| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 658,555 | G→A | pseudogene (525/788 nt) | ybeM → | deamidated glutathione amidase, N‑terminal fragment |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 658,555 | 0 | G | A | 98.9% | 326.2 / ‑4.5 | 94 | pseudogene (525/788 nt) | ybeM | deamidated glutathione amidase, N‑terminal fragment |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (40/53); total (40/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-01 | |||||||||||
AATCGCTCCGTTACTGGAGGTGGAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCGGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCGGATTATAGATCCCTTTGGCGTC > NC_000913/658419‑658689 | aaTCGCTCCGTTACTGGAGGTGGAAGGGATGAAGGGCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGc > 2:1317066/1‑140 (MQ=255) cGCTCCGTTACTGGAGGTGGAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGc > 2:383855/1‑140 (MQ=255) tCCGTTACTGGAGGTGGAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCa < 1:1317066/140‑1 (MQ=255) tGGAGGTGGAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCAt < 2:109954/140‑1 (MQ=255) gAGGTGGAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCa < 2:1252376/140‑1 (MQ=255) gAGGTGGAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCa > 2:79912/1‑140 (MQ=255) ggTGGAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACt > 2:1292654/1‑140 (MQ=255) gTGGAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGTAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGCTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTg < 1:536930/140‑1 (MQ=255) gTGGAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTg > 1:759307/1‑140 (MQ=255) gTGGAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTg > 2:228399/1‑140 (MQ=255) tGGAATGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCa > 1:736252/1‑126 (MQ=255) tGGAATGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCa < 2:736252/126‑1 (MQ=255) tGGAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTgg > 1:1223285/1‑140 (MQ=255) tGGAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTgg > 1:308333/1‑140 (MQ=255) tGGAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGCTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTgg > 2:1143982/1‑140 (MQ=255) ggAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGt > 2:883778/1‑140 (MQ=255) ggAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGt > 1:1232216/1‑140 (MQ=255) ggAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGt > 2:23251/1‑140 (MQ=255) aaGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCa > 1:726375/1‑140 (MQ=255) ggATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACg > 1:827818/1‑140 (MQ=255) gATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGt < 1:84631/140‑1 (MQ=255) gATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGt < 1:383855/140‑1 (MQ=255) cggtcTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAAAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCg > 1:1079989/1‑140 (MQ=255) ggtcTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCa > 2:1163105/1‑126 (MQ=255) ggtcTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCa < 1:1163105/126‑1 (MQ=255) ggtcTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGc > 1:715331/1‑140 (MQ=255) tcTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTc < 1:713538/140‑1 (MQ=255) tcTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTc < 2:827818/140‑1 (MQ=255) gatgaCCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTg < 1:883778/140‑1 (MQ=255) atgaCCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAGGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTgc < 2:939621/140‑1 (MQ=255) tgaCCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTgcg < 2:715331/140‑1 (MQ=255) tgaCCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTgcg < 2:726375/140‑1 (MQ=255) tgaCCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTgcg < 1:228399/140‑1 (MQ=255) tgaCCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTgcg < 1:1292654/140‑1 (MQ=255) gaCCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTgcgc < 1:1143982/140‑1 (MQ=255) gaCCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTgcgc < 1:1280646/140‑1 (MQ=255) cTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTgg < 2:1220036/140‑1 (MQ=255) tGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGt < 2:1076775/132‑1 (MQ=255) tGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGt > 1:1076775/1‑132 (MQ=255) tGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGa < 1:1185839/140‑1 (MQ=255) tGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGa > 1:887312/1‑140 (MQ=255) tGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGa > 1:429947/1‑140 (MQ=255) tGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGa > 1:334077/1‑140 (MQ=255) tATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCGGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCACGTGCGCTGGATac < 2:49240/140‑1 (MQ=255) tATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATac < 2:759307/140‑1 (MQ=255) tATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATac < 1:23251/140‑1 (MQ=255) tATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATac < 2:1059109/140‑1 (MQ=255) aTGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATacc < 2:887312/140‑1 (MQ=255) aTGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATacc < 2:1232216/140‑1 (MQ=255) aTGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATacc < 2:334077/140‑1 (MQ=255) gACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATaccac < 1:719376/140‑1 (MQ=255) aCTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATaccacc > 1:961220/1‑140 (MQ=255) tACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGt < 1:152395/122‑1 (MQ=255) tACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGt > 2:152395/1‑122 (MQ=255) tACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGt > 1:317127/1‑140 (MQ=255) cGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATac > 2:722373/1‑131 (MQ=255) cGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATac < 1:722373/131‑1 (MQ=255) cGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTta > 1:929680/1‑140 (MQ=255) cGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTta > 2:780007/1‑140 (MQ=255) ccAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATAtggt < 1:1246753/140‑1 (MQ=255) ccAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATAtggt < 2:317127/140‑1 (MQ=255) agagCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATAtggtgg < 2:961220/140‑1 (MQ=255) agagCTGGCGCTGGCACAGCCATTACAGTGAGCTGAAATCCTGGTACTGCCTGCCGCCGGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCTCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATAtggtgg < 2:804630/140‑1 (MQ=255) agCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTggcg > 1:507142/1‑140 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1:780007/140‑1 (MQ=255) tACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACaaa < 2:1223285/140‑1 (MQ=255) tACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACaaa < 2:308333/140‑1 (MQ=255) ggAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAatat > 1:970341/1‑140 (MQ=255) gAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGTGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGc < 2:1182061/125‑1 (MQ=255) gAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGc > 1:1182061/1‑125 (MQ=255) gAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATc > 1:1139312/1‑140 (MQ=255) cTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGt > 1:193924/1‑140 (MQ=255) tCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGc < 1:572950/140‑1 (MQ=255) tCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGc > 1:887510/1‑140 (MQ=255) cTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCg < 2:429947/140‑1 (MQ=255) cTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCg < 1:890417/140‑1 (MQ=255) tCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAg > 1:337304/1‑129 (MQ=255) tCCTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAg < 2:337304/129‑1 (MQ=255) ccTGCCGCCTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCGGATTATAGa > 2:519317/1‑140 (MQ=255) cgccTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCGGATTATAGATCCCt < 1:174626/140‑1 (MQ=255) cgccTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCGGATTATAGATCCCt < 2:887510/140‑1 (MQ=255) ccTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCGGATTATAGATCCCttt > 1:844805/1‑140 (MQ=255) cTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCGCCTGTTATATGGAGGCGGCGGGGGAGGGCGGGAACAAAAATACAGGTCAAAGCCGGATTATAGATCCCTTTg > 2:1075586/1‑140 (MQ=255) cTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCg < 2:623992/123‑1 (MQ=255) cTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCg > 1:623992/1‑123 (MQ=255) cTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCGGATtata > 1:145193/1‑130 (MQ=255) cTGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCGGATtata < 2:145193/130‑1 (MQ=255) tGGGTTCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCGGATTATAGATCCCTTTgg < 2:970341/140‑1 (MQ=255) ttCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCGGATTATAGATCCCTTTGGCGTc < 1:301153/140‑1 (MQ=255) ttCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCGGATTATAGATCCCTTTGGCGTc < 2:929680/140‑1 (MQ=255) ttCGCAGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCGGATTATAGATCCCTTTGGCGTc < 2:1139312/140‑1 (MQ=255) | AATCGCTCCGTTACTGGAGGTGGAAGGGATGAAGGTCGGTCTGATGACCTGTTATGACTTACGCTTTCCAGAGCTGGCGCTGGCACAGGCATTACAGGGAGCTGAAATCCTGGTACTTCCTGCCGCCTGGGTTCGCGGGCCGCTCAAAGAGCATCACTGGTCAACGTTGCTTGCCGCTCGTGCGCTGGATACCACCTGTTATATGGTGGCGGCGGGGGAGTGCGGGAACAAAAATATCGGTCAAAGCCGGATTATAGATCCCTTTGGCGTC > NC_000913/658419‑658689 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |