Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,326,450 | 0 | T | G | 28.9% | 150.7 / 47.0 | 83 | G114G (GGT→GGG) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/56); new base G (24/0); total (27/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.38e-18 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGA > NC_000913/2326312‑2326586 | ggCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTa < 1:358735/140‑1 (MQ=255) ggCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTa < 1:1485319/140‑1 (MQ=255) cACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATg < 2:238848/140‑1 (MQ=255) ttAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGaaaa > 1:1540258/1‑140 (MQ=255) ttAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGaaaa > 1:643525/1‑140 (MQ=255) aaaaGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAatat < 2:131316/140‑1 (MQ=255) gCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAGAATATG‑AGt < 1:272446/140‑1 (MQ=255) cGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGtt < 1:302527/140‑1 (MQ=255) ggCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑a > 2:1536743/1‑135 (MQ=255) ggCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑a < 1:1536743/135‑1 (MQ=255) ggCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTa > 1:1446714/1‑140 (MQ=255) ggCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAAAATG‑AGtttt > 1:341754/1‑139 (MQ=255) ggCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATG‑AGgttt > 1:522143/1‑139 (MQ=255) cTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGc < 1:1602793/140‑1 (MQ=255) cTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGc < 1:1149903/140‑1 (MQ=255) tGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGcc < 1:1258036/140‑1 (MQ=255) tGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTATTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCGGGCAGGTCGGGCGCAGGGCATTGTGGCGGAGGGTATGGAAAAGATG‑AGTTTAGcc < 2:128458/140‑1 (MQ=255) ggCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGccc < 1:1463310/140‑1 (MQ=255) ggCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGccc < 2:173430/140‑1 (MQ=255) tgCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCtacttact > 1:6552/1‑137 (MQ=255) tgCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCtacttact < 2:6552/137‑1 (MQ=255) cGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTTTTGAAAAGATGTGGTTTATCCCCCT‑CTTTCTCGGTg > 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cACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAAAATG‑AGTTTAGCCCCCCACTTACTCGATGCaaaaa > 2:1407516/1‑139 (MQ=255) gTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACg < 1:189713/140‑1 (MQ=255) gTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACg < 1:1407516/140‑1 (MQ=255) tCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGc < 2:1226979/140‑1 (MQ=255) aaTAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGctc < 1:891885/140‑1 (MQ=255) tAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAAAATG‑AGTTTAGCCCCCCACTTACTCGATGCAAAAACACGCTCTg > 2:1105948/1‑140 (MQ=255) aTGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATc > 1:1289481/1‑140 (MQ=255) gtgGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATG‑AGTTTAGCCCCCCCCTTACTCGGTGCAAAAACACCCCCTGGtttttgt > 1:799965/1‑135 (MQ=255) gtgGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCCACTTTCTCGATGCAAAAGCACGCCCTGGTTATTGt > 2:1418110/1‑140 (MQ=255) tgGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTc < 1:477970/140‑1 (MQ=255) ggTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCt < 1:32658/140‑1 (MQ=255) ggTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAAAATG‑AGGTTAGCCCCCCACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGGTATCGTCt > 2:639412/1‑140 (MQ=255) gTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAAAATG‑AGGTTTGCCCCCCACTTACTCGATGCAAAAACACGCTCTGGTTTTCGTCtt > 1:1047351/1‑140 (MQ=255) cGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGga < 2:1077288/140‑1 (MQ=255) cGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGAAAAAATG‑AGTTTTGCCCCCCACTTTCTCGATGCAAAAACACGCCCTGGGTATCGTCTTggg > 2:1538956/1‑139 (MQ=255) gggTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGAAAATATG‑AGGTTAGCCCCCCACTTACTCGATGCCAAAACACGCTCTGGTTATCGTCTTGgag > 2:148691/1‑140 (MQ=255) gggTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGgag > 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ttAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGa < 2:1576912/140‑1 (MQ=255) tgtgGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGAAAAAATG‑GGGTTATCCCCCCACTTTCTCCATGCAAAAACACGCCCTGGGTATCGTCTTGGGGACGGACAGGttt > 2:331931/1‑140 (MQ=255) tgtgGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAAAATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTTCTCGATGCAAAAACACGCCCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGgtt > 2:424726/1‑140 (MQ=255) gtgGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTa < 2:972266/140‑1 (MQ=255) gtgGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTa < 1:148691/140‑1 (MQ=255) tgGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGGAAAAATG‑AAGTTAGCCCCCTCCCTTCTCGCTGCAAAAGCACGCTCTGGGTATCGGCTTGGAGGCGGAAAGGGTTAt > 2:638574/1‑140 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ggTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGAtgtg < 2:1289481/140‑1 (MQ=255) ggTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAAAATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCCCTGGGTTTCGTCTTTGAGACGGACAGGGTTATTACGTAATCCTCCGCGGTGGCCTGAtgtg > 2:691058/1‑140 (MQ=255) gTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTgc < 2:522143/140‑1 (MQ=255) gTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTgc > 2:879073/1‑140 (MQ=255) tCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTgcg < 2:642649/140‑1 (MQ=255) tCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTgcg < 1:639412/140‑1 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1:638574/140‑1 (MQ=255) cgcAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCAcc < 1:692009/140‑1 (MQ=255) cgcAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAAAATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCAcc > 2:634628/1‑140 (MQ=255) gcAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCAccc < 1:1538956/140‑1 (MQ=255) cAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCa < 1:1417753/140‑1 (MQ=255) cAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCa < 1:1235531/140‑1 (MQ=255) cAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCa < 2:483901/140‑1 (MQ=255) cAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCa < 1:1100036/140‑1 (MQ=255) cAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCa < 1:691058/140‑1 (MQ=255) cAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCa < 1:879073/140‑1 (MQ=255) gagCATTGTGGCGGGGGGTTTGGAAAATATG‑AGATTAGCCCCCAACTTCCTCGATGCAAAACAACCCTCCTGTTTTAGTCTTGGAGGCGGGCAGGGTTTTGACGTAATCCTTCGCGATGGCCTGTTGTGCGCCAccccta > 2:332780/1‑137 (MQ=255) agCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATgg < 1:940437/140‑1 (MQ=255) cATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGtt < 1:1329378/140‑1 (MQ=255) cATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCCACTTACTCGATGCAAAAGCACGCCCTGGTTATCGTCTTGGGGACGGACAGGGTTTTGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTTATGTGCGCCCCCCATGGtt > 2:692009/1‑140 (MQ=255) ttGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTAt < 1:252210/140‑1 (MQ=255) ttGTGGCGGGGGGGATGGAAAAAATG‑AGTTTAGCCCCCCACTTACTCGATGCAAAAACACGCTCTGGTTATCGTCTTTGAGACGGACAGGGTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGGTGTGCGCCCCCCATGGTTAt > 2:1235531/1‑140 (MQ=255) tgtgGCGGGGGGGATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCCCCTTACTCCATGCAAAAACACGCCCCTGTTATCGTCTTTGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTCCGCGATGGGCCGATGTGCGCCACCCATGGGTAtt > 2:652177/1‑139 (MQ=255) gggTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGa < 1:1105948/140‑1 (MQ=255) | GGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATG‑AGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGACGGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGA > NC_000913/2326312‑2326586 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |