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Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
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tgatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTa < 2:1136483‑M2/127‑1 (MQ=255) tgatgcgacgcta‑ACGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:1030587‑M2/127‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:905209‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:1394295‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:854668‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:466849‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:21618‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:1278088‑M2/128‑1 (MQ=255) gatgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTAGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:1011066‑M2/128‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGC‑TAACGCGTCTTATCAGACTTAcaaattct < 2:1558181/140‑8 (MQ=14) atgcgacgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCGCGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:58370‑M2/128‑1 (MQ=255) acgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGa > 1:1006968‑M2/7‑140 (MQ=255) cgctaTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGaa < 2:932750‑M2/135‑1 (MQ=255) | TGCCAGCAGTATAGTGTTGCACAGCGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAT‑GGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAA > NC_000913/377212‑377485 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |