Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,165,444 | A→G | A602A (GCA→GCG) Q6R (CAG→CGG) |
btuB → murI → |
cobalamin/cobinamide outer membrane transporter glutamate racemase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,165,444 | 0 | A | G | 98.3% | 414.9 / ‑2.9 | 120 | A602A (GCA→GCG) Q6R (CAG→CGG) | btuB murI | cobalamin/cobinamide outer membrane transporter glutamate racemase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (50/68); total (51/69) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
AAACCGTTAAAATGGGCGGTGTGAGCTTGTGGGATCTTGCGGTTGCGTATCCGGTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTT > NC_000913/4165308‑4165578 | aaaCCGTTAAAATGGGCGGTGTGAGCTTGTGGGATCTTGCGGTTGCGTATCCGGTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCGGGa < 1:79483/140‑1 (MQ=255) aaaCCGTTAAAATGGGCGGTGTGAGCTTGTGGGATCTTGCGGTTGCGTATCCGGTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCGGGa < 1:441946/140‑1 (MQ=255) aaaCCGTTAAAATGGGCGGTGTGAGCTTGTGGGATCTTGCGGTTGCGTATCCGGTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCGGGa < 1:941083/140‑1 (MQ=255) aaaCCGTTAAAATGGGCGGTGTGAGCTTGTGGGATCTTGCGGTTGCGTATCCGGTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCGGGa < 1:1104242/140‑1 (MQ=255) 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1:933035/140‑1 (MQ=255) cAGTCTATGGCTACCAAACTGCGGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTAcc > 2:403392/1‑140 (MQ=255) aGTCTATGGCTACCAAACTGCGGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCg > 1:507918/1‑140 (MQ=255) tCTATGGCTACCAAACTGCGGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGa < 2:1019191/140‑1 (MQ=255) cTATGGCTACCAAACTGCGGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGGCTCCGGCGTCGGTGGGTTGACGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGAt < 1:146470/140‑1 (MQ=255) cTATGGCTACCAAACTGCGGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGAt < 2:507918/140‑1 (MQ=255) cTATGGCTACCAAACTGCGGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGAt < 1:1240077/140‑1 (MQ=255) tATGGCTACCAAACTGCGGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGAtc > 1:1294544/1‑140 (MQ=255) cTACCAAACTGCGGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCAt > 2:1237761/1‑140 (MQ=255) ccAAACTGCGGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTAc > 2:705751/1‑140 (MQ=255) ccAAACTGCGGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTAc > 1:550155/1‑140 (MQ=255) ccAAACTGCGGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTAc > 1:1310658/1‑140 (MQ=255) ccAAACTGCGGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTAc > 2:280854/1‑140 (MQ=255) aCTGCGGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACAttt < 2:1287027/140‑1 (MQ=255) | AAACCGTTAAAATGGGCGGTGTGAGCTTGTGGGATCTTGCGGTTGCGTATCCGGTCACCTCTCACCTGACAGTTCGTGGTAAAATAGCCAACCTGTTCGACAAAGATTATGAGACAGTCTATGGCTACCAAACTGCAGGACGGGAATACACCTTGTCTGGCAGCTACACCTTCTGAACCACGTCCCACCGTGCTGGTGTTTGACTCCGGCGTCGGTGGGTTGTCGGTCTATGACGAGATCCGGCATCTCTTACCGGATCTCCATTACATTT > NC_000913/4165308‑4165578 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |