Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_000913	1635352–1635371	1635462	92–111	13 [10]	[10] 11	ydfN	Qin prophage; putative side tail fiber assembly protein

ACTCTTGTGTTGGTGCGCACCGGCACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTGGTTCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTCCGTCCCCAAATCCGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTGTGCGATTTAATGCCGTCCTGTTCCT  >  NC_000913/1635212‑1635387                                                                                                                                            |                                     aCTCTTGTGTTGGTGCGCACCGGCACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATgcgctgg                                      <  1:656459/140‑1 (MQ=18) aCTCTTGTGTTGGTGCGCACCGGCACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATgcgctgg                                      <  1:77928/140‑1 (MQ=18) aCTCTTGTGTTGGTGCGCACCGGCACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATgcgctgg                                      <  2:122716/140‑1 (MQ=18)     ttGTGTTGGTGCGCACCGGCACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATgcgctggcgct                                  <  1:295206/140‑1 (MQ=18)          ttGGTGCGCACCGGCACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATgcgctggcg                                    >  1:380061/1‑133 (MQ=255)          ttGGTGCGCACCGGCACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATgcgctggcg                                    <  2:380061/133‑1 (MQ=255)          ttGGTGCGCACCGGCACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTggg                             >  2:240401/1‑140 (MQ=255)                  cACCGGCACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTATGCgct                     >  2:491578/1‑138 (MQ=14)                        cACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACAACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTATGCGATTTAATg               <  2:65374/140‑1 (MQ=14)                               tGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTATGCGATTTAATGCCGTCCt        <  1:812050/140‑1 (MQ=11)                                 cGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTATGCGATTTAATGCCGTCCTGt      >  1:193504/1‑140 (MQ=11)                                     cccGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTATGCGATTTAATGCCGTCCTGTTCCt  <  1:240401/140‑1 (MQ=1)                                     cccGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTAGTGCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTTCGTCCCCAAATCTGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTATGCGATTTAATGCCGTCCTGTTCCt  >  1:400921/1‑140 (MQ=11)                                                                                                                                            |                                     ACTCTTGTGTTGGTGCGCACCGGCACTATTTGCGGTCCCGCTAATACTATGGGTATGCGCCCCGGTGTTATTCGTGGATTTGGTTCCGTAATCAAACGACGATGTGGTTTCCGTCCCCAAATCCGTACTGGATGCGCTGGCGCTGTGGGTGTGCGATTTAATGCCGTCCTGTTCCT  >  NC_000913/1635212‑1635387

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑