New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 377329 = | NA (NA) | intergenic (+18/+206) | yaiL/frmB | DUF2058 domain‑containing protein YaiL/S‑formylglutathione hydrolase FrmB |
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CCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGC > NC_000913/377190‑377467 | gccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaacgcgtcttatcagacctacaaattctcacgccatccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcg < 2:697072‑M2/1‑1 (MQ=255) gATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCa < 2:365576/140‑1 (MQ=255) gATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCa < 1:1188021/140‑1 (MQ=255) gataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaacgcgtcttatcagacctacaaattctcacgccatccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcagtcgtgcGCAGa > 1:697072‑M2/136‑140 (MQ=255) aaaaTTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGAt > 2:203509/1‑140 (MQ=255) aaaaTTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGAt > 2:174610/1‑140 (MQ=255) aaaaTTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGAt > 2:1113449/1‑140 (MQ=255) aaaaTTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGAt > 1:583366/1‑140 (MQ=255) aaaTTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATg > 1:113083/1‑140 (MQ=255) aaTTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATTCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGc > 1:980827/1‑140 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1:915671/140‑1 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCg < 2:803668/140‑1 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCg > 1:803668/1‑140 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCg < 1:659955/140‑1 (MQ=255) tttatcgcatccggcagtcgtgtGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGa < 1:406050‑M2/117‑1 (MQ=255) gTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCg < 2:615917/137‑1 (MQ=255) cATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTg > 1:101335/1‑140 (MQ=255) cATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTg < 1:33566/140‑1 (MQ=255) aTAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCg < 2:370586/131‑1 (MQ=255) aTAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGcgcg > 1:1059332/1‑139 (MQ=255) aTAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGt < 2:709311/140‑1 (MQ=255) tcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTAt > 1:897293‑M2/7‑140 (MQ=255) tcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTAt > 2:260482‑M2/7‑140 (MQ=255) tcgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGA‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTAt > 2:497300‑M2/7‑140 (MQ=255) cgtgcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATc > 1:937986‑M2/6‑140 (MQ=255) gcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAgg > 1:715298‑M2/3‑140 (MQ=255) gcGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAgg > 1:352833‑M2/3‑140 (MQ=255) cgcAGATGCCTGAGGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGC‑TAACGCGTCTTATCAGGc < 2:12831/140‑1 (MQ=17) | CCGATAAAATTGCTCAGCGCGATGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTAC‑GGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGC > NC_000913/377190‑377467 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |