2:1017178/1‑140 (MQ=255) ccTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAg > 1:2075776/1‑140 (MQ=255) ccTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAg > 2:3457479/1‑140 (MQ=255) ccTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAg > 1:1143572/1‑140 (MQ=255) cTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGc < 1:1563491/140‑1 (MQ=255) cTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGc < 2:2363145/140‑1 (MQ=255) tgtgAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGcc > 1:3372232/1‑140 (MQ=255) tgtgAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGcc < 1:2751051/140‑1 (MQ=255) tgtgAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGc > 2:1738752/1‑139 (MQ=255) gtgAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCa > 1:2148322/1‑140 (MQ=255) gtgAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCa > 2:393107/1‑140 (MQ=255) ggCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGAt > 2:1921118/1‑140 (MQ=255) ccAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGa > 2:1810340/1‑140 (MQ=255) aGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGc < 1:2546344/140‑1 (MQ=255) aaaaCAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGa > 2:1579038/1‑140 (MQ=255) aaaaCAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGa > 2:557182/1‑140 (MQ=255) aaCAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAg > 1:1119987/1‑140 (MQ=255) agagGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCg > 2:288600/1‑140 (MQ=255) agGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGt > 1:1851224/1‑140 (MQ=255) agGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGt < 1:1382660/140‑1 (MQ=255) acacGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTacaa > 2:83618/1‑140 (MQ=255) acacGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTacaa < 2:1840043/140‑1 (MQ=255) cacGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATc > 1:1666362/1‑131 (MQ=255) cacGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATc < 2:1666362/131‑1 (MQ=255) cacGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTacaac > 1:683144/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTacaac > 1:1011041/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTacaac > 1:1077869/1‑140 (MQ=255) cacGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTacaac < 2:3209573/140‑1 (MQ=255) acGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTacaaca > 2:1194729/1‑140 (MQ=255) tATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAAc > 2:152779/1‑140 (MQ=255) tATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAAc < 1:1810340/140‑1 (MQ=255) aTGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAAcc < 2:867622/140‑1 (MQ=255) tGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑GGGCGGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAGCCt > 2:725241/1‑140 (MQ=255) gCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTg > 2:641155/1‑140 (MQ=255) ccAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGa > 1:1916119/1‑140 (MQ=255) cAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGAt < 1:949584/140‑1 (MQ=255) cAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGAt < 2:2130520/140‑1 (MQ=255) aaaTATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATg < 1:839861/140‑1 (MQ=255) tatTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGaa < 1:2878649/140‑1 (MQ=255) atTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGaaa < 1:80978/140‑1 (MQ=255) ttGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAAt < 2:1164603/140‑1 (MQ=255) ttGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAAt < 2:2418846/140‑1 (MQ=255) ttGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAAt < 2:2779608/140‑1 (MQ=255) tGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACaaa > 1:2909010/1‑126 (MQ=255) ttttAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGAt > 2:2375480/1‑131 (MQ=255) ttttAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGAt < 1:2375480/131‑1 (MQ=255) ttttAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGt > 2:298071/1‑140 (MQ=255) ttttAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGt > 2:200818/1‑140 (MQ=255) ttAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTAc < 1:1733971/140‑1 (MQ=255) ttAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTAc < 1:3362482/140‑1 (MQ=255) aGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTAc < 2:1435993/137‑1 (MQ=255) aGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTAc > 1:1435993/1‑137 (MQ=255) aGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTgg > 2:966033/1‑140 (MQ=255) aGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTgg < 2:2075776/140‑1 (MQ=255) aGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTgg > 1:2646069/1‑140 (MQ=255) ggATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGa < 1:200818/140‑1 (MQ=255) ttGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAgg < 1:963713/140‑1 (MQ=255) ttGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAgg < 1:2815337/140‑1 (MQ=255) tgaACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGAt < 2:1361495/139‑1 (MQ=255) aCGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGcc < 1:3130837/140‑1 (MQ=255) cGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTAc < 2:1229427/122‑1 (MQ=255) cGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCg > 2:2491391/1‑140 (MQ=255) cTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTa < 2:954320/140‑1 (MQ=255) cTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTa < 1:641155/140‑1 (MQ=255) cTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTa < 2:3416039/140‑1 (MQ=255) cTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTa < 2:300036/140‑1 (MQ=255) tGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTa > 2:2060886/1‑138 (MQ=255) cGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTa > 2:309762/1‑131 (MQ=255) cGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTa < 1:309762/131‑1 (MQ=255) gTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGAc < 1:2491391/140‑1 (MQ=255) gTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGAc < 1:2356140/140‑1 (MQ=255) tCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGACg < 1:2799835/140‑1 (MQ=255) ggCGTTCAATGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGACGCTGCaaa > 1:3033410/1‑140 (MQ=255) aaTGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGACGCTGCAAAAAGTTAt < 1:298071/140‑1 (MQ=255) tGGGTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGACGCTGCAAAAAGTTATCg < 1:2069086/140‑1 (MQ=255) ggTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGACGCTGCAAAAAGTTATCGac < 2:3372232/140‑1 (MQ=255) gTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCTGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGACGCTGCAAAAAGTTATCGac < 1:1245589/139‑1 (MQ=255) gTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCTGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGACGCTGCAAAAAGTTATCGac > 2:1245589/1‑139 (MQ=255) gTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGACGCTGCAAAAAGTTAt > 1:573295/1‑135 (MQ=255) gTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGACGCTGCAAAAAGTTATCGaca > 2:2742727/1‑140 (MQ=255) gTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGACGCTGCAAAAAGTTATCGaca > 2:2604325/1‑140 (MQ=255) gTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGACGCTGCAAAAAGTTATCGaca < 1:1284198/140‑1 (MQ=255) gTCGGATTTGCGGGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGACGCTGCAAAAAGTTATCGaca > 1:1035579/1‑140 (MQ=255) | ACATCCTGGCGCAGTACCACACAGCCTGTGAAGGCCAATAAGCAAAACAAAGAGGAACACGCTATGCCAAATATTGTTTTAAGCCGGATTGATGAACGCTTGATTCACGGTCAGGTCGGCGTTCAATGGGTCGGATTTGC‑GGG‑GGCAAATCTGGTGCTGGTAGCCAACGATGAGGTTGCCGAAGATCCGGTACAACAAAACCTGATGGAAATGGTACTGGCAGAAGGGATCGCCGTACGTTTCTGGACGCTGCAAAAAGTTATCGACA > NC_000913/3280154‑3280421 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |