| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 377351 = | NA (NA) | noncoding (16/37 nt) | other | REP32a | |||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
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aggtgaatcgcgactgatacattgccagccgcgtaatcagaactatttaatgactgcctacgggcgaaatgtaggccggacaagacgtttatcgcatccggcagtcgtgtgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTc > 2:697770‑M2/133‑140 (MQ=255) ttGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTA‑ACGCGTCTTATCAGGcc > 1:830233/1‑140 (MQ=255) tGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGcc > 2:294460/1‑140 (MQ=255) cacaGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGcc > 1:478050/1‑138 (MQ=255) cacaGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTa < 2:472648/140‑1 (MQ=255) actgatacattgccagccgcgtaatcagaactatttaatgactgcctacgggcgaaatgtaggccggacaagacgtttatcgcatccggcagtcgtgcgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTa > 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ttatcaggcctacaaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGcttacgg < 1:684481‑M1/60‑4 (MQ=255) ttatcaggcctacaaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTtac < 1:339310‑M1/58‑2 (MQ=255) aggcctacaaattctcgcgccacccgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAA‑CGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAgg < 2:20660‑M1/81‑1 (MQ=255) tgactgcctacgggcgaaatgtaggccggacaagacgtttatcgcatccggcagtcgtgtgcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGGCCTGATaa > 2:384959‑M2/83‑132 (MQ=255) caaattcccgcgccatccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCa < 2:412870‑M1/88‑1 (MQ=255) gTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgc > 1:680933/1‑140 (MQ=255) 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cgcAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGC‑TAACGCGTCTTATCAgac > 2:700278/1‑138 (MQ=17) cgcAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGc < 2:411873/140‑1 (MQ=255) gcagatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGcc > 2:91276‑M2/23‑140 (MQ=255) agatgcctgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTa < 1:716927‑M2/120‑1 (MQ=255) tgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTa < 1:515452‑M2/127‑1 (MQ=255) tgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTa < 2:66659‑M2/127‑1 (MQ=255) tgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTa < 2:553031‑M2/127‑1 (MQ=255) tgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTa < 1:377482‑M2/127‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:91276‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:41898‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:511531‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:48704‑M2/128‑1 (MQ=255) atgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACg > 1:200877‑M2/12‑140 (MQ=255) tgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACgg < 2:85811‑M2/130‑1 (MQ=255) gacgctaTGCGCGTCTTACCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCg < 2:269175‑M2/133‑1 (MQ=255) | AGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGT > NC_000913/377216‑377489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |