| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,101,039 | (C)7→9 | coding (585/720 nt) | yggN ← | putative EcfF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,101,032 | 1 | . | C | 98.1% | 177.9 / ‑3.2 | 53 | coding (592/720 nt) | yggN | putative EcfF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (22/30); total (22/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.67e-01 | |||||||||||
| * | NC_000913 | 3,101,032 | 2 | . | C | 96.2% | 172.5 / 0.0 | 53 | coding (592/720 nt) | yggN | putative EcfF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/2); new base C (22/29); total (22/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.19e-01 | |||||||||||
ATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGCCTGATTCACTAATTGCTGGCCTT > NC_000913/3100896‑3101160 || aTAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑ccc < 2:405877/140‑1 (MQ=255) tAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑cccc > 2:1284966/1‑140 (MQ=255) tAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑cccc > 2:408402/1‑140 (MQ=255) gagGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑cccccc > 2:886740/1‑140 (MQ=255) gagGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑cccccc > 2:1281301/1‑140 (MQ=255) gagGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑cccccc > 2:1057675/1‑140 (MQ=255) agGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑cccccc‑‑‑c > 2:1339128/1‑140 (MQ=255) agGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑cc > 1:1027281/1‑135 (MQ=255) agGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑cc < 2:296574/135‑1 (MQ=255) agGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑cc > 1:296574/1‑135 (MQ=255) agGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑cc < 2:1027281/135‑1 (MQ=255) tattTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑cccccc‑‑‑cccagg < 2:255782/140‑6 (MQ=255) tattTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑cccccc‑‑‑cccagg > 2:229304/1‑135 (MQ=255) ttttAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGATTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑cccccc‑‑‑cccaggct > 2:1179153/1‑133 (MQ=255) ttCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGc < 1:1057675/140‑1 (MQ=255) tCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCCCCCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGc < 2:109346/140‑1 (MQ=255) tCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGca < 1:1284966/140‑1 (MQ=255) cGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGC‑‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACAtt < 2:914595/140‑1 (MQ=255) gACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACAtt < 1:886740/140‑1 (MQ=255) gACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACAtt < 1:948244/140‑1 (MQ=255) gACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACAtt < 1:1339128/140‑1 (MQ=255) cAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTg > 2:877473/1‑140 (MQ=255) aGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGt < 1:296835/140‑1 (MQ=255) gggCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGC‑TTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTaa < 1:998269/140‑1 (MQ=255) ggCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTaa > 1:75499/1‑140 (MQ=255) ggCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTaa < 1:877473/140‑1 (MQ=255) tGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGt > 2:391348/1‑140 (MQ=255) tATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTAccgc > 2:825913/1‑140 (MQ=255) tCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTAccgccg < 1:391348/140‑1 (MQ=255) tCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTAccgccg < 2:75499/140‑1 (MQ=255) cTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACcgccgc > 2:1028215/1‑140 (MQ=255) cAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCtttt < 2:1002103/140‑1 (MQ=255) gagTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCa > 2:1009443/1‑140 (MQ=255) agTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAg < 1:1009443/140‑1 (MQ=255) tCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCa > 2:938586/1‑140 (MQ=255) cgGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTc > 2:525586/1‑140 (MQ=255) ggCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTcg < 1:754931/140‑1 (MQ=255) gCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑CCCCCCCCACAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTcg < 1:369707/140‑1 (MQ=255) cTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACAGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTcgcg < 1:1281301/140‑1 (MQ=255) aCAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGcc < 1:1179153/140‑1 (MQ=255) aaaCATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCa < 1:525586/140‑1 (MQ=255) aaCATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCAt < 1:737904/140‑1 (MQ=255) aaCATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCAt < 1:408402/140‑1 (MQ=255) ttGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTa > 1:1037186/1‑140 (MQ=255) tGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTaa > 2:65661/1‑140 (MQ=255) tGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTaa > 1:807979/1‑140 (MQ=255) ccAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATg < 1:825913/140‑1 (MQ=255) aaCTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTg < 1:65661/140‑1 (MQ=255) aaCTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTg > 1:446919/1‑140 (MQ=255) aaCTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTg < 1:436852/140‑1 (MQ=255) aaCTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTg > 1:1067002/1‑140 (MQ=255) ctgGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTg > 1:12405/1‑140 (MQ=255) ctgGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTg > 1:1079577/1‑140 (MQ=255) cTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTc > 1:876042/1‑140 (MQ=255) tttttCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGcc < 2:1079577/140‑1 (MQ=255) ttttCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGCCt < 2:1228949/140‑1 (MQ=255) ttCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGCCTGa < 2:807979/140‑1 (MQ=255) tCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGCCTGATTCACt < 2:11715/140‑1 (MQ=255) tCGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGAACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGCCTGATTCACt > 2:1211217/1‑140 (MQ=255) cGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGcc > 2:244186/1‑130 (MQ=255) cGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGcc < 1:244186/130‑1 (MQ=255) cGGTTTGGATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGCCTGATTCACTa > 2:2816/1‑140 (MQ=255) ggATTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGCAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCTCCCATTTCATTAATGCTCTCCTGTAAAATTCCACCCATTGCCTGATTCACTAATTGcc > 2:946416/1‑139 (MQ=255) aTTGAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGCCTGATTCACTAATTGCTgg < 1:911478/140‑1 (MQ=255) gAGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGCCTGATTCACTAATTGCTGGCCt > 2:351396/1‑140 (MQ=255) aGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGCCTGATTCACTAATTGCTGGCCtt > 1:1210557/1‑140 (MQ=255) aGGATTGCAGCC‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGCCTGATTCACTAATTGCTGGCCtt < 2:1067002/140‑1 (MQ=255) || ATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑‑‑CCCCCC‑‑‑CAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGCCTGATTCACTAATTGCTGGCCTT > NC_000913/3100896‑3101160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |