Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 339,509 | C→T | R395R (CGC→CGT) | yahG → | DUF1116 domain‑containing protein YahG |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 339,509 | 0 | C | T | 99.3% | 509.9 / NA | 148 | R395R (CGC→CGT) | yahG | DUF1116 domain‑containing protein YahG |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (73/74); minor base G (1/0); total (74/74) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TCGGGGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCATCGCCCATAA > NC_000913/339372‑339643 | tCGGGGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGa > 2:1081774/1‑140 (MQ=255) cGGGGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGaa > 2:1527463/1‑140 (MQ=255) ggATATCGGCGACAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCAccc < 2:3313770/140‑1 (MQ=255) ggATATCGGCGACAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCAccc > 1:1450278/1‑140 (MQ=255) gATATCGGCGACAGTGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCt < 1:2905402/140‑1 (MQ=255) gATATCGGCGACAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCt < 2:768207/140‑1 (MQ=255) gATATCGGCGACAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCt > 2:2049505/1‑140 (MQ=255) cGGCGACAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTg > 2:3090243/1‑140 (MQ=255) cGGCGACAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTg > 1:3204052/1‑140 (MQ=255) cGGCGACAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCT‑GTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGa > 1:1202868/1‑140 (MQ=255) gCGACAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGaa < 1:2049505/140‑1 (MQ=255) cGACAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGaaa < 1:1096664/140‑1 (MQ=255) aCAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGTTTTGCTCTGGCCGCCCGC‑CCCCCTCTCTTTGCGCTGGGGGGCTGCACCGAGGAAGTAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAAc > 2:1273154/1‑140 (MQ=255) aCAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCGCGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGGCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAAc > 2:2956802/1‑140 (MQ=255) aCAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGa < 1:2854810/136‑1 (MQ=255) aCAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAAc > 2:164778/1‑140 (MQ=255) aCAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAAc > 2:677133/1‑140 (MQ=255) aCAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAAc > 1:1544007/1‑140 (MQ=255) aCAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAAc > 2:2884228/1‑140 (MQ=255) aCAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAAc < 2:295800/140‑1 (MQ=255) cAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAAcc < 1:677133/140‑1 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gAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGt < 1:2664706/134‑1 (MQ=255) tACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCgct > 2:2516510/1‑140 (MQ=255) tACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCgct > 1:130530/1‑140 (MQ=255) cGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCgctgc < 2:484148/140‑1 (MQ=255) gTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTc < 2:1450278/140‑1 (MQ=255) gTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTc < 2:378605/140‑1 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> 1:1867205/1‑140 (MQ=255) g‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTc > 1:860096/1‑140 (MQ=255) cGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCg > 1:629539/1‑140 (MQ=255) aCCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGc > 1:484409/1‑140 (MQ=255) cgcgCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCaa < 2:3204052/140‑1 (MQ=255) cgcgCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCaa > 1:1845060/1‑140 (MQ=255) 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cTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTggg > 1:2680680/1‑140 (MQ=255) cGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTagcag > 1:3108992/1‑133 (MQ=255) cGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTagcag < 2:3108992/133‑1 (MQ=255) cGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCAtt < 1:1914974/140‑1 (MQ=255) cGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCAtt > 2:1106601/1‑140 (MQ=255) tGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTg > 2:1113541/1‑140 (MQ=255) gaagaaGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGcc > 2:2924249/1‑140 (MQ=255) aagaagCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCg < 2:3157222/140‑1 (MQ=255) gaagCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGt > 2:1093923/1‑140 (MQ=255) agCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGa < 2:2153518/140‑1 (MQ=255) cTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATc > 2:1624746/1‑140 (MQ=255) tATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCa > 2:3390178/1‑140 (MQ=255) tATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCa > 1:1895887/1‑140 (MQ=255) tATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCa > 1:2559105/1‑140 (MQ=255) aTTGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCaa < 2:2014697/140‑1 (MQ=255) ttGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAac > 1:1425343/1‑140 (MQ=255) tGATTTCTCCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAaca < 1:2516510/140‑1 (MQ=255) ctcCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCCTTCTGCCGGTGATCAACACCGCCa > 2:271250/1‑140 (MQ=255) ctcCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCa > 1:3269998/1‑140 (MQ=255) ctcCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCa > 1:3050899/1‑140 (MQ=255) tcCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTTGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCAt < 2:1981234/140‑1 (MQ=255) tcCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCa < 2:897600/139‑1 (MQ=255) tcCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCAt > 2:3376493/1‑140 (MQ=255) tcCCGTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCAt > 1:2378969/1‑140 (MQ=255) gTCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCATCGcc < 2:643530/140‑1 (MQ=255) tCAGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCATCGccc > 1:2793700/1‑140 (MQ=255) aGATGCGTGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCATCGCCCAt < 2:3063082/140‑1 (MQ=255) | TCGGGGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCGAAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGG‑CGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCATCGCCCATAA > NC_000913/339372‑339643 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |